KRT81及KIAA0423和MicroRNA结合位点单核苷酸多态性与结肠癌发生的关系

发布时间：2017-12-22 11:42

  本文关键词：KRT81及KIAA0423和MicroRNA结合位点单核苷酸多态性与结肠癌发生的关系　出处：《河北医科大学》2015年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：目的:Micro RNA(mi RNA)是一类高度保守的小型非编码RNA,长度为22个核苷酸,在转录后水平调控m RNA的表达。它通过与靶m RNA的3'非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)序列按照碱基互补的原则结合,降解靶m RNA或抑制其翻译,从而实现对靶m RNA的负向调控。mi RNA调控大约30%的蛋白编码基因,在分化、增殖、凋亡等细胞的生物学过程中发挥至关重要的作用。近年来越来越多的研究表明,某些miRNA在人类肿瘤细胞中出现异位表达,并且与多种肿瘤的发生及预后息息相关。单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由于单个核苷酸的变异导致DNA序列的多样化,单核苷酸多态性的存在影响mi RNA与其靶m RNA的互补结合,进而影响基因的表达。已有研究表明SNP位点的存在与肿瘤的易感性相关,然而关于miRNA结合位点的SNP与结肠癌(colon cancer)发病关系的研究有限。已有研究筛选出12个与肿瘤发生相关单核苷酸多态性位点,这些位点均为mi RNA的结合位点,我们前期研究发现,其中六个多态性位点因低频率等位基因出现率小(5%),不适宜进行分析,予以剔除,其余正在研六个位点中,已进行SET8基因上rs16917496位点的单核苷酸多态性与结肠癌的关系的研究,因此本研究拟对KRT81(rs3660),RYR3(rs1044129),KIAA0423(rs1053667),C14orf101(rs4901706)及GOLGA7(rs11337)这五个多态性位点基因型进行分析,结合病例-对照研究,以期鉴定出与结肠癌发生相关的SNP位点,对筛查易患结肠癌的高危人群具有重要意义。方法:1标本采集:病例组的静脉血标本来自2006年7月至2008年9月间在河北医科大学第四医院外科行手术治疗的166名结肠癌患者,并且详细记录结肠癌患者的临床特征(性别、年龄等),233例健康对照组的静脉血来自2011年10月至2012年5月期间在河北医科大学第四医院体检的健康人,健康对照组无与结肠癌相关的疾病。2基因组DNA的提取、目的片段的扩增及mi RNA结合位点的单核苷酸多态性的筛查:用天根DNA纯化试剂盒提取血标本的基因组DNA,提取后置于4?C冰箱保存备用。在NCBI数据库中查找上述5个mi RNA结合的SNP位点对应的目的基因,设计PCR扩增上下游引物,进行PCR扩增,产物经琼脂糖凝胶电泳证实后,送往上海捷瑞生物工程技术服务有限公司,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(Polymerase Chain Reaction-Ligase Detection Reaction,PCR-LDR)进行基因型分析。3统计学分析:采用t检验(student t-test)比较计量资料,χ2检验(Pearson Chi-Square test)或Fisher确切概率法比较计数资料。非条件Logistic回归方法计算相对风险度比值比(odds ratio,OR)及95%可信区间(Confidence Interval,CI)。实验数据均采用SPSS17.0统计软件进行统计学分析,P0.05被认为有统计学意义。结果:1 KRT81基因上的rs3660位点的G/G基因型与C/G+C/C基因型在结肠癌组与健康对照组之间的分布频率存在差异(OR:1.583,95%CI:1.029-2.436,p=0.036);携带G/G基因型发生结肠癌的风险是携带C/G+C/C基因型的1.583倍。KIAA0423基因上的rs1053667位点的T/T基因型与C/T+C/C基因型在结肠癌组与健康对照组之间的分布频率存在差异(OR:3.077,95%CI:2.095-6.454,p=0.000)。携带T/T基因型发生结肠癌的风险是携带C/T+C/C基因型的3.077倍。2 rs1044129、rs4901706、rs11337这三个多态性位点的基因型分布频率在结肠癌组与对照组之间无明显差异(P0.05)。3对结肠癌组中rs3660及rs1053667位点基因型与各临床特征进行分析显示,基因型分布频率与患者临床特征(性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤长径、Dukes分期)无相关性(P0.05)。结论:1 KRT81基因的rs3660位点和KIAA0423基因的rs1053667位点的基因型分布频率在结肠癌组与对照组之间存在差异,提示rs3660、rs1053667这两个mi RNA结合位点可以作为预测结肠癌发生风险有价值的标志。2尚不能认为KRT81基因的rs3660位点和KIAA0423基因的rs1053667位点的基因型分布频率与结肠癌患者的临床特征(性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤长径、Ducks分期)有相关性。3 Micro RNA结合位点的单核苷酸多态性可以作为预测结肠癌发病风险的分子标志物。
【学位授予单位】：河北医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.35

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 Faraz Bishehsari;Mahboobeh Mahdavinia;Michele Vacca;Reza Malekzadeh;Renato Mariani-Costantini;;Epidemiological transition of colorectal cancer in developing countries: Environmental factors, molecular pathways, and opportunities for prevention[J];World Journal of Gastroenterology;2014年20期

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 吴忱思;MicroRNA结合位点单核苷酸多态性与原发性肝癌发生及其预后的关系[D];河北医科大学;2010年

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本文编号：1319350