SERT基因启动子区多态性与结直肠癌CRF易感性及严重程度的关系

发布时间：2017-10-23 01:24

  本文关键词：SERT基因启动子区多态性与结直肠癌CRF易感性及严重程度的关系

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【摘要】：目的：探讨SERT基因启动子区单核苷酸多态性位点rs2553、rs956304与结直肠癌癌因性疲乏(Cancer Related Fatigue,CRF)的相关关系,以及遗传与非遗传因素的相互作用与结直肠癌癌因性疲乏的相关关系。分析位点rs25531、rs956304和非遗传因素的交互作用在结直肠癌癌因性疲乏中的作用。方法：选取2014年10月至2015年12月在南昌大学第二附属医院就诊的结直肠癌患者共计309例,采用简明癌因性疲乏评估量表中国版(The Chinese version of the Brief Fatigue Inventory,BFI-C)评估癌因性疲乏的严重程度；采集外周静脉血,提取基因组DNA,采用直接测序法对SERT基因启动子区多态性位点rs25531、 rs956304进行基因分型,同时记录性别、年龄、吸烟情况、饮酒情况、体重指数(Body mass index,BMI)、体育锻炼情况、肿瘤分期、是否化疗以及是否放疗等因素。使用SPSS22.0统计软件进行统计学分析,采取拟合优度x2检验进行哈迪-温伯格遗传平衡检测；采用有序Logistic回归分析明确研究因素与癌因性疲乏程度的关系,计算调整OR值和95%可信区间。所有统计检验均采用双侧概率检验,显著性水平为P0.05。结果：位点rs25531和rs956304基因型分布频率符合哈迪—温伯格平衡(x2=0.02,P0.05;x2=2.89,P0.05)。回归分析的结果显示影响癌因性疲乏程度的独立因素有性别、体育锻炼、吸烟、肿瘤分期、化疗情况以及位点rs25531基因型。吸烟和化疗是危险因素,OR值分别为2.41(95%CI=1.54-3.78)和2.33(95%CI=1.45～3.75)。癌因性疲乏的严重程度在男性、有体育锻炼的结直肠癌患者中较轻,OR值分别为0.58(95%CI=0.36～0.92)和0.37(95%CI=0.24-0.59)。相对于TNM分期Ⅳ期的患者,Ⅰ期和Ⅱ期结直肠癌患者CRF的发生及严重程度风险分别为0.21(95%CI=0.06-0.32)和0.31(95%CI=0.13-0.71),差别有统计学意义,而Ⅲ期患者的CRF情况并无统计学意义。与AA基因型相比,位点rs25531等位基因G携带者(AG+GG基因型)患有癌因性疲乏及严重程度风险增加至2.07倍(95%CI=1.20～3.56,P=0.009)。结论：SERT启动子区多态性位点rs956304与结直肠癌CRF无相关性。位点rs25531 G等位基因型与结直肠癌CRF的严重程度密切相关,是结直肠癌CRF的危险因素,这种风险作用在女性、缺乏体育锻炼、吸烟、TNM分期Ⅲ期以及化疗的患者中更明显。
【关键词】：结直肠癌 癌因性疲乏 5-羟色胺转运体 启动子 单核苷酸多态性
【学位授予单位】：南昌大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R735.34
【目录】：

• 摘要3-5
• ABSTRACT5-10
• 第1章 引言10-13
• 第2章 对象和方法13-22
• 2.1 研究对象13
• 2.1.1 对象来源13
• 2.1.2 纳入排除标准13
• 2.2 研究方法13-14
• 2.2.1 CRF诊断标准13
• 2.2.2 疲乏程度评估13-14
• 2.2.3 基本情况调查14
• 2.2.4 血样采集14
• 2.3 实验试剂和设备14-16
• 2.3.1 主要实验试剂15
• 2.3.2 主要实验设备15
• 2.3.3 相关实验试剂的配制15-16
• 2.4 实验方法16-21
• 2.4.1 基因组DNA提取16-17
• 2.4.2 SNPs的选择17-18
• 2.4.3 多态性位点rs25531、rs956304基因分型18-21
• 2.5 统计分析21-22
• 第3章 结果22-29
• 3.1 研究对象的一般情况22
• 3.2 哈迪-温伯格遗传平衡性检验(Hardy-Weinberg检验)22
• 3.3 位点rs25531基因型和等位基因的比较22-24
• 3.3.1 不同程度CRF间位点rs25531基因型频率22-23
• 3.3.2 不同程度CRF间位点rs25531AA基因型与G等位基因型频率23
• 3.3.3 不同程度CRF间位点rs25531等位基因型频率23-24
• 3.3.4 位点rs25531各基因型与结直肠癌CRF的关系24
• 3.4 位点rs956304基因型和等位基因的比较24-26
• 3.4.1 不同程度CRF间位点rs956304基因型频率24-25
• 3.4.2 不同程度CRF间位点rs956304 AA基因型与G等位基因型频率25
• 3.4.3 不同程度CRF间位点rs956304等位基因型频率25-26
• 3.5 人口学资料及非遗传因素与结直肠癌CRF的关系26-27
• 3.6 影响癌因性疲乏程度的多因素Ordinal回归分析27-28
• 3.7 遗传因素和非遗传因素的交互作用分析28-29
• 第4章 讨论29-33
• 4.1 位点rs25531/rs956304基因多态性和等位基因与结直肠癌CRF易感性及严重程度的关系30-31
• 4.2 遗传与非遗传因素和结直肠癌CRF易感性及严重程度的关系31-33
• 第5章 结论33-34
• 致谢34-35
• 参考文献35-38
• 综述38-45
• 参考文献43-45

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