肝癌细胞中靶向调控Gab2蛋白的miRNA的初步研究
发布时间:2020-12-20 16:09
肝细胞癌(HCC)是全球最流行的恶性肿瘤之一,并且其高死亡率和高复发率一直是困扰临床治疗的难题。随着对HCC发展的分子机制和治疗耐药性认识的增强,临床研究者已经开发出许多分子靶向药物,并成为当前抗HCC药物研究的重点之一。这些药物可能靶向癌症发展中重要的一个或多个关键信号传导通路,例如细胞增殖,细胞凋亡和血管生成等。衔接蛋白Gab2作为支架分子,不仅在细胞异常增殖、侵袭、迁移等病理过程中发挥重要的作用,而且在信号转导中也扮演了重要的角色,使得其在人类癌症的发生、发展中所发挥的作用备受关注。本实验室过往的研究表明,Gab2在肝癌中的表达显著高于癌旁或正常组织细胞,并且过表达Gab2的肿瘤细胞的增殖,迁移及侵袭能力常常高于相应的癌旁或正常组织细胞。肝癌细胞中Gab2的高表达现象是由许多因素与调控机制共同作用形成的,而microRNA的调控表现的至关重要,并且异常表达的microRNA作为生物标志物可以用作HCC早期诊断以及预后治疗的分子靶点,因此我们对靶向调控Gab2蛋白的microRNA进行了探索。本课题利用生物信息学网站及软件对可能调控Gab2的microRNA进行预测,筛选出9个mi...
【文章来源】:厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:89 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1.?Gab2介导的细胞内信号传导途径??Fig.?1-1.?Gab2-mediated?intracellular?signaling?pathway??
然后按照试剂盒所述配置反转录体系,如下:??RNA?1?p,g??SiperMix?for?qPCR?4?jj.L??DNA?remover?1?|j.L??RNase-Water?M?20?|iL??超纯水根据RNA的体积调整补齐至20?pL反应体系反复吹打混匀,再在??PCR仪中42?°C孵育30分钟,85?°C加热10秒终止反应。??(2)?miRNA与普通RNA的反转录有所不同。由于miRNA的长度太短,往往??小于qPCR引物的长度,用mRNA的反转录方法不利于引物结合并且容易引起??非特异性扩增,无法得到足以定量的cDNA。所以,miRNA的反转要求将其序??列进行延长。目前常用的序列延长反转录法包括茎环法和polyA加尾法两种。其??原理如图2-1所示。??
图2-2.重叠延伸PCP??Fig2-2.?Overlap?extension?PCP.??(1)引物F及R为原基因两端特异引物,其中Fm及Rm为设计中间引物,且??引物Fm及Rm中间共享一段序列(至少15?bp左右碱基序列完全匹配),*为突??变点。然后分别用引物?和!^以及Fm和R相互配对进行普通PCR扩增。此??夕卜,值得注意的是因为Taq酶扩增容易造成产物移码突变,PCP扩增时最好选择??P&酶。??(2)回收第I步所得两条PCR产物??(3)将第2步所得两份PCR产物进行混合使其互为模板及引物,加入dNIP、??P&酶及引物F和R进行普通PCR扩增即可获得出定点突变的产物。??Hsa-miR-l8la的结合位点有8个连续的碱基,hsa-miR-9的结合位点有8个??连续的碱基和7个不连续的碱基,我们根据重叠延伸PCR的原理来设计引物将??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Biomarkers for the early diagnosis of hepatocellular carcinoma[J]. Nobuhiro Tsuchiya,Yu Sawada,Itaru Endo,Keigo Saito,Yasushi Uemura,Tetsuya Nakatsura. World Journal of Gastroenterology. 2015(37)
[2]Surgical treatment for liver cancer[J]. Nicole C Tsim,Adam E Frampton,Nagy A Habib,Long R Jiao. World Journal of Gastroenterology. 2010(08)
[3]Tumor vaccine against recurrence of hepatocellular carcinoma[J]. Bao-Gang Peng, Li-Jiang Liang, Qiang He, Ming Kuang, Jia-Ming Lia, Ming-De Lu, Jie-Fu Huang, Hepatobiliary Surgery Department, The First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510080, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
本文编号:2928158
【文章来源】:厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:89 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1.?Gab2介导的细胞内信号传导途径??Fig.?1-1.?Gab2-mediated?intracellular?signaling?pathway??
然后按照试剂盒所述配置反转录体系,如下:??RNA?1?p,g??SiperMix?for?qPCR?4?jj.L??DNA?remover?1?|j.L??RNase-Water?M?20?|iL??超纯水根据RNA的体积调整补齐至20?pL反应体系反复吹打混匀,再在??PCR仪中42?°C孵育30分钟,85?°C加热10秒终止反应。??(2)?miRNA与普通RNA的反转录有所不同。由于miRNA的长度太短,往往??小于qPCR引物的长度,用mRNA的反转录方法不利于引物结合并且容易引起??非特异性扩增,无法得到足以定量的cDNA。所以,miRNA的反转要求将其序??列进行延长。目前常用的序列延长反转录法包括茎环法和polyA加尾法两种。其??原理如图2-1所示。??
图2-2.重叠延伸PCP??Fig2-2.?Overlap?extension?PCP.??(1)引物F及R为原基因两端特异引物,其中Fm及Rm为设计中间引物,且??引物Fm及Rm中间共享一段序列(至少15?bp左右碱基序列完全匹配),*为突??变点。然后分别用引物?和!^以及Fm和R相互配对进行普通PCR扩增。此??夕卜,值得注意的是因为Taq酶扩增容易造成产物移码突变,PCP扩增时最好选择??P&酶。??(2)回收第I步所得两条PCR产物??(3)将第2步所得两份PCR产物进行混合使其互为模板及引物,加入dNIP、??P&酶及引物F和R进行普通PCR扩增即可获得出定点突变的产物。??Hsa-miR-l8la的结合位点有8个连续的碱基,hsa-miR-9的结合位点有8个??连续的碱基和7个不连续的碱基,我们根据重叠延伸PCR的原理来设计引物将??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Biomarkers for the early diagnosis of hepatocellular carcinoma[J]. Nobuhiro Tsuchiya,Yu Sawada,Itaru Endo,Keigo Saito,Yasushi Uemura,Tetsuya Nakatsura. World Journal of Gastroenterology. 2015(37)
[2]Surgical treatment for liver cancer[J]. Nicole C Tsim,Adam E Frampton,Nagy A Habib,Long R Jiao. World Journal of Gastroenterology. 2010(08)
[3]Tumor vaccine against recurrence of hepatocellular carcinoma[J]. Bao-Gang Peng, Li-Jiang Liang, Qiang He, Ming Kuang, Jia-Ming Lia, Ming-De Lu, Jie-Fu Huang, Hepatobiliary Surgery Department, The First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510080, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
本文编号:2928158
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