基于网络药理学和分子对接探讨葛根-丹参药对治疗2型糖尿病作用机制研究

发布时间：2024-04-26 05:53

　　目的基于网络药理学和分子对接探讨葛根-丹参药对治疗2型糖尿病潜在分子机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索葛根、丹参化学成分和作用靶点;通过GeneCards数据库获取2型糖尿病相关靶标基因,运用Cytoscape3.7.1构建成分-靶点网络图,综合活性化合物与T2DM的交集基因,获取蛋白相互作用关系,筛选出核心靶点。基于分子对接(AutoDock Vina)对筛选所得葛根、丹参活性成分与核心靶点进行分子对接验证。最后进行GO生物学过程和KEGG通路富集分析。结果葛根-丹参药对成分-靶点网络包含60个成分,155个相应靶点,其中57个靶点为葛根-丹参治疗T2DM的靶点。分子对接结果显示葛根素、芒柄花黄素、丹参酮ⅡA和木犀草素活性化合物与STAT3、AKT1、JUN、MAPK1有较佳的结合活性。主要的生物学过程包括血管的生成、炎症反应、细胞增殖、神经保护作用,主要信号通路包括PI3K-AKT信号通路、糖尿病并发症AGE/RAGE信号通路、TNF-α信号通路、IL-17信号通路等。结论网络药理学是从整体角度上阐述中药作用机制的有效工具,葛根-丹参药对通过网络药理学预测分子机...

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

图1葛根-丹参药对化合物-靶点相互网络作用图

网络图直观反映化合物和靶点间相互作用，节点代表化合物，边代表了化合物和靶点之间关系。黄色、粉色、蓝色节点分别代表药物靶点、葛根化合物、丹参化合物。化合物-靶标网络包含了215个节点和954条边，葛根-丹参药对中每个化合物平均作用于15.9个靶标，每个靶标平均与6.15个化合物连接....

图2葛根-丹参作用靶点与T2DM靶点交集基因韦恩图

本研究基于STRING数据库分析葛根-丹参药对治疗T2DM作用靶点之间的交互作用,通过在线韦恩图得到化合物-疾病共有基因57个导入STRING，交互作用可信度设置为最高值（0.900）构建靶点相互作用网络（图3），并进行网络拓扑结构分析。该网络包括48个节点（9个靶点未发生蛋白互....

图3葛根、丹参与T2DM蛋白相互作用网络图

图2葛根-丹参作用靶点与T2DM靶点交集基因韦恩图2.5葛根-丹参药对治疗T2DM活性成分干预关键靶点的分子对接预测

图4活性化合物与核心靶点最佳结合模式

KEGG结果分析，共富集136条信号通路，主要与PI3K-AKT信号通路、糖尿病并发症的AGE/RAGE信号通路、TNF-α信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等有着密切联系。图4活性化合物与核心靶点最佳结合模式

本文编号：3964807