基于网络药理学探讨白花蛇舌草治疗口腔癌的作用机制

发布时间：2024-04-15 22:52

　　目的探讨白花蛇舌草治疗口腔癌的作用机制及其药用价值。方法采用HIT、中药综合资源数据库(TCMID)、PubMed、中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库检索白花蛇舌草的化合物成分,根据毒药物动力学(ADME)参数和里宾斯基五规则筛选具有成药性的化合物成分,采用TCMSP,TargetNet,Pharmmapper数据库检索并筛选潜在靶点,采用DiseaseGene Network数据库检索口腔癌的相关靶点。采用STRING数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系,通过基因映射、拓扑分析与富集分析的方法,预测白花蛇舌草治疗口腔癌的核心靶点与通路,以及生物过程(BP)、细胞成分(CC)、分子功能(MF)。结果共收集到93种白花蛇舌草的化合物成分,经ADME标准及里宾斯基五规则进行筛选后共获得32个化学结构不同的化合物成分,353个不同的白花蛇舌草化合物的相关靶点;通过DiseaseGene Network数据库,共收集到281个口腔癌的相关靶点;通过基因映射与拓扑分析,共获得200个白花蛇舌草治疗口腔癌的作用靶点,75个具有拓扑重要性的靶点;通过富集分析获得白花蛇舌草治疗...

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【部分图文】：

图1口腔癌281个靶点的PPI网络

基因映射:采用Cytoscape软件，将353个白花蛇舌草预测靶点映射在以口腔癌PPI网络为背景的网络上，共获得200个预测靶点，占口腔癌疾病靶点的71.17%。详见图2。拓扑分析:白花蛇舌草治疗口腔癌的200个预测靶点中，“Degree”中位数为23，“ClosenessCe....

图2基因映射提取白花蛇舌草治疗口腔癌的预测靶点

基于已获得的200个白花蛇舌草治疗口腔癌的预测靶点信息，建立PPI网络，得1个具有200个节点、2604条边的PPI网络，选择高置信度PPI，得1个具有200个节点、1204条边的PPI网络，详见图3。对预测靶点信息进行富集分析，P<0.05时包括336个BP、38个CC、1....

图3白花蛇舌草治疗口腔癌的预测靶点高置信度PPI网络

图2基因映射提取白花蛇舌草治疗口腔癌的预测靶点3讨论

图4白花蛇舌草治疗口腔癌“靶点-通路”网络图

富集分析结果显示，白花蛇舌草治疗口腔癌主要作用于胞浆、核质、细胞器膜、质膜、细胞核等7个细胞成分，涉及了包括凋亡、增殖、炎性反应、氧化应激等51个生物过程及31个分子功能，这与已有的体内外实验研究结果一致[13-16]，其还参与如类固醇、单萜类、杂环类等多种物质的生物代谢过程，这....

本文编号：3956065