MDM4单核苷酸多态性与急性髓系白血病相关性研究

发布时间：2020-05-30 07:59

【摘要】：目的:1.研究MDM4基因12个SNPs等位基因及基因型的分布情况。2.探讨MDM4基因单核苷酸多态性(SNP)与急性髓系白血病(AML)相关性。3.研究MDM4基因单体型与急性髓系白血病(AML)之间的关系。方法:1.MDM4基因12个SNPs基因型分布情况与急性髓系白血病发病风险关系收集192例初发AML患者骨髓或外周血及192例健康体检者外周血样本,分别提取全基因组DNA,将MDM4基因12个多态性位点分别设计相应的引物,经聚合酶链式反应(PCR)扩增,所扩增的产物通过高分辨熔解曲线技术(HRM)对多态性位点分别进行基因型分析;分型后各基因型随机抽取3~5个样本进行PCR扩增,所扩增的产物送生工生物工程进行测序验证HRM分型的准确性,比较各个位点病例组与健康对照组基因型分布有无差异。2.检测MDM4基因表达水平提取20例初发AML患者与10例正常对照组骨髓或外周血样本的总RNA,运用Real Time RT-PCR方法检测MDM4基因m RNA的表达水平,并分析病例组与对照组MDM4表达水平是否具有统计学意义。3.采用Haploview软件分析MDM4基因单体型与AML之间的相关性分别统计192例AML患者与192例健康对照组10个SNPs的基因型,按照Haploview软件格式要求录入数据,对MDM4基因10个SNP位点进行基因单体型及连锁不平衡分析。结果:1.MDM4基因12个SNPs中10个位点能顺利进行基因分型,HRM基因分型后各基因型与随机送生工生物工程公司测序结果相符合。MDM4基因rs10900597-G和rs2290854-T等位基因在AML患者中高于健康对照组;与健康对照组相比rs2290854-TT基因型在AML患者中明显升高(P0.05)。2.Real Time RT-PCR方法检测MDM4基因m RNA的表达水平,MDM4基因的表达在各基因型中无显著差异。3.单体型关联分析结果表明,MDM4基因单体型GCTTGGCGGA在AML中的分布比健康对照组高(P0.05);单体型ACTTGGTGGA在AML中的分布比健康对照组低(P0.05),结果具有统计学意义。结论:1.MDM4基因rs10900597-G和rs2290854-T等位基因在AML患者中高于健康对照组;rs2290854-TT基因型在AML患者中明显高于健康对照组。rs2290854-TT可能在AML的发生中起重要作用,可能作为AML易感性的遗传标记。2.MDM4基因单体型GCTTGGCGGA与AML呈正相关;单体型ACTTGGTGGA与AML呈负相关。
【图文】：

基因分型,测序,基因,基因型

山西医科大学硕士学位论文204520429*部分数据来自 NCBI 的 SNP 数据库2.1.2 MDM4 基因 10 个 SNP 基因分型通过高分辨熔解曲线（High Resolution Melting, HRM）分析技术将 192 例 AML患者与 192 例健康对照组进行基因分型，其中 MDM4 基因 12 个 SNP 中有 10 个位点可以成功分型。从各基因型中随机抽取 3 个送基因测序验证分型结果的准确性，HRM 分型法与测序结果呈一致性。MDM4 基因 4 个 SNP 基因分型及测序结果，，见下图 1；其余 6 个 SNP 基因分型结果见下图 2（红色曲线代表 AA 或者 TT 基因型；灰色曲线代表 AG 或者 CT 基因型；蓝色曲线代表 GG 或者 CC 基因型）。

基因分型,等位基因,病例

14图 2 6 个 SNP 基因分型结果2.1.3 病例组与健康对照组 MDM4 基因 10 个 SNP 等位基因及基因型频率与健康对照组相比，rs10900597 和 rs2290854 等位基因在病例组中分布差异具有显著性（P<0.05）；rs10900597-G 等位基因和 rs2290854-T 等位基因的 OR（95%CI）分别为 1.235(1.033-1.478)和 1.246(1.029-1.509)，与 AML 易感性相关。相反，rs10900596, rs1563828, rs4252725, rs4252717, rs10900595, rs4245738, rs4252686 和rs4951393 在病例组和健康对照组差异无统计学意义（见下表 4）。
【学位授予单位】：山西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R733.71

【参考文献】