淋巴瘤中EB病毒潜伏膜蛋白1基因多态性研究

发布时间：2017-10-22 21:12

  本文关键词：淋巴瘤中EB病毒潜伏膜蛋白1基因多态性研究

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【摘要】：背景和目的EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)潜伏膜蛋白1(latent membrane protein,LMP1)基因是公认的EBV致癌基因,在EBV相关肿瘤的发病中具有重要作用。LMP1基因存在多种变异,其变异与肿瘤发生的关系一直是其致癌机制研究的热点,但目前并未取得一致结论。以往对中国LMP1基因多态性的研究,多以鼻咽癌为研究对象,有关淋巴瘤的研究相对较少,且多数研究只针对LMP1单一基因变异进行检测。本研究检测青岛地区EBV阳性淋巴瘤和正常人群中LMP1全序列,旨在了解该地区淋巴瘤中LMP1基因变异特征,探讨LMP变异与淋巴瘤发生的相关性,为进一步明确LMP1基因变异与肿瘤发生的相关性提供实验依据。方法用PCR和DNA测序检测80例EBV阳性淋巴瘤组织(结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤47例、霍奇金淋巴瘤26例、弥漫大B细胞淋巴瘤2例、T细胞淋巴瘤5例)和70例EBV阳性健康人群咽漱液标本中LMP1基因序列,应用DNAStar软件对LMP1基因核苷酸及氨基酸序列进行对比分析,应用MEGA软件绘制系统进化树,同时与EBV标准株B95-8序列比较,根据其特征性改变对变异进行分类。比较淋巴瘤和健康人群之间以及不同淋巴瘤之间LMP1基因变异型的分布情况。结果①与标准株B95-8相比,所有150例标本中LMP1基因均出现序列变异,包括单核苷酸突变、插入、缺失和重复序列变化。根据系统树及LMP1编码区基因特征性突变,共发现3种主要亚型(China 1、China 2和Med-)及少数不同亚型的重组病毒株,3种亚型在非编码区和重复序列区也呈现特征性改变。N端Xho I位点缺失变异即Xho I(-)和C端30 bp缺失即del-LMP1变异与LMP1亚型及重组病毒株呈不同的对应关系。②China 1、China 2和Med-亚型在淋巴瘤中的检出率分别为85.0%(68/80)、6.3%(5/80)和7.5%(6/80),在健康人群中的检出率分别为65.7%(46/70)、5.7%(4/70)和21.4%(15/70),另有1例(2.1%)淋巴瘤和5例(7.2%)健康人群毒株为不同亚型的重组病毒株。LMP1亚型在2种人群中的分布有显著性差异(P=0.014)。Xho I(-)和del-LMP1在淋巴瘤中的检出率(92.5%和85.0%)高于健康人群(74.3%和67.1%),差异均有显著性(P=0.002,0.010)。③LMP1各种变异类型在47例结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤和26例霍奇金淋巴瘤之间的分布无显著性差异。结论①LMP1变异复杂,分析LMP1基因多态性时,对LMP1全序列进行分析,才能全面准确反映LMP1变异情况。②青岛地区淋巴瘤和健康人群EBV毒株LMP1以China 1亚型、Xho I(-)和del-LMP1为主,3种变异型在淋巴瘤中的检出率高于健康人群,提示带有3种变异型的EBV毒株可能与淋巴瘤的发生相关,但对不同细胞来源淋巴瘤可能无选择倾向性。
【关键词】：EB病毒 淋巴瘤 潜伏膜蛋白1 基因多态性
【学位授予单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R733.1
【目录】：

• 摘要2-4
• Abstract4-7
• 引言7-9
• 第1章 材料和方法9-15
• 1.1 仪器、试剂和耗材9-10
• 1.2 研究对象10
• 1.3 DNA提取10-12
• 1.4 LMP1基因序列多态性检测12-14
• 1.5 统计学分析14-15
• 第2章 结果15-32
• 2.1 LMP1序列变异类型15-18
• 2.2 系统进化树分析18-28
• 2.3 LMP1亚型在淋巴瘤与正常人群中的分布28
• 2.4 Xho I (-)变异及del-LMP1变异28-29
• 2.5 LMP1各种变异型在不同淋巴瘤中的分布29-30
• 2.6 LMP1 C末端重复序列变异30-32
• 第3章 讨论32-36
• 研究结论36-37
• 参考文献37-43
• 综述43-58
• 综述参考文献51-58
• 攻读学位期间的研究成果58-59
• 致谢59-60

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本文编号：1080112