基于数据库挖掘以血管紧张素转化酶2为靶点治疗新型冠状病毒肺炎的潜在中药成分
发布时间:2022-01-24 12:19
目的利用中药数据库寻找抑制血管紧张素转化酶2(ACE2)治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在中药成分。方法借助SYMMAP、TCMID、ETCM数据库,以ACE2为搜索词,筛选中药成分及中药材,利用GCBI平台来筛选与靶点相关的炎症因子,得到相关疾病及核心网络图。将ACE2输入到STITCH数据库中,查询阳性对照药物。运用Sybyl(2.0)软件处理受体,中药成分与阳性对照药均和ACE2(1R42)及新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL pro(6LU7)进行对接分析。应用Swiss ADME平台为对接结果较好的中药成分和阳性对照药构建雷达图。结果从数据库中找到7种具有抑制SARS-CoV-2潜在活性的中药成分和相关中药材。网络分析图中连接基因数最多的是CXCR4基因,它涉及到细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路可能是发挥治疗COVID-19的潜在机制。分子对接的结果表明,2’,4’,3,4-四羟基查尔酮、葛根素与SARS-CoV-2相关蛋白结合最好。结论 2’,4’,3,4-四羟基查尔酮等中药成分可能是治疗COVID-19的潜在成分。
【文章来源】:药物评价研究. 2020,43(09)
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
中药成分相关靶点网络图
图3 代表性化合物与ACE2的图例根据Discover studio构效关系中的距离远近,可以判断成分和靶蛋白结合作用的强弱。距离越近,作用力越强。通过对图3和图4的分析,可以得出结论,氢键的作用力是最强的,Pi-Alkyl作用最弱。中药成分和阳性药的一些关键氨基酸具有相似性,大多数都以氢键相互作用,从而达到最好的作用效果。
总的来说,阳性药氯喹的生物利用度是最好的,阳性药赖诺普利和2",4",3,4-四羟基查尔酮的生物利用度相似,但是由于2",4",3,4-四羟基查尔酮具有先导类药性,所以预测其效果要好于赖诺普利。而葛根素相比较其他3种成分来说,效果是较差的。图5是相关成分的生物利用度雷达图。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]阿比多尔联合连花清瘟胶囊治疗新型冠状病毒肺炎的临床观察[J]. 柳丽丽,袁连方,冯毅,孙东,刘文生,王毅军,任超逸. 广东医学. 2020(12)
[2]基于网络药理学和分子对接技术的金振口服液干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制研究[J]. 陶晓倩,柯志鹏,张新庄,邓奕,曹泽彧,曹亮,王振中,肖伟. 中草药. 2020(09)
[3]T淋巴细胞亚群在新型冠状病毒肺炎诊疗中的临床意义[J]. 林敏青,夏文广,徐波,徐爱平,王夜明. 天津医药. 2020(06)
[4]“肺炎1号”治疗新型冠状病毒肺炎451例多中心临床研究[J]. 巴元明,王林群,李伟男,李鸣,陶然,左新河,吴霞,王小琴,石全,陆定波,周忠明,邓亚丽,胡运莲,张雪荣,冯毅,胡霜红,汪友法,董志强,陈圣堂,周艳华,肖本富,李晓迪,周浩,胡刚明,贺军,陈树和,姜楠,张馨. 世界中医药. 2020(13)
[5]连花清瘟颗粒联合西药常规疗法治疗新型冠状病毒肺炎疑似病例63例临床观察[J]. 吕睿冰,王文菊,李欣. 中医杂志. 2020(08)
[6]基于分子对接技术探讨金莲花汤抗新型冠状病毒(2019-nCoV)的潜力[J]. 赓迪,庞月笙,陶志,王莎,刘晓璇,王如峰. 中国现代中药. 2020(04)
[7]基于“扶正祛邪”理论的生血宝合剂辅助治疗新型冠状病毒肺炎的可行性分析[J]. 于金高,唐志书,刘妍如,许洪波,周瑞,宋忠兴,闫亚峰,常爱冰,周建平. 中国现代中药. 2020(04)
