基于网络药理学与分子对接探索血必净治疗新型冠状病毒感染所致的ARDS的分子机制

发布时间：2021-10-06 19:27

　　目的:采用网络药理学和分子对接探索血必净治疗新型冠状病毒（SARS-CoV-2）感染所致的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的分子机制。方法:从数据库中筛选ARDS差异基因及血必净的有效活性成分和靶点,然后对二者的共同靶点进行基因本体（GO）富集分析及基因组百科全书（KEGG）通路分析,应用STRING平台构建蛋白互作（PPI）网络模型,利用Cytoscape软件构建中药-活性化学成分-靶点-疾病网络图、靶点-富集通路网络图以筛选出核心化合物、靶点以及通路,最后对核心靶点和化合物通过分子对接进行初步验证。结果:得到ARDS差异表达基因349个,在血必净中共有125个主要活性成分和1 447个预测靶点,筛选出7个核心化合物,6个药物-疾病共同靶点,16条富集信号通路。分子对接结果显示血必净中的核心化合物与ACE2、SARS-CoV-2 3CL水解酶、AKT1、MAPK14具有较好的结合活性。结论:血必净可能通过调控AKT1、MAPK14、ACE2、VEGF信号通路、色氨酸代谢、C型凝集素信号通路等多靶点、多途径发挥对SARS-CoV-2导致的ARDS的治疗作用。 

【文章来源】：中药药理与临床. 2020,36(03)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

ARDS患者差异基因火山图

ARDS患者差异基因热图(前40个)

利用Perl软件对ARDS差异基因、药物预测靶点取交集,获得药物-疾病共同靶点,应用Cytoscape(3.7.2 )软件构建中药-活性化学成分-靶点-疾病网络图,见图3,在网络中有76个节点、80个边缘、70个活性成分和6个药物-疾病共同靶点有相互作用。使用network analyzer工具,分析网络中的拓扑参数,根据 degree值得到7个核心化学成分:山柰酚(MOL000422,kaempferol)、槲皮素(MOL000098,quercetin)、杨梅酮(MOL002135,Myricanone)、豆甾醇(MOL000449,Stigmasterol)、β-胡萝卜素(MOL002773,beta-carotene)、木犀草素(MOL000006,luteolin)、黄芩素(MOL002714,baicalein),主要集中在红花和丹参中,AKT1,MAPK14和PTGS2为血必净干预ARDS的主要靶点。2.5 PPI网络构建

【参考文献】：
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本文编号：3420609