云南地区乳腺癌患者亚甲基四氢叶酸还原酶单核苷酸多态性与临床风险研究

发布时间：2020-05-03 20:37

【摘要】：[目的]了解云南地区女性乳腺癌患者和正常人群亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性的分布特点,丰富我国不同地区基因多态性样本库,明确营养膳食因素对乳腺疾病的发展作用,为乳腺癌的防治提供新的思路。[方法]采用病例-对照研究手段,在前期研究基础上,收集980例患者及健康志愿者血液标本,提取全血DNA、筛选MTHFR的备选SNP后使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOFMS)筛选结果,结合患者临床诊疗信息、实验室检查结果分析亚组差异。[结果]1.研究根据病例-对照设计共纳入研究案例980例,1:1分配至实验和对照双组(n=490)。调整基线水准后分层,平均年龄分别为47.68±9.86岁、48.01 ±7.98岁,经检验,两组样本所来自的人群总体并无不同(P=0.322)。2.对MTHFR3'端非翻译区UTR及编码区18个候选SNP位点进行了Hardy-Weinberg 平衡检验,筛选出 TREND 法计算rs17884306(P=0.0037)和rs1801394(P=0.0040)时实验组和健康对照组有差异;REC法计算rs1801394(P=0.0196)、DOM法计算rs17884306(P=0.0289)时两组数据有差异。其余各位点、各方法未显示两组有差别。3.按分子分型和激素受体情况分型,发现rs1801394基因多态性G/A位点基因型在健康人群和乳腺癌患者中的分布有差别(OR=0.825,95%CI=0.733-0.917,P=0.004);rs17884306 基因多态性 C/G 位点基因型在健康人群和乳腺癌患者中的分布无差别(OR=0.653,95%CI=0.202-1.104,P=0.076)。4.rs1801394与分子分型中的HER-2阳性乳腺癌有关,该位点呈GG多态性的患者较AG/AA多态性的人群增加乳腺癌罹患风险约44%(OR=0.568,95%CI=0.262-0.874,P=0.042),其他亚型未见两组差异(LuminalA:OR=0.685,95%CI=0.313-1.057,P=0.685;Luminal B:OR=0.952,95%CI=0.736-1.168,P=0.254;TNBC:OR=0.842,95%CI=0.537-1.147,P=0.754)。5.rs1801394与激素受体分型中的ER阳性、ER阴性、PR阳性和PR阴性乳腺癌均无关,亚型分析未见两组差异(ERPositive:OR=0.841,95%CI=0.605-1.277,P=0.324;ER Negative:OR=0.892,95%CI=0.542-1.142,P=0.331;PR Positive:OR=0.842,95%CI=0.608-1.076,P=0.629;PR Negative:OR=0.819,95%CI=0.514-1.104,P=0.282)。6.rs17884306位点无论是分子分型还是激素受体分型,CC型人群和GC/GG型人群的乳腺癌罹患风险均无统计学差别(Luminal A:OR=0.636,95%CI=0.206-1.066,P=0.359;Luminal B:OR=0.656,95%CI=0.305-1.007,P=0.198;HER-2:OR=0.788,95%CI=0.458-1.118,P=0.225;TNBC:OR=0.881,95%CI=0.391-1.371,P=0.333;ER Positive:OR=0.619,95%CI=0.155-1.083,p=0.945;ER Negative:OR=0.787,95%CI=0.087-1.887,P=0.862;PR Positive:OR=0.846,95%CI=0.533-1.119,P=0.384;PRNegative:OR=0.895,95%CI=0.635-1.155,P=0.691)。7.总体患者及亚组分析中,只有“肿瘤大小”及亚组在两个基因频次的人群间存在差异(OR=2.127,95%CI=1.172-3.862,Tumor≤5 P=0.016,5 P=0.012),其余各项特征均未显示两组差异。按分子分型分层统计可见,总体患者的这一差别是由Luminal B型患者中大于5cm的患者贡献的(OR=0.585,95%CI=0.379-0.891,P=0.042),其余各分型、各亚组均未出现此种差异。8.将患者的临床实验室检查结果分类后输入Ref SNPrs17884306和rs1801394进行关联和风险度分析,患者各项指标与其基因多态性均无关联,尚不能证明两基因频次的人群存在差异。[结论]实验组和对照组两组组间均衡,筛选出的RefSNPrs1801394和rs17884306与乳腺癌相关;其余各位点、各方法未显示两组有差别。显性遗传模型分析结果显示rs1801394基因多态性G/A位点基因型在健康人群和乳腺癌患者中的分布有差别(OR=0.825,95%CI=0.733-0.917,P=0.004);rs17884306 基因多态性C/G位点基因型在健康人群和乳腺癌患者中的分布无差别(OR=0.653,95%CI=0.202-1.104,P=0.076)。rs1801394与分子分型中的HER-2阳性乳腺癌有关,该位点呈GG多态性的患者较AG/AA多态性的人群增加乳腺癌罹患风险约44%(OR=0.568,95%CI=0.262-0.874,P=0.042),其他亚型和激素受体分型各型未见两组差异;rs17884306的分子分型和激素受体分型在CC型人群和GC/GG型人群中均无统计学差别。总体的“肿瘤大小”及亚组在两个基因频次的人群间存在差异(OR=2.127,95%CI=1.172-3.862,P0.05),其余各项特征均未显示两组差异,可见患者各项指标与其基因多态性均无关联,尚不能证明两基因频次的人群存在差异。
【学位授予单位】：昆明医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R737.9

【参考文献】