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基于数据库挖掘以血管紧张素转化酶2为靶点治疗新型冠状病毒肺炎的潜在中药成分

发布时间:2022-01-24 12:19
  目的利用中药数据库寻找抑制血管紧张素转化酶2(ACE2)治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在中药成分。方法借助SYMMAP、TCMID、ETCM数据库,以ACE2为搜索词,筛选中药成分及中药材,利用GCBI平台来筛选与靶点相关的炎症因子,得到相关疾病及核心网络图。将ACE2输入到STITCH数据库中,查询阳性对照药物。运用Sybyl(2.0)软件处理受体,中药成分与阳性对照药均和ACE2(1R42)及新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL pro(6LU7)进行对接分析。应用Swiss ADME平台为对接结果较好的中药成分和阳性对照药构建雷达图。结果从数据库中找到7种具有抑制SARS-CoV-2潜在活性的中药成分和相关中药材。网络分析图中连接基因数最多的是CXCR4基因,它涉及到细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路可能是发挥治疗COVID-19的潜在机制。分子对接的结果表明,2’,4’,3,4-四羟基查尔酮、葛根素与SARS-CoV-2相关蛋白结合最好。结论 2’,4’,3,4-四羟基查尔酮等中药成分可能是治疗COVID-19的潜在成分。 

【文章来源】:药物评价研究. 2020,43(09)

【文章页数】:8 页

【部分图文】:

基于数据库挖掘以血管紧张素转化酶2为靶点治疗新型冠状病毒肺炎的潜在中药成分


中药成分相关靶点网络图

水解酶,图例,代表性,化合物


图3 代表性化合物与ACE2的图例根据Discover studio构效关系中的距离远近,可以判断成分和靶蛋白结合作用的强弱。距离越近,作用力越强。通过对图3和图4的分析,可以得出结论,氢键的作用力是最强的,Pi-Alkyl作用最弱。中药成分和阳性药的一些关键氨基酸具有相似性,大多数都以氢键相互作用,从而达到最好的作用效果。

雷达图,生物利用度,雷达图,成分


总的来说,阳性药氯喹的生物利用度是最好的,阳性药赖诺普利和2",4",3,4-四羟基查尔酮的生物利用度相似,但是由于2",4",3,4-四羟基查尔酮具有先导类药性,所以预测其效果要好于赖诺普利。而葛根素相比较其他3种成分来说,效果是较差的。图5是相关成分的生物利用度雷达图。3 讨论

【参考文献】:
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本文编号:3606559

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