宣威地区肺腺癌病人肺组织特异miRNAs表达谱和靶基因及其信号通路预测

发布时间：2018-02-03 23:01

  本文关键词： miRNA芯片 miRNAs 宣威肺腺癌 靶基因 信号通路　出处：《南方医科大学学报》2017年02期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路。方法选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌miRNAs差异表达谱,AGO分析和KEGG Pathway分析预测其miRNAs的生物与肺癌相关的靶基因和信号通路。结果 miRNAs芯片检测:与非宣威肺腺癌比较,宣威肺腺癌差异表达显著的特异miRNAs 34个:表达上调的miRNAs有23个,表达下调的miRNAs有11个。AGO富集分析及KEGG数据库映射分析发现:预测主要集中在PI3K/Alt信号通路附近,其预测靶基因有:GF、RTK、SOS、IRS1、BCAP、CYTOKINSR、ECM、ITGB、FAK和GβY,可能对肺癌生物学功能产生影响的靶基因主要集中在PI3K/Alt,WNT和MAPK通路。结论筛选出这些特异性miRNAs可能在宣威肺腺癌癌变和进展中起重要作用,预测的靶基因可能与调节PI3K/Alt,WNT和MAPK信号通路的作用有关。
[Abstract]:Objective to screen the differential expression profiles of miRNAs in lung tissues of patients with adenocarcinoma of lung in Xuanwei area. Methods 24 cases of lung adenocarcinoma in Xuanwei area and 10 cases of lung adenocarcinoma in non-Xuanwei area were selected from lung cancer tissue and normal lung tissue. 34 pairs of lung cancer specimens were detected by miRNAs microarray, and the differential expression profiles of miRNAs in Xuanwei lung adenocarcinoma were screened. AGO analysis and KEGG Pathway analysis were used to predict the target genes and signaling pathways associated with lung cancer in miRNAs. Results miRNAs microarray was used to detect:. Compared with non-Xuan Wei lung adenocarcinoma. There were 34 differentially expressed specific miRNAs in Xuanwei lung adenocarcinoma and 23 up-regulated miRNAs. There were 11. Ago enrichment analysis and KEGG database mapping analysis of down-regulated miRNAs. It was found that the prediction was mainly near the PI3K/Alt signaling pathway. The predicted target genes were: GFG / RTK / SOS / IRS1 / BCAPX / CYTOKINSRS / ECM / ITGBGFAK and G 尾 _ Y, respectively. The target genes which may affect the biological function of lung cancer mainly focus on PI3K/Alt. Conclusion the screening of these specific miRNAs may play an important role in the carcinogenesis and progression of Xuanwei lung adenocarcinoma. The predicted target gene may play an important role in the regulation of PI3K/Alt. The role of WNT and MAPK signaling pathway is related.
【作者单位】： 昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(U1202224,81460441) 云南省应用基础研究面上项目(2016FB145) 云南省卫生科技计划项目(2014NS001) 云南省医疗卫生单位内设研究基金(2016NS106) 云南省肿瘤医院博士科研启动基金(BSJJ201502)~~
【分类号】：R734.2
【正文快照】： 肺癌死亡率位居全世界癌症之首,每年超过140万人死于肺癌[1]。尽管在早期诊断和新的治疗策略方面获得进展,但是肺癌病人5年总体生存率仍然低于15%[2]。宣威肺癌是指位于中国西南云南省宣威地区(包括宣威、富源、麒麟和沾益县等)居民所患的肺癌,女性肺癌发病率高达400/10万,高

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本文编号：1488591