环状RNA-ZKSCAN1抑制肝癌细胞干性的机制研究

发布时间：2021-03-23 23:04

　　研究背景和目的:环状RNA（circular RNA,circRNAs）是一类不同于线性RNA分子的内源性非编码RNA,没有5’末端帽结构和3’末端poly（A）尾,是以共价键形成的闭合环状结构,其广泛存在于真核细胞中。研究表明大部分circRNAs分子在不同物种间是保守的,同时由于其具有组织及时空表达特异性、不易受RNA酶降解以及在疾病发生分子机理和疾病诊断中的重要潜在价值越来越受到大家的重视,近年来已成为继微小RNA（microRNA,miRNA）和长链非编码RNA（Long non-coding RNA,LncRNA）之后,RNA研究领域的又一全新热点。原发性肝癌（Primary Liver Cancer,PLC）是世界第五大常见恶性肿瘤、第三大肿瘤常见死因。根据组织学类型,可将其分为肝细胞肝癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）、胆管细胞癌（cholangiocarcinoma,ICC）和混合型肝癌。其中,HCC是原发性肝癌的主要组织学类型。我国是肝癌大国,其每年诊断率、新发病例数以及相关致死率都居高不下。肝癌发病隐匿,大部分患者出现临床症状时已处于晚期... 

【文章来源】：中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

高通量测序发现circRNAs在肝癌和癌旁组织中存在表达差异

2. 聚类基因分析中 circ-ZKSCAN1 在肝癌测序样本中异常低表达，且与肝癌干性标EpCAM 表达呈负相关。) 肝组织特征 circRNAs 库。) 10 例肝癌测序样本 IHC (EpCAM)染色结果图片（比例尺 100μm）。) mRNA 及 circRNA 在 EpCAMlow和 EpCAMhigh亚组中表达谱聚类。) 聚类基因分析中与肝癌干性标志物 EpCAM 表达呈负相关的所有 circRNAs。以上研究中，我们运用高通量测序技术对 10 对肝癌配对样本进行了测circRNAs 和 mRNA 表达谱数据，证实 circRNAs 在肝癌和癌旁组织中存之后将肝脏癌旁 circRNAs 表达谱数据与已有其它组织来源的 circRNAs 比较，构建了肝组织特征 circRNAs 库；进一步利用聚类基因分析筛选出癌干细胞分子表面标志物 EpCAM 呈负相关的 circRNAs，最终从中挑NA-ZKSCAN1 进行深入研究。

海军军医大学硕士学位论文中肿瘤细胞的增殖有关[30]。在大脑中可以调节γ-氨基丁酸受体的表达[31]。ZKSCAN1基因可形成多种环状 RNA，在我们的测序中，检测到的是 hsa_circ_0001727；如图 2A所示，circZKSCAN1是定位于7号染色体ZKSCAN1基因2-3号外显子内的环状RNA。之前 GENES & DEVELOPMENT 有文献报道其通过使用 ZKSCAN1 基因位于 2 号外显子上游和 3 号外显子下游的 Alu 重复序列来实现自身环化[32]（图 2B）。而这一结果与我们 circRNA 高通量测序的结果相一致。A


本文编号：3096564