黄芪多糖对C3H10T1/2细胞棕色脂肪分化中长链非编码RNA表达谱的影响

发布时间：2022-01-09 12:43

　　本试验旨在探究黄芪多糖（APS）对小鼠间充质干细胞C3H10T1/2细胞棕色脂肪化过程中长链非编码RNA（lncRNA）表达谱的影响。试验以C3H10T1/2细胞为研究对象,在成脂诱导分化培养液中添加0.4 g/L的APS,以诱导分化1.5 d的细胞构建文库后测序,筛选差异m RNAs和差异lncRNAs,并对差异m RNAs和差异lncRNAs的顺式及共表达作用预测的靶基因进行了功能分析。通过荧光定量PCR随机分析了3个lncRNAs和3个m RNAs的表达水平,验证了测序结果的准确性。研究结果表明,本次测序共得到13 450个lncRNAs和57 776个m RNAs。通过对其表达量、长度、外显子个数和成对重复性检验分析证明了测序数据的可靠性较好。筛选共得到153个差异表达的lncRNAs和1 238个差异表达的m RNAs。结果表明,差异m RNAs主要基因本体（GO）注释富集在53个功能分类中,京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析富集在343条通路中。差异lncRNAs顺式及共表达作用预测的靶基因GO注释分别富集在34和33个功能分类中,在分子功能中条目一致。KEGG分析显... 

【文章来源】：激光生物学报. 2020,29(04)

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

新lncRNAs转录本和数据质量分析

为了验证测序数据的准确性，本研究使用q RT-PCR对随机选择的3个lncRNAs和3个m RNAs进行定量验证。测序结果中FC值>1或<1分别代表基因的上调或下调和表达量的升高或降低。结果表明q RT-PCR表达趋势与测序结果一致，lncRNAs(ENSMUST00000152125、ENSMUST00000191042、TCONS＿00033926）及m RNAs(ENSMUST000000109-74、ENSMUST00000031327）在荧光定量PCR与测序结果中都上调，而m RNA(ENSMUST00000165806）下调（图7）。这证明了本次测序结果的可靠性。图6 DElncRNAs与DEGs的共表达网络互作图

DElncRNAs与DEGs的共表达网络互作图

【参考文献】：
期刊论文
[1]12种植物粗多糖的体外抗肥胖及抗氧化活性研究[J]. 李鑫鑫,王一棠,陈琛,刘祥,郑红星,张小莺.  食品科技. 2018(02)
[2]黄芪多糖对3T3-L1前脂肪细胞增殖和分化的影响[J]. 刘毅,王文健,陈伟华,应健.  中西医结合学报. 2007(04)



本文编号：3578746