蛋白芯片和GEO筛选食管鳞癌相关抗原及其自身抗体诊断价值评价
发布时间：2021-10-09 14:38
食管癌（esophageal cancer,EC）是最常见的消化道癌症之一,在我国,食管鳞状细胞癌（食管鳞癌,esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）患者占食管癌患者的90%以上,因起病隐匿,早期症状不明显,许多患者初诊时已处于晚期,预后较差。肿瘤相关抗原（tumor associated antigen,TAA）自身抗体可在肿瘤患者的血清中稳定存在,并可以在临床症状出现的数月甚至数年之前被检测到,因此,具有作为肿瘤早期免疫诊断标志物的潜力。目的本研究通过定制癌症驱动基因编码的蛋白芯片和对GEO数据库中食管鳞癌相关数据集的生物信息学分析,结合酶联免疫吸附实验（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）技术,对食管鳞癌相关自身抗体进行筛选和验证,探索最优的食管鳞癌诊断模型,为建立一种非侵入性的食管鳞癌早期诊断技术提供一定的科学依据。方法1.蛋白质芯片筛选食管鳞癌相关抗原基于癌症驱动基因编码的蛋白质定制Focused array人类蛋白质芯片,检测90例食管鳞癌患者和50例正常人血清中的抗TAA自身抗体的表达水平...
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
基金资助
摘要
Abstract
英文缩略词表
1 引言
2 材料与方法
2.1 基于蛋白质芯片筛选食管鳞癌相关抗原
2.1.1 蛋白芯片的检测
2.1.2 数据预处理及分析策略
2.2 基于GEO数据库筛选食管鳞癌相关抗原
2.2.1 GEO数据库中差异基因分析
2.2.2 功能和通路富集分析
2.2.3 GEPIA数据库验证
2.3 应用间接ELISA确认抗TAA自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
2.3.1 实验设计及血清标本
2.3.2 主要试剂及仪器设备
2.3.3 主要溶液的配制
2.3.4 实验方法及步骤
2.3.5 统计分析方法
3 结果
3.1 蛋白芯片筛选的候选TAA
3.1.1 蛋白芯片的检测结果及稳定性
3.1.2 食管鳞癌组和对照组中差异表达的候选TAA
3.1.3 芯片检测中候选TAA的基本信息
3.2 GEO数据库筛选的候选TAA
3.2.1 食管鳞癌的差异表达基因筛选
3.2.2 差异基因的富集分析及验证
3.2.3 候选TAA的基本信息
3.3 评价抗TAA自身抗体对食管鳞癌的诊断价值及构建诊断模型
3.3.1 研究对象的基本特征
3.3.2 训练集中单个自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
3.3.3 验证集中单个自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
3.3.4 食管鳞癌诊断模型的构建与评价
3.3.5 最优诊断模型对不同临床特征的食管鳞癌的诊断价值评价
4 讨论
4.1 蛋白芯片技筛选TAA
4.2 GEO数据库筛选TAA
4.3 9种抗TM自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
4.4 抗TAA自身抗体组合对食管鳞癌的诊断价值
4.5 本研究的优缺点
4.6 工作展望
5 结论
参考文献
综述 肿瘤相关抗原自身抗体在恶性肿瘤中的应用
参考文献
附录
个人简历及学术论文发表情况
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]抗HER2酪氨酸激酶抑制剂在脑转移乳腺癌中的应用进展[J]. 张雪梅,田武国,张晓华,杨秀木. 现代医药卫生. 2020(05)
[2]我国消化道早癌筛查的挑战和展望[J]. 杜奕奇,李兆申. 第二军医大学学报. 2020(01)
[3]Autoantibodies: Potential clinical applications in early detection of esophageal squamous cell carcinoma and esophagogastric junction adenocarcinoma[J]. Yi-Wei Xu,Yu-Hui Peng,Li-Yan Xu,Jian-Jun Xie,En-Min Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(34)
[4]抗肝癌小分子酪氨酸激酶抑制剂的临床研究进展[J]. 常青青,彭英,王广基,孙建国. 中国临床药理学与治疗学. 2019(08)
[5]肺癌血清学肿瘤标志物的研究[J]. 谢田田,孙晓晓,马静,谢龙祥,张璐,厉永强,韩亚莉,郭向前,张祎捷,闫中义. 河南大学学报(医学版). 2018(04)
[6]抑制葡萄糖转运蛋白1表达可降低神经母细胞瘤细胞的增殖、侵袭和迁移能力[J]. 彭妍,邢思宁,唐瑚应,刘星,汪长东,易发平,刘革力,武向梅. 细胞与分子免疫学杂志. 2018(11)
[7]肿瘤自身抗体标志物的研究进展[J]. 李阳,郭书娟,陶生策. 生物产业技术. 2018(02)
[8]癌症早期诊断可拯救生命和降低医疗费用[J]. 本刊编辑部. 中国肿瘤临床与康复. 2017(03)
