婴儿血管瘤长链非编码RNA与mRNA表达谱分析

发布时间：2021-12-30 11:20

　　目的研究增殖期与消退期婴儿血管瘤（IH）长链非编码RNA（lncRNA）与mRNA的差异表达情况。方法 2019年1-3月在四川大学华西医院小儿外科收集行手术切除治疗的8例IH组织（增殖期与消退期各4例）,运用基因芯片技术筛选差异表达（P < 0.05,差异倍数≥ 1.5）lncRNA和mRNA,并用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术对芯片结果进行验证。同时,应用生物信息学方法,对差异基因进行GO功能和KEGG通路分析,并构建lncRNA-mRNA共表达网络,预测差异lncRNA的顺式作用靶基因。结果通过基因芯片技术共筛选出405条差异lncRNA（108条下调,297条上调）与772条差异mRNA（107条下调,665条上调）。qRT-PCR验证4条lncRNA（n335248、ENST00000450864、n333319和n335185）与4条mRNA（EDNRA、IFI6、HK2与ITGA1）的表达,结果与基因芯片检测结果一致。GO与KEGG富集分析发现,差异mRNA主要参与血管凝固、轴突导向、血管生成和细胞黏附等生物过程,差异mRNA主要富集在代谢通路、细胞局部黏... 

【文章来源】：中华皮肤科杂志. 2020,53(07)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]婴儿血管瘤发病过程中的关键信号通路[J]. 杨开颖,陈思源,吉毅.  国际皮肤性病学杂志. 2017 (06)



本文编号：3558091