基于网络药理学的土茯苓治疗痛风性肾病的作用机制研究
发布时间:2021-10-09 04:43
目的运用网络药理学筛选土茯苓的主要活性成分及其靶点,探究土茯苓治疗痛风性肾病(GN)的潜在作用机制。方法经中药系统药理学数据库与分析平台分析并结合相关文献筛选出土茯苓的主要活性成分及其潜在靶点,建立靶点数据;并通过在线人类孟德尔遗传数据库、人类基因数据库筛选出GN相关靶点;用Cytoscape 3. 7. 1软件构建"GN-基因-靶点-土茯苓"相关性网络可视化关系图;以蛋白互作网络分析数据库确立土茯苓与GN的蛋白互作网络;利用生物学信息注释数据库对相关靶点进行基因本体富集分析并以Cluster Profiler R包完成京都基因与基因组百科全书通路分析,了解土茯苓治疗GN可能的生物过程及其通路。结果从土茯苓中筛选15种活性成分,与GN有关的靶点19个,基因本体富集分析表明,这些靶点参与炎症反应、免疫反应、对过氧化氢的反应、调节细胞增殖、胶原分解代谢过程、血压调节等生物过程。京都基因与基因组百科全书路径结果表明,土茯苓作用于GN的关键靶点通过白细胞介素17信号通路、核因子κB信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等83个通路实现。结论本研究初步推测并验证了土茯苓治疗GN的主要靶基因和通路,为后续...
【文章来源】:中国医药. 2020,15(07)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
土茯苓靶点蛋白相互作用网络关系图
利用DAVID把19个潜在靶标分别进行功能富集分析,设置P>0.05,物种选择Homo sapiens,结果显示土茯苓的潜在靶标分别被富集在炎症反应、细胞对肿瘤坏死因子的反应、免疫反应、调节细胞增殖、细胞对IL-1的反应、细胞对脂多糖的反应、I-κB激酶/核因子κB信号转导的正调控、胶原分解代谢过程、细胞对过氧化氢的反应、血压调节等10个生物过程;细胞外空间、细胞外泌体、细胞质、细胞外基质、自噬体、细胞质囊泡等6条分子功能;血红素结合、金属内肽酶活性、前列腺素-内过氧化物合酶活性、白细胞介素1受体结合、过氧化物酶活性、转录激活子活性/RNA聚合酶Ⅱ远端增强子序列特异性结合、趋化因子活性、RNA聚合酶Ⅱ远端增强子序列特异性DNA结合等8条细胞组分。2.6 KEGG路径分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]IL-6、IL-17、TGF-β1与高血压模型大鼠肾纤维化的相关性[J]. 范婷婷,何非,王晓晨. 中国医学前沿杂志(电子版). 2019(07)
[2]白芍总苷对动脉粥样硬化大鼠TNF-α/P38MAPK/NF-κB/RBP4信号通路及其血清IL-17,IL-27,IL-33影响的研究[J]. 苏绍红,张琳,张俊峰. 新中医. 2019(07)
[3]基于网络药理学的川芎抗动脉粥样硬化的机制研究[J]. 田晋帆,吕树铮,宋现涛,李立志,刘玥. 中国医药. 2018(12)
[4]转录因子核因子-κB p65通过miR-17调控血管平滑肌细胞增殖的机制研究[J]. 段力仁,杨栋,张晶,林姝,赵琳,王仑,吕俊远,辛世杰. 中国血管外科杂志(电子版). 2017(02)
[5]高尿酸血症与初诊2型糖尿病患者hs-CRP和心率变异性的关系及干预研究[J]. 张桂玲,王宁,栾芳,魏巍,尹贺欣,刘静芹. 中国急救复苏与灾害医学杂志. 2017 (06)
[6]中西医结合治疗痛风性肾病45例疗效观察[J]. 魏升,伍云洲,蔡旭东,贺志良. 中国中医药科技. 2016(06)
本文编号:3425656
【文章来源】:中国医药. 2020,15(07)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
土茯苓靶点蛋白相互作用网络关系图
利用DAVID把19个潜在靶标分别进行功能富集分析,设置P>0.05,物种选择Homo sapiens,结果显示土茯苓的潜在靶标分别被富集在炎症反应、细胞对肿瘤坏死因子的反应、免疫反应、调节细胞增殖、细胞对IL-1的反应、细胞对脂多糖的反应、I-κB激酶/核因子κB信号转导的正调控、胶原分解代谢过程、细胞对过氧化氢的反应、血压调节等10个生物过程;细胞外空间、细胞外泌体、细胞质、细胞外基质、自噬体、细胞质囊泡等6条分子功能;血红素结合、金属内肽酶活性、前列腺素-内过氧化物合酶活性、白细胞介素1受体结合、过氧化物酶活性、转录激活子活性/RNA聚合酶Ⅱ远端增强子序列特异性结合、趋化因子活性、RNA聚合酶Ⅱ远端增强子序列特异性DNA结合等8条细胞组分。2.6 KEGG路径分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]IL-6、IL-17、TGF-β1与高血压模型大鼠肾纤维化的相关性[J]. 范婷婷,何非,王晓晨. 中国医学前沿杂志(电子版). 2019(07)
[2]白芍总苷对动脉粥样硬化大鼠TNF-α/P38MAPK/NF-κB/RBP4信号通路及其血清IL-17,IL-27,IL-33影响的研究[J]. 苏绍红,张琳,张俊峰. 新中医. 2019(07)
[3]基于网络药理学的川芎抗动脉粥样硬化的机制研究[J]. 田晋帆,吕树铮,宋现涛,李立志,刘玥. 中国医药. 2018(12)
[4]转录因子核因子-κB p65通过miR-17调控血管平滑肌细胞增殖的机制研究[J]. 段力仁,杨栋,张晶,林姝,赵琳,王仑,吕俊远,辛世杰. 中国血管外科杂志(电子版). 2017(02)
[5]高尿酸血症与初诊2型糖尿病患者hs-CRP和心率变异性的关系及干预研究[J]. 张桂玲,王宁,栾芳,魏巍,尹贺欣,刘静芹. 中国急救复苏与灾害医学杂志. 2017 (06)
[6]中西医结合治疗痛风性肾病45例疗效观察[J]. 魏升,伍云洲,蔡旭东,贺志良. 中国中医药科技. 2016(06)
本文编号:3425656
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