YRDC在肺癌中的表达及其功能分析

发布时间：2020-05-27 01:43

【摘要】：探究功能未知基因在肿瘤中的表达和功能,有助于了解该基因对肿瘤发生发展的影响及其分子机制,对指导癌症治疗具有重要意义。课题组前期研究发现c1orf109所在染色体1p34.1区域存在基因协同共表达特性,YRDC为其中的一个在癌症中预测高表达的基因,该基因命名为YRDC(yrd C N6-threonylcarbamoyl-transferase domain containing),但生物学功能仍不清楚。本论文在前期研究的基础上,重点分析了YRDC基因在肺癌中的表达情况,检测了YRDC基因对肺癌细胞生物学功能的影响,并初步探究了YRDC基因编码蛋白可能的生物学功能。首先,利用生物信息学分析并结合TCGA数据库,研究了YRDC基因在肺癌病例组织中的表达,分析其与不同临床分期、性别、年龄以及吸烟习惯表达关系,进而检测YRDC基因在肺癌细胞系的表达。随后,构建YRDC基因低表达细胞株和YRDC过表达细胞株,观察了YRDC基因肺癌细胞的增殖,迁移和侵袭能力的影响。最后,利用生物信息学预测YRDC相互作用蛋白及其在临床肺癌组织中的表达,并通过构建YRDC原核表达载体,表达纯化YRDC蛋白,进一步确定YRDC蛋白的生物学活性。结果表明,YRDC基因非小细胞肺癌中高表达,但与临床分期、性别、年龄和吸烟习惯无显著差异;YRDC基因在表达下调时,细胞的增殖、迁移和侵袭受到了抑制,而过表达YRDC能促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。YRDC同源结构分析显示,人源YRDC与大肠杆菌的YRDC蛋白结构相似度较低,提示它们的生物学特性可能不同。相互作用蛋白预测分析结果提示,YRDC存在多个相互作用分子,相互作用蛋白预测分析结果提示,YRDC存在多个相互作用分子,其中UPP1、VPS29、TMSB10以及OSGEPL1等蛋白分子在肺癌组织样本中与YRDC存在共表达,由此为进一步的深入研究奠定了基础。蛋白活性检测发现,YRDC具有t RNA修饰所必需的ATP酶活性,并且显著高于大肠杆菌的YRDC蛋白。综上所述,本研究结果证实YRDC基因在肺癌中高水平表达,并且YRDC基因的表达变化能够影响肿瘤细胞的生物学特性,人类的YRDC基因编码蛋白具有t RNA修饰的活性,其分子机制可能和蛋白质的翻译相关。
【图文】：

肺腺癌,癌症

淋巴转移则发生较晚。肺腺癌是肺癌研究中的癌中 YRDC 的整体表达情况A 数据库中的肺腺癌病例数据部分，共有 570 个病例样为 59 个，原发癌类型样本为 515 个，，样本数量足够提供分析。分析每百万个转录本中 YRDC 的转录本数量（图C 基因分布在 13-18 之间，中位数 15 左右，而原发癌样布在 15-25 之间，中位数在 20 左右，统计学上显著高于C 表达量（p<0.01）。基因在肺腺癌病例中的表达明显高于正常样本，癌症中癌症发展变化中具有一定的影响和作用，因此检测癌症映出某个基因对癌症的重要性。YRDC 可能在肺腺癌的，影响到肺腺癌整体的发展过程，在全部的癌症病例中正常样本，体现出 YRDC 在肺腺癌中过量表达的稳定性影响不是随机现象，其背后可能具有某种机制，使得 Y展进程当中。

肺腺癌,病理分期,癌症,基因

肺腺癌中 YRDC 癌症分期表达情况RDC 的整体表达的统计差异性，显示了 YRDC 基因确实在肺腺癌作用。基因在癌症的表达同时可能和癌症病例的癌症分期具有相数据库对癌症病例进行了详细的分期分组，用于分析癌症基因同系。在肺腺癌的不同分期阶段中，基因可能表现出不同的表达趋在不同阶段的表达差异，能够具有针对性的研究该阶段的表达特腺癌病例中 YRDC 在不同癌症分期显示（图 3-2），肺腺癌全部的为 4 个分期，其中病例数量从分期 1 到分期 4 逐渐减少，意味着维持在肺腺癌的第一和第二分期之内。在四个分期中，YRDC 基均高于正常样本，与前文整体表达一致，各分期之间 YRDC 表达没有显著差异。RDC 基因在肺腺癌的分期之间没有表达差异性，提示 YRDC 可能段性表达升高促进癌症的发生发展，或者是 YRDC 基因在整个肺一直发挥某种功能，因此表达量是相对稳定的（图 3-2）。
【学位授予单位】：哈尔滨工业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R734.2

【参考文献】