[9]食管癌术后存活率及生活质量的相关因素分析[J]. 李毅成. 泰山医学院学报. 2017(01)
[10]食管癌发病水平及变化趋势[J]. 曹小琴,孙喜斌. 中国肿瘤临床. 2016(21)
博士论文
[1]外周血肿瘤相关抗原自身抗体水平与非小细胞肺癌早期诊断与预后的关系研究[D]. 赵欢.吉林大学 2019
[2]候选食管癌相关抗原的筛选鉴定及其对食管鳞癌的诊断价值[D]. 张红飞.郑州大学 2017
硕士论文
[1]肿瘤相关抗原自身抗体联合检测对胃癌诊断价值的评价[D]. 王帅兵.郑州大学 2018
本文编号：3426585
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
基金资助
摘要
Abstract
英文缩略词表
1 引言
2 材料与方法
2.1 基于蛋白质芯片筛选食管鳞癌相关抗原
2.1.1 蛋白芯片的检测
2.1.2 数据预处理及分析策略
2.2 基于GEO数据库筛选食管鳞癌相关抗原
2.2.1 GEO数据库中差异基因分析
2.2.2 功能和通路富集分析
2.2.3 GEPIA数据库验证
2.3 应用间接ELISA确认抗TAA自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
2.3.1 实验设计及血清标本
2.3.2 主要试剂及仪器设备
2.3.3 主要溶液的配制
2.3.4 实验方法及步骤
2.3.5 统计分析方法
3 结果
3.1 蛋白芯片筛选的候选TAA
3.1.1 蛋白芯片的检测结果及稳定性
3.1.2 食管鳞癌组和对照组中差异表达的候选TAA
3.1.3 芯片检测中候选TAA的基本信息
3.2 GEO数据库筛选的候选TAA
3.2.1 食管鳞癌的差异表达基因筛选
3.2.2 差异基因的富集分析及验证
3.2.3 候选TAA的基本信息
3.3 评价抗TAA自身抗体对食管鳞癌的诊断价值及构建诊断模型
3.3.1 研究对象的基本特征
3.3.2 训练集中单个自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
3.3.3 验证集中单个自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
3.3.4 食管鳞癌诊断模型的构建与评价
3.3.5 最优诊断模型对不同临床特征的食管鳞癌的诊断价值评价
4 讨论
4.1 蛋白芯片技筛选TAA
4.2 GEO数据库筛选TAA
4.3 9种抗TM自身抗体对食管鳞癌的诊断价值
4.4 抗TAA自身抗体组合对食管鳞癌的诊断价值
4.5 本研究的优缺点
4.6 工作展望
5 结论
参考文献
综述 肿瘤相关抗原自身抗体在恶性肿瘤中的应用
参考文献
附录
个人简历及学术论文发表情况
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]抗HER2酪氨酸激酶抑制剂在脑转移乳腺癌中的应用进展[J]. 张雪梅,田武国,张晓华,杨秀木. 现代医药卫生. 2020(05)
[2]我国消化道早癌筛查的挑战和展望[J]. 杜奕奇,李兆申. 第二军医大学学报. 2020(01)
[3]Autoantibodies: Potential clinical applications in early detection of esophageal squamous cell carcinoma and esophagogastric junction adenocarcinoma[J]. Yi-Wei Xu,Yu-Hui Peng,Li-Yan Xu,Jian-Jun Xie,En-Min Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(34)
[4]抗肝癌小分子酪氨酸激酶抑制剂的临床研究进展[J]. 常青青,彭英,王广基,孙建国. 中国临床药理学与治疗学. 2019(08)
[5]肺癌血清学肿瘤标志物的研究[J]. 谢田田,孙晓晓,马静,谢龙祥,张璐,厉永强,韩亚莉,郭向前,张祎捷,闫中义. 河南大学学报(医学版). 2018(04)
[6]抑制葡萄糖转运蛋白1表达可降低神经母细胞瘤细胞的增殖、侵袭和迁移能力[J]. 彭妍,邢思宁,唐瑚应,刘星,汪长东,易发平,刘革力,武向梅. 细胞与分子免疫学杂志. 2018(11)
[7]肿瘤自身抗体标志物的研究进展[J]. 李阳,郭书娟,陶生策. 生物产业技术. 2018(02)
[8]癌症早期诊断可拯救生命和降低医疗费用[J]. 本刊编辑部. 中国肿瘤临床与康复. 2017(03)
[9]食管癌术后存活率及生活质量的相关因素分析[J]. 李毅成. 泰山医学院学报. 2017(01)
[10]食管癌发病水平及变化趋势[J]. 曹小琴,孙喜斌. 中国肿瘤临床. 2016(21)
博士论文
[1]外周血肿瘤相关抗原自身抗体水平与非小细胞肺癌早期诊断与预后的关系研究[D]. 赵欢.吉林大学 2019
[2]候选食管癌相关抗原的筛选鉴定及其对食管鳞癌的诊断价值[D]. 张红飞.郑州大学 2017
硕士论文
[1]肿瘤相关抗原自身抗体联合检测对胃癌诊断价值的评价[D]. 王帅兵.郑州大学 2018
本文编号：3426585
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