[8]查尔酮及其衍生物防治新型冠状病毒肺炎(COVID-2019)潜在应用的研究进展[J]. 方琦璐,辛文秀,李清林,杨国浓. 现代药物与临床. 2020(04)
[9]清肺排毒汤加减方联合抗病毒药物治疗新型冠状病毒肺炎的回顾性研究[J]. 李旷宇,安薇,夏飞,陈敏,杨萍,廖亚玲,许鑫,周琴,方莎莎,张明伟. 中草药. 2020(08)
[10]基于网络药理学的小柴胡汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发热的可行性探讨[J]. 杨璐,崔换天,刘相国,温伟波,王洪武. 中草药. 2020(07)
本文编号:3606559
【文章来源】:药物评价研究. 2020,43(09)
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
中药成分相关靶点网络图
图3 代表性化合物与ACE2的图例根据Discover studio构效关系中的距离远近,可以判断成分和靶蛋白结合作用的强弱。距离越近,作用力越强。通过对图3和图4的分析,可以得出结论,氢键的作用力是最强的,Pi-Alkyl作用最弱。中药成分和阳性药的一些关键氨基酸具有相似性,大多数都以氢键相互作用,从而达到最好的作用效果。
总的来说,阳性药氯喹的生物利用度是最好的,阳性药赖诺普利和2",4",3,4-四羟基查尔酮的生物利用度相似,但是由于2",4",3,4-四羟基查尔酮具有先导类药性,所以预测其效果要好于赖诺普利。而葛根素相比较其他3种成分来说,效果是较差的。图5是相关成分的生物利用度雷达图。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]阿比多尔联合连花清瘟胶囊治疗新型冠状病毒肺炎的临床观察[J]. 柳丽丽,袁连方,冯毅,孙东,刘文生,王毅军,任超逸. 广东医学. 2020(12)
[2]基于网络药理学和分子对接技术的金振口服液干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制研究[J]. 陶晓倩,柯志鹏,张新庄,邓奕,曹泽彧,曹亮,王振中,肖伟. 中草药. 2020(09)
[3]T淋巴细胞亚群在新型冠状病毒肺炎诊疗中的临床意义[J]. 林敏青,夏文广,徐波,徐爱平,王夜明. 天津医药. 2020(06)
[4]“肺炎1号”治疗新型冠状病毒肺炎451例多中心临床研究[J]. 巴元明,王林群,李伟男,李鸣,陶然,左新河,吴霞,王小琴,石全,陆定波,周忠明,邓亚丽,胡运莲,张雪荣,冯毅,胡霜红,汪友法,董志强,陈圣堂,周艳华,肖本富,李晓迪,周浩,胡刚明,贺军,陈树和,姜楠,张馨. 世界中医药. 2020(13)
[5]连花清瘟颗粒联合西药常规疗法治疗新型冠状病毒肺炎疑似病例63例临床观察[J]. 吕睿冰,王文菊,李欣. 中医杂志. 2020(08)
[6]基于分子对接技术探讨金莲花汤抗新型冠状病毒(2019-nCoV)的潜力[J]. 赓迪,庞月笙,陶志,王莎,刘晓璇,王如峰. 中国现代中药. 2020(04)
[7]基于“扶正祛邪”理论的生血宝合剂辅助治疗新型冠状病毒肺炎的可行性分析[J]. 于金高,唐志书,刘妍如,许洪波,周瑞,宋忠兴,闫亚峰,常爱冰,周建平. 中国现代中药. 2020(04)
[8]查尔酮及其衍生物防治新型冠状病毒肺炎(COVID-2019)潜在应用的研究进展[J]. 方琦璐,辛文秀,李清林,杨国浓. 现代药物与临床. 2020(04)
[9]清肺排毒汤加减方联合抗病毒药物治疗新型冠状病毒肺炎的回顾性研究[J]. 李旷宇,安薇,夏飞,陈敏,杨萍,廖亚玲,许鑫,周琴,方莎莎,张明伟. 中草药. 2020(08)
[10]基于网络药理学的小柴胡汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发热的可行性探讨[J]. 杨璐,崔换天,刘相国,温伟波,王洪武. 中草药. 2020(07)
本文编号:3606559
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