基于网络药理学和分子对接研究淫羊藿治疗抑郁症的抗炎作用机制
发布时间:2021-10-01 04:40
目的:采用网络药理学方法预测淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点及相关信号通路,探讨其抗抑郁作用的潜在机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集和筛选淫羊藿的活性成分;利用PharmMapper服务器,TCMSP数据库对蛋白靶点进行预测和筛选;利用OMIM数据库,CTD数据库和GeneCards数据库筛选抑郁症的相关靶点以及抗炎靶点;通过DAVID数据库对关键抗炎靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.6.0软件构建淫羊藿"活性成分-作用靶点-信号通路"网络图,并对网络拓扑结构分析;采用GOLD分子对接软件对活性成分与关键抗炎靶点进行结果验证。结果:筛选得到淫羊藿与抑郁症相关的12个活性成分,30个作用靶点,5个关键抗炎靶点;GO功能富集得到生物过程65个,细胞组成4个,分子功能1个,KEGG通路富集分析得到41条,其中与炎症相关的信号通路9个;分子对接验证淫羊藿苷与关键抗炎靶点能够形成最佳复合体。结论:揭示了淫羊藿通过抗炎靶点及其相关信号通路网络作用于抑郁症的分子机制,为进一步研究淫羊藿抗抑郁作...
【文章来源】:中国实验方剂学杂志. 2020,26(17)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
关键抗炎靶点蛋白相互作用网络
关键抗炎靶点GO富集分析柱状
将上述所得活性成分、作用靶点以及信号通路同导入Cytoscape软件进行可视化处理构建活性成分-作用靶点-信号通路网络图。该网络图中共83个节点,224条边,其中30个菱形节点为作用靶点(橙色为淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点,绿色为非抗炎靶点),12个六边形节点代表活性成分,41个圆形节点表示共有抗炎靶点信号通路。淫羊藿的作用靶点蛋白有IL-1β,IL-2,IL-6,IL-10,TNF,MAPK1等。网络图中节点以不同形状和颜色代表淫羊藿的活性成分,作用靶点和信号通路,两节点之间的连线表示活性成分和作用靶点之间的相互作用。从图中可知,一个活性成分不只是对应一个作用靶点,一个作用靶点也可对应一个或多个活性成分,网络图充分体现了淫羊藿多成分、多靶点的相互作用的特征。见图5。图5 成分-靶点-通路网络
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于网络药理学研究栀子入血成分抗阿尔茨海默病的作用机制[J]. 张锐,张季林,李冰涛,花昌林,刘芮祺. 中国中药杂志. 2020(11)
[2]基于网络药理学探讨加味二至丸治疗动脉粥样硬化的作用机制[J]. 欧阳效强,饶炼,雷敏,陈晓坤,洪创雄. 中国实验方剂学杂志. 2020(03)
[3]网络药理学在中药领域中的研究进展与应用策略[J]. 解静,高杉,李琳,徐一兰,高树明,于春泉. 中草药. 2019(10)
[4]基于网络药理学葛根解热作用机制研究[J]. 李冰涛,翟兴英,李佳,涂珺,张启云,徐国良,黄丽萍,邵峰,朱卫丰,刘荣华. 药学学报. 2019(08)
[5]神经营养因子假说与抑郁症发病机制的研究进展[J]. 王娜,黄芹,鲍天昊,罗诚,周莉. 四川精神卫生. 2019(01)
[6]基于网络药理学分析厚朴抗抑郁的物质基础及其作用机制[J]. 王欢欢,吴宏伟,李欣,张晓,许静,郭非非,张红,范建伟,杨洪军. 中国实验方剂学杂志. 2019(10)
[7]抗抑郁药物的不良反应[J]. 朱建峰,金卫东. 医药导报. 2018(10)
[8]淫羊藿苷对慢性不可预知温和刺激诱导的大鼠抑郁行为和神经递质水平的影响[J]. 张聪,卢慧勤,胡楚璇,梅清华,张霞,黄晓玲. 中国药学杂志. 2018(15)
[9]抑郁症的炎症机制及诊疗新策略[J]. 苏文君,曹志永,蒋春雷. 生理学报. 2017(05)
[10]TLR4信号通路与抑郁症的研究进展[J]. 汪露,陈晋东. 中南大学学报(医学版). 2017(06)
博士论文
[1]利用网络药理学方法探讨连夏宁心方治疗冠心病痰热证药理学机制的临床与基础研究[D]. 杨阳.北京中医药大学 2019
