miR-146a,miR-196a2和miR-499基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的相关性研究
发布时间:2019-08-01 10:08
【摘要】:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的发病率和致死率。据估计在2012年全世界新发病例数约为78200例,而我国每年肝癌的发病总数超过了世界发病总数的一半。根据1997年对我国27个省、市、自治区1990-1992年抽样地区分析,肝癌死亡率约为20.37/10万,其中男性29.01/10万,女性11.21/10万,死亡率在男性人群中仅次于胃癌,位于恶性肿瘤的第2位,在女性则次于胃癌和食管癌,位于第3位。因而HCC严重威胁着我国人民的生命健康。大量的流行病学研究已经证实,HCC是多因素、多阶段、多基因共同作用的复杂疾病,不同个体间的发病风险存在较大的差异,大多的研究认为HCC发生的个体差异性取决于复杂的环境因素和自身的遗传因素两者间的相互作用。microRNA(miRNA)是长约22核苷酸的非编码RNA,广泛存在于从病毒到人类的各种生物中,广泛参与各种生命活动,包括细胞增殖、细胞发育、分化、凋亡及肿瘤的发生发展,行使多种重要的生物学功能。研究显示miRNA在肿瘤的发生、发展中起着癌基因或抑癌基因的作用。许多研究表明,miRNA与肝癌的发生、发展、侵袭转移以及药物耐药等方面有着密切的关系。大量的研究发现关键部位基因的遗传变异将会引起基因的结构、表达以及分子调控功能的变化,从而导致机体生物学功能的改变。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是人类可遗传变异中最常见的一种,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性。研究显示,基因遗传变异(genetic variation)影响个体患肿瘤的遗传易感性,SNPs产生的基因结构或表达量的变化,发挥基因对机体的调控作用。当初级miRNAs(primary miRNAs)上存在重要的功能学SNPs,则会影响前体miRNAs(precursor miRNAs)的生成过程,从而引起成熟miRNAs的结构或者表达异常;成熟的miRNAs生成过程中有多个关键调控基因的参与。miRNAs通过与基因3'非翻译区(3'untranslate region)结合引起靶基因mRNA降解或抑制其翻译,从而参与肝细胞癌的发生发展。因此,当SNPs位于成熟的miRNAs上时,直接参与miRNAs对靶基因的调控,进而导致肝细胞癌的发生。研究发现miR-146a rs2910164(C/G),miR-196a2 rs11614913(C/T)和miR-499 rs3746444(T/C)单个或多个SNPs间的联合作用与多种肿瘤的发生密切相关。同样,有一些文献报道了它们与肝癌遗传易感性的关系,但结果相互矛盾且不确定。在本研究中,我们通过联合检测肝细胞癌组和健康对照组人群的miR-146a rs2910164(C/G),miR-196a2rs11614913(C/T)和 miR-499rs3746444(T/C)基因型的分布,探讨miR-146a,miR-196a2和miR-499遗传变异与中国人群肝细胞癌发生风险的关系。在2013年4月至2015年3月间共有175例HCC患者和302例健康对照人群纳入研究。通过应用多聚酶链式反应-限制性片段长度多态性对miR-146a,miR-196a2和miR-499单核苷酸多态性进行基因分型分析。结果发现HCC患者的miR-146a rs2910164(C/G)和对照组基因型分布有显著性差异(X 2 = 17.23,P0.001)。在共显性模型中,与CC基因型相比,miR-146a中的CG和GG基因型的表达显著升高HCC的风险,调整后的OR值分别为3.05(95%可信区间:1.07-8.70)和4.96(95%可信区间:1.64-14.97)。在隐性模型中,GG基因型肝细胞癌发生的风险是CG+GG基因型的3.75倍,调整后的OR值分别为3.75(95%可信区间:1.39-10.11)。然而,在共显性,显性、隐性模型中,均没有观察到 miR-196a2 rs11614913(C/T)和 miR-499 rs3746444(T/C)与HCC风险间存在显著的相关性。携带HBV的肝癌患者,miR-146a rs2910164在共显性模型中,与CC基因型相比,CG和GG基因型的表达显著升高HCC的风险,调整后的OR值分别为2.02(95%可信区间:1.06-5.07)和3.12(95%可信区间:1.66-10.77);在显性模型中,CG+GG基因型发生肝癌的风险是CC型的1.91倍(95%可信区间:1.85-3.38);在隐性模型中,GG基因型是CG+GG基因型的1.54倍(95%可信区间:1.15-6.08)。