早期食管癌人群食管黏膜微生态构成

发布时间：2020-05-01 16:59

【摘要】：目的:通过高通量测序技术研究分析早期食管鳞状上皮细胞癌(Early esophageal squamous cell carcinoma,EESCC)人群食管黏膜微生态构成特点。方法:采用前瞻性随机对照的研究方法,在2017年06月至2017年12月期间,对符合入组标准的健康对照(Health control)人群(HC组,n=15)及早期食管鳞状上皮细胞癌患者(EESCC组,n=15)食管粘膜标本进行收集,并行高通量测序及生物信息学处理,对比两组人群的食管黏膜微生态结构特点。结果:本研究共纳入30名研究对象,其中HC组15例,在我院手术并经病理证实为EESCC患者15例。生物信息学显示,HC组中两例样本测序深度不满足生物信息学分析要求予以剔除。EESCC组的平均可操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs)数明显高于HC组(1241.0±445.7vs885.2±212.9,P=0.014)。在门分类水平,EESCC组广古菌门、Kazan-3B-28门相对丰富度高于HC组(P0.05),厚壁菌门的相对丰富度则低于HC组(P0.05)。在属分类水平,EESCC组阿克曼肠道菌属、丛毛单胞菌属、寡养单胞菌属、紫单胞菌属、肠杆菌属的相对丰富度均高于HC组(P0.05),而EESCC组普氏菌属、罗氏菌属、韦荣球菌属、链球菌属、苍白杆菌属、巨型球菌属、肠球菌属、热杆菌属、双歧杆菌属的相对丰富度低(P0.05)。主成份分析(Principal component analysis,PCA)、主坐标分析(Principal coordinates analysis,PCoA)与非度量多维尺度分析(Non-metric multidimensional scaling,NMDS)结果显示EESCC组与HC组菌群结构多样性存在显著差异(P0.05)。LDA Effect Size分析提示,与HC组对比,EESCC组主要特征菌群为丛毛单胞菌属、肠杆菌属。结论:EESCC组主要特征菌群为丛毛单胞菌属、肠杆菌属,其食管黏膜微生物菌群物种多样性高于HC组,菌群构成与健康人群存在显著差异,考虑食管黏膜菌群变化可能与EESCC的发生存在一定关系。
【图文】：

数值,韦恩图,物种数目,橙色

EESCC组 HC组图3.1 EESCC组与HC组平均OTU数值对比后我们根据HC组和EESCC组食管黏膜样品中OTU数目制成韦恩图，蓝CC组，橙色代表HC组，我们可以直观的发现，EESCC组存在的OTU有C组存在2971种，其中EESCC与HC组共有的物种数目为2487种（图3.2

曲线图,曲线图,微生物菌群,α多样性

图3.3 Rarefaction稀释曲线图图3.4 Shannon-Wiener曲线图3.5 Simpson稀释曲线3.2.3 α多样性分析我们通过ACE、Chao1、Observed species曲线用来反映样品内的微生物群落的丰富度，Shannon和Simpson曲线反映样品内多样性，通过分析比较我们可以得出EESCC组微生物菌群物种丰富度高于HC组(图3.6)。
【学位授予单位】：福建医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R735.1

【参考文献】