MDM2基因多态性与结直肠癌易感性的关联研究
本文关键词:MDM2基因多态性与结直肠癌易感性的关联研究,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:目的:鼠双微基因(Mouse double mimute 2,MDM2)是一种与人类恶性肿瘤发病风险密切相关的癌基因。本实验将通过病例-对照研究方法,探讨MDM2基因的rs2279744及rs117039649两个位点的单核苷酸多态性与结直肠癌发病风险之间的关系,希望能为结直肠癌的早期诊断和治疗在分子生物学水平上提供一定的理论依据。方法:选取在2014年2月-2016年2月间就诊于河北医科大学第四医院的结直肠癌患者共371例(其中直肠癌患者209例、结肠癌患者162例)作为实验组和健康人群199例作为对照组,运用病例-对照研究方法对其进行研究。运用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法对外周血白细胞中的DNA进行提取,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法对MDM2基因的rs2279744及rs117039649两个位点单核甘酸多态性的等位基因及基因型频率分布情况进行检测。使用SPSS13.0版软件包(SPSS Company,Chicago,Illionis,USA)对所得到的实验数据进行统计学分析。运用t检验分别对结肠癌组、直肠癌组与健康对照组之间的年龄情况是否存在差异进行统计学分析;并运用χ2检验分别对结肠癌组、直肠癌组与健康对照组的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率是否存在统计学差异进行分析。利用Hardy-Weinberg对两个组别基因型频率的分布进行连锁平衡分析。应用Logistic回归法计算比值比(odds ratio,OR)及95%可信区间(confidence interval,CI)。结果:1对MDM2基因rs2279744及rs117039649两位点在健康对照组人群中的基因型频率应用Hardy-weinberg定律方法进行遗传平衡检测,其结果说明该人群符合遗传平衡法则(P0.05)。2 MDM2基因rs2279744位点的G和T等位基因在健康对照组和直肠癌病例组中的分布频率分别为:59.29%、40.71%和67.70%、32.30%,两组数据之间比较,其P值为0.01,P0.05,差异有统计学意义;MDM2基因rs2279744位点的G和T等位基因在健康对照组和结肠癌病例组中的频率分别为:59.29%、40.71%和67.90%、32.10%,两组数据之间比较,其P值为0.01,P0.05,差异有统计学意义。MDM2基因rs2279744位点的GG、GT、TT基因型在健康对照组和直肠癌病例组中所占频率分别为:35.18%、48.24%、16.58%和53.59%、28.23%、18.18%,两组通过OR分析得出:GG基因型与GT基因型相比,其OR=2.603,95%CI=1.68-4.05;TT基因型与GT基因型相比,其OR=1.874,95%CI=1.06-3.31,提示GG基因型及TT基因型均可增加直肠癌发病的风险。MDM2基因rs2279744位点的GG、GT、TT基因型在健康对照组和结肠癌病例组中所占频率分别为:35.18%、48.24%、16.58%和54.32%、27.16%、18.52%,两组通过OR分析得出:GG基因型与GT基因型相比,其OR=2.743,95%CI=1.71-4.41;TT基因型与GT基因型相比,其OR=1.983,95%CI=1.08-3.56,提示GG基因型及TT基因型均可增加结肠癌发病的风险。3 MDM2基因rs117039649位点的G和C等位基因在健康对照组和结肠癌病例组中的分布频率分别为:98.74%、1.26%和98.77%、1.23%,两组数据之间比较,其P值为0.97,P0.05,差异无统计学意义。MDM2基因rs117039649位点的G和C等位基因在健康对照组和直肠癌病例组中的分布频率分别为:98.74%、1.26%和99.28%、0.72%,两组数据之间比较,其P值为0.43,P0.05,差异无统计学意义。MDM2基因rs117039649位点的GG和GC基因型在健康对照组和直肠癌病例组中的频率分别为:97.98%、2.02%和98.56%、1.44%,两组通过OR分析得出:GC基因型与GG基因型相比,其OR=0.565,95%CI=0.13-2.39,提示GC基因型可能与直肠癌的发病之间无明显相关性。MDM2基因rs117039649位点的GG和GC基因型在健康对照组和结肠癌病例组中的频率分别为:97.98%、2.02%和97.53%、2.47%,两组通过OR分析得出:GC基因型与GG基因型相比,其OR=0.982,95%CI=0.26-3.72,提示GC基因型可能与结肠癌的发病之间无明显相关性。4运用软件(EH和2LD)对MDM2基因的rs2279744和rs117039649两位点之间进行联合分析后发现:在直肠癌病例组中两位点之间符合连锁不平衡关系(D'=0.492),其中在对照组中rs2279744G-rs117039649G单体型所占频率为59.04%,为最常见的单体型,其次为rs2279744T-rs117039649G单体型(39.70%)、rs2279744T-rs117039649C单体型(1.01%)和rs2279744G-rs117039649C单体型(0.25%)。人群中rs2279744G-rs117039649G单体型可能增加直肠癌发病的风险(OR=1.438,95%CI=1.08-1.92)。rs2279744T-rs117039649G单体型可能降低直肠癌发病的风险(OR=0.709,95%CI=0.53-0.95)。人群中rs2279744G-rs117039649C单体型和rs2279744T-rs117039649C单体型可能与直肠癌的发病风险之间无相关性。在结肠组中两位点之间存在连锁不平衡关系(D'=0.021)。人群中rs2279744G-rs117039649G单体型可能增加结肠癌发病的风险(OR=1.447,95%CI=1.07-1.97)。rs2279744T-rs117039649G单体型可能降低结肠癌发病的风险(OR=0.688,95%CI=0.51-0.94)。rs2279744G-rs117039649C单体型和rs2279744T-rs117039649C单体型可能与结肠癌发病的风险之间无相关性。结论:1 MDM2基因rs2279744位点的基因多态性可能与结直肠癌发病风险存在相关性,GG基因型和TT基因型与GT基因型相比均增加了结直肠癌的发病风险。2 MDM2基因rs117039649位点的基因多态性可能与结直肠癌发病风险之间无明显相关性。3在结直肠癌病例组中MDM2基因rs2279744及rs117039649两个位点之间存在连锁不平衡现象。人群中rs2279744G-rs117039649G单体型可能增加结直肠癌发病的风险。rs2279744T-rs117039649G单体型可能降低结直肠癌发病的风险。
【关键词】:结直肠癌 MDM2基因 rs2279744/rs117039649位点 基因多态性 易感性
【学位授予单位】:河北医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R735.34
【目录】:
- 中文摘要4-7
- 英文摘要7-10
- 前言10-13
- 材料与方法13-20
- 结果20-23
- 附图23-27
- 附表27-31
- 讨论31-35
- 结论35-36
- 参考文献36-42
- 综述 MDM2 基因与恶性肿瘤相关性的研究进展42-58
- 参考文献50-58
- 致谢58-59
- 个人简历59
【参考文献】
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,本文编号:323577
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