而在HCV感染和HBV及HCV均阴性的肝癌患者中未发现miR-146a基因多态性增加HCC发生的风险。我们的研究显示,miR-146a rs2910164中GG和CG基因型增加了中国人群HCC遗传易感性,尤其对HBV感染的病人。而miR-196a2 rs11614913(C/T)和miR-499 rs3746444(T/C)多态性未增加HCC的发生风险。背景:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的发病率和致死率。流行病学研究已经证实,肝细胞癌是多因素、多阶段、多基因共同作用的复杂疾病,不同个体间HCC的发病风险存在较大的差异。研究显示miRNA通过调节原癌基因及抑癌基因在肿瘤的发生、发展起着非常重要的作用。当初级miRNAs(primary miRNAs)上存在重要的功能学SNPs,则会影响前体miRNAs(precursormiRNAs)的生成过程,从而引起成熟miRNAs的结构或者表达异常;成熟的miRNAs生成过程中有多个关键调控基因的参与。miRNAs通过与靶基因3'非翻译区(3'untranslate region)结合引起靶mRNA降解或抑制其翻译,从而参与肝细胞癌的发生发展。因此,当SNPs位于成熟的miRNAs上时,直接参与miRNAs对靶基因的调控,进而导致肝细胞癌的发生。广泛的研究试图调查miR-146a的rs2910164多态性对HCC易感性是否有促进作用。然而,这些结果仍然不一致和不确定。目的:综合评估miR-146a的rs2910164多态性与HCC遗传易感性的关系。方法:计算机检索Pubmed、Web of Science、Cochrane、万方医学数据库以及谷歌学术等。查找有关miR-146a基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的病例对照研究,检索截止日期为2016年10月以电子论文形式发表的中文和英文文献,对搜集到的文献进行筛选,对符合纳入标准的文献进行质量评估,随后提取数据。采用Statal2.0软件进行统计学分析,对文献进行异质性分析,若I250%,P0.10则采用固定效应模型,若I250%,P0.10则采用随机效应模型合并各研究量。系统评价miR-146a的rs2910164多态性与HCC遗传易感性的关系。结果:最终纳入文献18项,共有病例5610例和对照7531例用于荟萃分析。miR-146a rs2910164多态性与HCC易感性之间无明显关联。5个遗传模型的结果果如下:等位基因模型C vs G(OR=0.96,95%CI=0.88-1.06,P=0.440),杂合子模型 CGvsGG(OR=0.99,95%CI=0.90-1.10,P=0.898),纯合子模型 CCvs GG(OR=0.91,95%CI=0.75-1.10,P=0.314),显性模型 CC+CGvsGG(OR=0.97,95%CI=0.79-1.19,P=0.759),隐性模型 CG+GG vs CC(OR=1.05,95%CI=0.94-1.18,P=0.405)。对种族、对照人群来源以及HWE分别在5种遗传模型中进行亚组分析,只在隐性模型CG+GG vs CC对照人群来源为PB亚组中发现miR-146a rs2910164 多态性增加 HCC 易感性(OR=1.20,95%CI=1.02-1.40,P =0.024),其余各模型的亚组均未发现miR-146a rs2910164多态性与HCC易感性有什么关联。对HBV感染进行分层分析,结果显示miR-146ars2910164多态性增加了 HBV 阳性 HCC 发生的风险(OR=1.26,95%CI=1.10-1.49,P=0.001)。结论:miR-146a的rs2910164多态性与HCC发生风险之间无明显关联,但可能增加HBV阳性HCC发生的风险。需要具有更大样本量和更多族裔群体的设计良好的研究来进一步验证结果的可靠性。
【图文】:
它与信使邋RNA邋(mRNA)的非翻译区(3'邋untransl化edregion,邋3'邋UTR邋)逡逑结合,如果完全配对,则裂解或者切割信使RNA,不完全配对则起到抑制翻译的逡逑作用[4,邋6](见图1.邋1),从而引起相应的调控蛋白质的缺失或者减少,严重时逡逑导致疾病的产生。目前在人类基因组中的miRNA己超过巧00多条,,人类大约1/3逡逑的基因受其调控;上百甚至上千个mRNA接受同一条miRNA的调控,不同的miRNA逡逑也可W同时调控同一条mRNA,从而构成了复杂的调控网络。研究表明,miRNA逡逑的异常表达,包括上调或下调1^^?及miRNA自身的遗传突变与各种肿瘤的发生过程逡逑密切相关,比如miRNA在肿瘤的发生、转化、侵袭和转移过程中都发挥了关键逡逑的作用,因而miRNA能够起到类似癌基因或抑癌基因的作用[7]。逡逑—_-邋邋邋^邋'邋!逡逑\逦W窜''逦1逡逑/?JuuL逡逑.逦\逦/逦I逡逑.逦Nucleus逦I逡逑?一-逦边巧邋NA逦j逡逑Nuclei邋pore邋-导:逦!邋jTtTTTTT!TTTT邋^邋J逡逑_逦/邋V邋L邋I逡逑3.苗城皆3■}D拖巧y逦r姐理码乙s^rna邋|逡逑I逦I
