基于蛋白质相互作用网络探索大黄蛰虫丸治疗慢性粒细胞白血病的机理

发布时间：2017-10-22 13:06

  本文关键词：基于蛋白质相互作用网络探索大黄蛰虫丸治疗慢性粒细胞白血病的机理

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【摘要】：目的:本研究基于前期临床观察,通过建立慢性粒细胞白血病遗传相关基因的蛋白质相互作用网络、细胞实验两部分对经典方剂大黄蜇虫丸治疗慢性粒细胞白血病的内在机制进行探究,通过实验研究揭示大黄蛰虫丸作用于慢性粒细胞性白血病细胞内在生物学行为,为中药治疗血液系统疾病提供理论和实验依据。方法:建立慢性粒细胞白血病遗传相关基因的蛋白质互相作用网络主要通过筛选在线人类孟德尔遗传数据库中的慢性粒细胞白血病遗传相关基因,应用Cytoscape软件和插件Agilent Literature Search,进行文本挖掘并建立慢性粒细胞白血病的蛋白质相互作用网络;应用插件Clusterviz,发现网络中的可能包含的分子复合物;基于DAVID,富集分子复合物的生物学通路。针对关键通路JAK2-STAT5,采用MTT法、流式、Weston-blot法进行体外细胞实验,观察大黄蛰虫丸对K562细胞增值及JAK2、STAT5表达的影响。结果:结果表明CML是一个受多种信号通路、多种基因构成的网络体系协同调控的复杂过程,并非简单地由某个基因或某条信号通路控制;而在该信号网络中,JAK2-STAT5很可能是“关键调控点”,大黄蛰虫丸能够抑制K562细胞的增值,其内在作用机制可能与其影响JAK2-STAT5的表达有关。结论:研究表明慢性粒细胞白血病蛋白质基因网络复杂,其中JAK2-STAT5是关键节点,而大黄蛰虫丸对K562细胞增值的抑制作用机制之一是降低JAK2-STAT5的表达,这为我们进一步深入研究提供思路。
【关键词】：大黄蛰虫丸 蛋白质相互作用网络 慢性粒细胞白血病 JAK2 STAT5
【学位授予单位】：山东中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R733.7
【目录】：

• 提要3-4
• Abstract4-8
• 引言8-10
• 基因组生物学通路富集研究10-16
• 一、方法步骤10
• （一）数据的获取10
• （二）基因/蛋白质相互作用网络的构建10
• （三）网络分析10
• 二、主要观察指标10-11
• 三、结果及分析11-16
• （一）OMIM中的慢性粒细胞白血病遗传相关基因11
• （二）蛋白质相互作用网络11
• （三）网络拓扑属性分析11-12
• （四）分子复合物探测12-13
• （五）分子复合物通路富集13-16
• 实验研究16-22
• 一、材料16
• （一）细胞与试剂16
• （二）仪器16
• 二、实验方法及步骤16-18
• （一）动物含药血清的配制16-17
• （二）细胞培养17
• （三）MTT法观察不同浓度含药血清对K562细胞增殖的影响17
• （四）慢性粒细胞白血病K562细胞克隆形成实验17
• （五）流式细胞仪分析大黄蛰虫丸对K562细胞凋亡的影响17-18
• （六）Weston-blot法检测大黄蛰虫丸对K562细胞JAK2、STAT5表达的影响18
• 三、实验研究结果18-22
• （一）不同浓度大黄蛰虫丸含药血清对K562细胞增殖的抑制作用18-19
• （二）慢性粒细胞白血病K562细胞克隆形成实验19-20
• （三）大黄蛰虫丸含药血清诱导K562细胞的凋亡20
• （四）大黄蛰虫丸对K562细胞中JAK2、STAT5蛋白表达的影响20-22
• 讨论22-29
• 一、活血化瘀法与慢性粒细胞白血病22-24
• 二、蛋白质相互作用网络与CML相关基因24-27
• 三、JAK/STAT信号通路与慢性粒细胞白血病27-29
• 结语29-30
• 参考文献30-36
• 综述36-42
• 参考文献39-42
• 致谢42-43
• 详细摘要43-48

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4 刘U，

本文编号：1078464