基于网络药理学的小儿肺热咳喘颗粒抗冠状病毒作用机制探讨

发布时间：2024-03-01 18:28

　　目的探索小儿肺热咳喘颗粒抗冠状病毒的潜在作用机制。方法在TCMIP数据库中查找小儿肺热咳喘颗粒的各药材-成分-靶点信息,同时检索全方的候选靶基因,在Genecards数据库中以"coronavirus"为关键词搜索冠状病毒相关靶点,与小儿肺热咳喘颗粒全方活性靶点映射筛选出共同靶点作为研究靶点。将筛选出的共同靶点在已经总结的各药材-成分-靶点数据库中查找到对应的成分及所属药材。将共同靶点导入STRING数据库中构建靶点相互作用网络图,利用Cytoscape3.3.0软件进行可视化处理,筛选出核心靶点。借助OmicsBean分析平台与STRING数据库对靶点进行基因本体(geneontology,GO)分析和KEGG信号通路富集分析。结果总结得到小儿肺热咳喘颗粒342个化学成分,全方靶基因共有737个。Venny映射后的共同靶点48个,对应173个化合物,核心靶点19个,主要化合物27个。GO生物过程(BP)条目3420个,细胞组成(CC)条目239个,分子功能(MF)条目343个。KEGG富集分析得到与小儿肺热咳喘颗粒治疗作用相关的信号通路160条。构建了小儿肺热咳喘颗粒核心靶点的"药材...

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【部分图文】：

图1小儿肺热咳喘颗粒相关蛋白靶点的PPI网络

将小儿肺热咳喘颗粒48个冠状病毒相关靶点蛋白输入至STRING数据库，构建靶蛋白PPI网络。该网络共有47个节点，276条相互作用关系，平均度值为11.7。将在STRING平台中构建的PPI网络数据导入Cytoscape3.3.0中（图1），度值降序排列筛选出大于平均度值12的....

图2小儿肺热咳喘颗粒相关蛋白靶点的GO富集分析

分析富集的通路发现，主要有肿瘤坏死因子信号通路（TNFsignalingpathway）、乙型肝炎病毒（HepatitisB）、阿米巴类感染（Amoebiasis）、查加斯病（美国锥虫病）（Chagasdisease(Americantrypanosomiasis)）；....

图3小儿肺热咳喘颗粒相关蛋白靶点KEGG通路富集分析的前10条通路

图2小儿肺热咳喘颗粒相关蛋白靶点的GO富集分析2.5小儿肺热咳喘颗粒“药材-成分-靶点-通路”网络构建

图4小儿肺热咳喘颗粒“药材-成分-靶点-通路”网络

将“2.3”项得到的19个核心靶点在已经总结的各单味药材成分-靶基因数据库中查找到对应的化学成分及所属药材，在Excel表格中建立药材-成分、成分-靶点、靶点-通路的相互对应关系，然后导入Cytoscape3.3.0软件中构建网络（图4）。通过拓扑属性分析发现，该网络有102....

本文编号：3915643