基于网络药理学的西红花治疗动脉粥样硬化作用机制探讨
发布时间:2021-11-21 15:59
目的:基于网络药理学方法探究西红花对治疗动脉粥样硬化的潜在作用靶点。方法:运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选西红花有效成分的作用靶点;运用GeneCards、OMIM数据库筛选动脉粥样硬化的药物靶点构建疾病靶点网络,进而构建药物-成分-疾病-靶点的网络图并进行蛋白质网络互作、GO功能分析、KEGG通路等分析。运用AutoDock对有效成分和关键靶点进行分子对接。结果:选择生物利用度(OB)>30%,且类药性(DL)>0.18作为西红花中的有效成分筛选条件,共得到5个主要成分和272个靶点;通过对药物-成分-疾病-靶点的网络图进行分析,得到多化合物共同作用靶点26个,单化合物作用靶点50个;通过蛋白质网络互作分析对蛋白质靶点基因进行筛选(degree>50),共筛选出19个相关靶点基因; GO分析共包含99条富集结果,KEGG数据库中共包含116条通路对动脉粥样硬化有治疗作用。西红花的5个主要成分均可与Fluid shear stress and atherosclerosis重要信号通路中的关键蛋白VCAM-1和eNOS进行对接,其中异鼠李素与VCA...
【文章来源】:中国临床药理学与治疗学. 2020,25(06)CSCD
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 药物化学成分筛选及靶点预测
1.2疾病靶点预测
1.3 网络图的构建与分析
1.4 蛋白质相互作用网络(protein-protein inter-actions,PPI)的构建
1.5 靶点基因功能的Gene Ontology(GO)分析与Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析
1.6 分子对接验证
2 结果
2.1 西红花有效成分筛选结果
2.2 疾病靶点预测结果
2.3 网络图的构建与分析结果
2.4 PPI网络互作结果
2.5 GO功能分析结果
2.6 KEGG富集分析结果
2.7 分子对接验证结果
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于网络药理学的虎杖抗高血脂作用及信号通路研究[J]. 郑丽,莫娟芬,吴加元,郭丽,鲍轶. 中国临床药理学与治疗学. 2019(10)
[2]西红花及其活性成分的国内、外临床研究概况[J]. 李颜,郭澄. 中国药房. 2019(17)
[3]西红花酸对PDGF-BB诱导下血管平滑肌细胞增殖、迁移的抑制作用[J]. 钟子君,吴一洲,许方方,苏松伟,李岩. 现代中西医结合杂志. 2019(25)
[4]基于网络药理学研究丹参治疗帕金森病的作用机制[J]. 章水晶,杜仲燕. 中国临床药理学与治疗学. 2019(06)
[5]雌激素对心血管系统的细胞作用机制的探讨[J]. 陈建,洪秀琴. 中华老年心脑血管病杂志. 2019(03)
[6]小窝蛋白1在血管重塑中的研究进展[J]. 冯祺论,唐晓鸿. 中华高血压杂志. 2019(02)
[7]人参皂苷Rb1通过Caveolin-1/eNOS/NO通路抗人脐静脉内皮细胞衰老[J]. 周彬,余舒杰,刘定辉,王敏,柯世业,钱孝贤. 中药材. 2019(01)
[8]西红花HPLC指纹图谱建立及成分分析[J]. 邢越阳,高崎,张雪,司睿蓉,吴佩颖. 中成药. 2019(01)
[9]冠心病“痰瘀滞虚”理论内涵与外延[J]. 王阶,邢雁伟,姚魁武,李军,陈光,董艳,熊兴江,刘咏梅,李洪峥,张振鹏. 中医杂志. 2019(04)
[10]西红花苷保护心血管疾病药理研究进展[J]. 朱安运,邓亮,孙琳,夏嫱,王雅溶,李小波,杜联峰,张浩,陈阳. 中华中医药学刊. 2018(02)
本文编号:3509802
【文章来源】:中国临床药理学与治疗学. 2020,25(06)CSCD
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 药物化学成分筛选及靶点预测
1.2疾病靶点预测
1.3 网络图的构建与分析
1.4 蛋白质相互作用网络(protein-protein inter-actions,PPI)的构建
1.5 靶点基因功能的Gene Ontology(GO)分析与Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析
1.6 分子对接验证
2 结果
2.1 西红花有效成分筛选结果
2.2 疾病靶点预测结果
2.3 网络图的构建与分析结果
2.4 PPI网络互作结果
2.5 GO功能分析结果
2.6 KEGG富集分析结果
2.7 分子对接验证结果
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于网络药理学的虎杖抗高血脂作用及信号通路研究[J]. 郑丽,莫娟芬,吴加元,郭丽,鲍轶. 中国临床药理学与治疗学. 2019(10)
[2]西红花及其活性成分的国内、外临床研究概况[J]. 李颜,郭澄. 中国药房. 2019(17)
[3]西红花酸对PDGF-BB诱导下血管平滑肌细胞增殖、迁移的抑制作用[J]. 钟子君,吴一洲,许方方,苏松伟,李岩. 现代中西医结合杂志. 2019(25)
[4]基于网络药理学研究丹参治疗帕金森病的作用机制[J]. 章水晶,杜仲燕. 中国临床药理学与治疗学. 2019(06)
[5]雌激素对心血管系统的细胞作用机制的探讨[J]. 陈建,洪秀琴. 中华老年心脑血管病杂志. 2019(03)
[6]小窝蛋白1在血管重塑中的研究进展[J]. 冯祺论,唐晓鸿. 中华高血压杂志. 2019(02)
[7]人参皂苷Rb1通过Caveolin-1/eNOS/NO通路抗人脐静脉内皮细胞衰老[J]. 周彬,余舒杰,刘定辉,王敏,柯世业,钱孝贤. 中药材. 2019(01)
[8]西红花HPLC指纹图谱建立及成分分析[J]. 邢越阳,高崎,张雪,司睿蓉,吴佩颖. 中成药. 2019(01)
[9]冠心病“痰瘀滞虚”理论内涵与外延[J]. 王阶,邢雁伟,姚魁武,李军,陈光,董艳,熊兴江,刘咏梅,李洪峥,张振鹏. 中医杂志. 2019(04)
[10]西红花苷保护心血管疾病药理研究进展[J]. 朱安运,邓亮,孙琳,夏嫱,王雅溶,李小波,杜联峰,张浩,陈阳. 中华中医药学刊. 2018(02)
本文编号:3509802
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