双链被裂解形成单链具有调控功能的miRNA,即成熟miRNA。成熟miRNA逡逑与RNA诱导的沉默复合体结合形成复合物,miRNA与mRNA的3'町R结合,介逡逑导复合物对祀介导转录后基因表达沉默,抑制基因表达巧](如图1.2)。逡逑IJiX逡逑|rDf0si-^逦J逡逑.?一■-?逦-—V邋-逦-逡逑CylDola^i逦一___逦dsRNA邋-邋i逡逑…?:正:.加,“;出。由句:i逡逑的巧心:务逦去邋sIRNA逦■■逡逑mfRNA---..扣捕逦由丑邋u—邋duplex逦.逡逑棘私换逦I邋Unc浀模溴澹慑义稀澹苠义希粒螅铮裕运疲欤椋邋迩慑澹樱襄危樱铮妫舻彦巍桑迉r、逡逑assembly逦■方巧堒马逡逑^挖邋0逦I邋PASO逡逑HIbDsome逦V邋*逡逑X*邋一邋*.、逦/甲…';瓜邋/好—-逡逑.懰巧严评,3——-邋1''叩一-'r?::逦Target逡逑广^__?逦—、、—,逦旧瞧邋/逡逑尸、RISC邋RISC逦巧邋SC逦/逡逑TranslatlonaJ邋repression逦mRN众邋cleavage逡逑图1.2邋miRNA的生物合成巧]。逡逑9逡逑
【学位授予单位】:南京医科大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R735.7
本文编号:2521684
【图文】:
它与信使邋RNA邋(mRNA)的非翻译区(3'邋untransl化edregion,邋3'邋UTR邋)逡逑结合,如果完全配对,则裂解或者切割信使RNA,不完全配对则起到抑制翻译的逡逑作用[4,邋6](见图1.邋1),从而引起相应的调控蛋白质的缺失或者减少,严重时逡逑导致疾病的产生。目前在人类基因组中的miRNA己超过巧00多条,,人类大约1/3逡逑的基因受其调控;上百甚至上千个mRNA接受同一条miRNA的调控,不同的miRNA逡逑也可W同时调控同一条mRNA,从而构成了复杂的调控网络。研究表明,miRNA逡逑的异常表达,包括上调或下调1^^?及miRNA自身的遗传突变与各种肿瘤的发生过程逡逑密切相关,比如miRNA在肿瘤的发生、转化、侵袭和转移过程中都发挥了关键逡逑的作用,因而miRNA能够起到类似癌基因或抑癌基因的作用[7]。逡逑—_-邋邋邋^邋'邋!逡逑\逦W窜''逦1逡逑/?JuuL逡逑.逦\逦/逦I逡逑.逦Nucleus逦I逡逑?一-逦边巧邋NA逦j逡逑Nuclei邋pore邋-导:逦!邋jTtTTTTT!TTTT邋^邋J逡逑_逦/邋V邋L邋I逡逑3.苗城皆3■}D拖巧y逦r姐理码乙s^rna邋|逡逑I逦I
双链被裂解形成单链具有调控功能的miRNA,即成熟miRNA。成熟miRNA逡逑与RNA诱导的沉默复合体结合形成复合物,miRNA与mRNA的3'町R结合,介逡逑导复合物对祀介导转录后基因表达沉默,抑制基因表达巧](如图1.2)。逡逑IJiX逡逑|rDf0si-^逦J逡逑.?一■-?逦-—V邋-逦-逡逑CylDola^i逦一___逦dsRNA邋-邋i逡逑…?:正:.加,“;出。由句:i逡逑的巧心:务逦去邋sIRNA逦■■逡逑mfRNA---..扣捕逦由丑邋u—邋duplex逦.逡逑棘私换逦I邋Unc浀模溴澹慑义稀澹苠义希粒螅铮裕运疲欤椋邋迩慑澹樱襄危樱铮妫舻彦巍桑迉r、逡逑assembly逦■方巧堒马逡逑^挖邋0逦I邋PASO逡逑HIbDsome逦V邋*逡逑X*邋一邋*.、逦/甲…';瓜邋/好—-逡逑.懰巧严评,3——-邋1''叩一-'r?::逦Target逡逑广^__?逦—、、—,逦旧瞧邋/逡逑尸、RISC邋RISC逦巧邋SC逦/逡逑TranslatlonaJ邋repression逦mRN众邋cleavage逡逑图1.2邋miRNA的生物合成巧]。逡逑9逡逑
【学位授予单位】:南京医科大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R735.7
【参考文献】
相关期刊论文 前2条
1 ;miR-93 suppresses proliferation and colony formation of human colon cancer stem cells[J];World Journal of Gastroenterology;2011年42期
2 ;RNA interference and antiviral therapy[J];World Journal of Gastroenterology;2007年39期
本文编号:2521684
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