[2]百合地黄汤对CUMS抑郁模型大鼠的作用及机理研究[D]. 薛剑.黑龙江中医药大学 2018
[3]白介素-10抑制神经炎症和多巴胺能神经元凋亡的研究[D]. 朱燕.苏州大学 2016
硕士论文
[1]苦豆根中抗抑郁物质基础与分子机制研究[D]. 肖东.宁夏医科大学 2019
[2]基于网络药理学的复方中药止颤粉治疗帕金森病作用机制研究[D]. 齐心畅.吉林大学 2018
[3]皮质酮启动增强小胶质细胞免疫炎症机制初探及淫羊藿黄酮类成分干预研究[D]. 邵丽飞.南京大学 2017
本文编号:3417173
【文章来源】:中国实验方剂学杂志. 2020,26(17)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
关键抗炎靶点蛋白相互作用网络
关键抗炎靶点GO富集分析柱状
将上述所得活性成分、作用靶点以及信号通路同导入Cytoscape软件进行可视化处理构建活性成分-作用靶点-信号通路网络图。该网络图中共83个节点,224条边,其中30个菱形节点为作用靶点(橙色为淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点,绿色为非抗炎靶点),12个六边形节点代表活性成分,41个圆形节点表示共有抗炎靶点信号通路。淫羊藿的作用靶点蛋白有IL-1β,IL-2,IL-6,IL-10,TNF,MAPK1等。网络图中节点以不同形状和颜色代表淫羊藿的活性成分,作用靶点和信号通路,两节点之间的连线表示活性成分和作用靶点之间的相互作用。从图中可知,一个活性成分不只是对应一个作用靶点,一个作用靶点也可对应一个或多个活性成分,网络图充分体现了淫羊藿多成分、多靶点的相互作用的特征。见图5。图5 成分-靶点-通路网络
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于网络药理学研究栀子入血成分抗阿尔茨海默病的作用机制[J]. 张锐,张季林,李冰涛,花昌林,刘芮祺. 中国中药杂志. 2020(11)
[2]基于网络药理学探讨加味二至丸治疗动脉粥样硬化的作用机制[J]. 欧阳效强,饶炼,雷敏,陈晓坤,洪创雄. 中国实验方剂学杂志. 2020(03)
[3]网络药理学在中药领域中的研究进展与应用策略[J]. 解静,高杉,李琳,徐一兰,高树明,于春泉. 中草药. 2019(10)
[4]基于网络药理学葛根解热作用机制研究[J]. 李冰涛,翟兴英,李佳,涂珺,张启云,徐国良,黄丽萍,邵峰,朱卫丰,刘荣华. 药学学报. 2019(08)
[5]神经营养因子假说与抑郁症发病机制的研究进展[J]. 王娜,黄芹,鲍天昊,罗诚,周莉. 四川精神卫生. 2019(01)
[6]基于网络药理学分析厚朴抗抑郁的物质基础及其作用机制[J]. 王欢欢,吴宏伟,李欣,张晓,许静,郭非非,张红,范建伟,杨洪军. 中国实验方剂学杂志. 2019(10)
[7]抗抑郁药物的不良反应[J]. 朱建峰,金卫东. 医药导报. 2018(10)
[8]淫羊藿苷对慢性不可预知温和刺激诱导的大鼠抑郁行为和神经递质水平的影响[J]. 张聪,卢慧勤,胡楚璇,梅清华,张霞,黄晓玲. 中国药学杂志. 2018(15)
[9]抑郁症的炎症机制及诊疗新策略[J]. 苏文君,曹志永,蒋春雷. 生理学报. 2017(05)
[10]TLR4信号通路与抑郁症的研究进展[J]. 汪露,陈晋东. 中南大学学报(医学版). 2017(06)
博士论文
[1]利用网络药理学方法探讨连夏宁心方治疗冠心病痰热证药理学机制的临床与基础研究[D]. 杨阳.北京中医药大学 2019
[2]百合地黄汤对CUMS抑郁模型大鼠的作用及机理研究[D]. 薛剑.黑龙江中医药大学 2018
[3]白介素-10抑制神经炎症和多巴胺能神经元凋亡的研究[D]. 朱燕.苏州大学 2016
硕士论文
[1]苦豆根中抗抑郁物质基础与分子机制研究[D]. 肖东.宁夏医科大学 2019
[2]基于网络药理学的复方中药止颤粉治疗帕金森病作用机制研究[D]. 齐心畅.吉林大学 2018
[3]皮质酮启动增强小胶质细胞免疫炎症机制初探及淫羊藿黄酮类成分干预研究[D]. 邵丽飞.南京大学 2017
本文编号:3417173
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