FASN基因的原核表达及生物信息学分析
发布时间:2022-01-03 03:56
脂肪酸合成酶(FASN)在生物体内起着重要的作用,主要参与恶性肿瘤的数量调控。本研究旨在构建pET28a-FASN原核表达载体,并表达重组His-FASN蛋白,对该基因进行结构与功能的生物信息学分析。设计FASN基因特异性引物,通过PCR扩增获得的目的基因与原核表达载体pET28a连接,经IPTG诱导表达His-FASN蛋白。获得基因片段大小为1 320 bp,编码440个氨基酸;成功构建至pET28a原核表达载体,通过优化表达,确定在温度为35℃、IPTG浓度0.5 mmol/L、诱导时间为6 h的条件下融合蛋白表达量较高,获得蛋白大小约为53 kD;生物信息学分析结果表明FASN基因编码的蛋白是一个不稳定且具有亲水性的蛋白,不存在信号肽及跨膜区,可成为蛋白激酶磷酸化位点有12个Ser、5个Thr、3个Tyr。此外,从蛋白相互作用网络中发现,相互作用的蛋白包括主要酰基辅酶A合成酶长链家族成员及乙酰辅酶A羧化酶家族成员,为开发抑制剂药物提供了理论依据。
【文章来源】:基因组学与应用生物学. 2020,39(03)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
FASN基因PCR产物琼脂糖凝胶电泳
重组质粒pET28a-FASN的菌液PCR及双酶切鉴定
利用ExPASy网站中的ProtParam工具对人类FASN基因编码的氨基酸序列进行分析显示:FASN所编码的蛋白质由522个氨基酸组成,其中亮氨酸含量最高达13.0%,比其它氨基酸的含量大很多。FASN编码蛋白质分子量大小为57.466 13 kD,分子式为C2515H3999N725O773S22,等电点理论值为6.08,原子总数8 034,不稳定系数为41.70,说明FASN基因编码的蛋白是一个不稳定蛋白;总平均亲水性为-0.216,说明FASN基因编码的蛋白是一个亲水蛋白。图4 融合蛋白His-FASN的不同时间的诱导表达
【参考文献】:
期刊论文
[1]GPC3基因的结构与功能生物信息学预测[J]. 腾桥,夏丽洁,张富春. 基因组学与应用生物学. 2018(03)
[2]脂肪酸合成酶在胰腺癌细胞凋亡过程中的作用[J]. 苗常青,许静,王军,沙焕臣,王凯飞,李晓青,彭波. 西安交通大学学报(医学版). 2015(06)
[3]肿瘤细胞脂肪酸合成酶的研究进展[J]. 蓝英,张哲. 中国老年学杂志. 2015(11)
[4]脂肪酸合成酶抑制剂及其抗肿瘤作用研究进展[J]. 陈一婧,张厚德. 中国现代医生. 2015(15)
[5]脂肪酸合成酶与疾病[J]. 占敏霞,巫冠中. 亚太传统医药. 2012(09)
[6]脂肪酸合成酶抑制剂的研究进展[J]. 徐晓伟,王晓奎,李松. 国际药学研究杂志. 2009(02)
[7]脂肪酸合成酶与乳腺癌[J]. 王书云,花天放. 中国临床营养杂志. 2002(03)
本文编号:3565519
【文章来源】:基因组学与应用生物学. 2020,39(03)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
FASN基因PCR产物琼脂糖凝胶电泳
重组质粒pET28a-FASN的菌液PCR及双酶切鉴定
利用ExPASy网站中的ProtParam工具对人类FASN基因编码的氨基酸序列进行分析显示:FASN所编码的蛋白质由522个氨基酸组成,其中亮氨酸含量最高达13.0%,比其它氨基酸的含量大很多。FASN编码蛋白质分子量大小为57.466 13 kD,分子式为C2515H3999N725O773S22,等电点理论值为6.08,原子总数8 034,不稳定系数为41.70,说明FASN基因编码的蛋白是一个不稳定蛋白;总平均亲水性为-0.216,说明FASN基因编码的蛋白是一个亲水蛋白。图4 融合蛋白His-FASN的不同时间的诱导表达
【参考文献】:
期刊论文
[1]GPC3基因的结构与功能生物信息学预测[J]. 腾桥,夏丽洁,张富春. 基因组学与应用生物学. 2018(03)
[2]脂肪酸合成酶在胰腺癌细胞凋亡过程中的作用[J]. 苗常青,许静,王军,沙焕臣,王凯飞,李晓青,彭波. 西安交通大学学报(医学版). 2015(06)
[3]肿瘤细胞脂肪酸合成酶的研究进展[J]. 蓝英,张哲. 中国老年学杂志. 2015(11)
[4]脂肪酸合成酶抑制剂及其抗肿瘤作用研究进展[J]. 陈一婧,张厚德. 中国现代医生. 2015(15)
[5]脂肪酸合成酶与疾病[J]. 占敏霞,巫冠中. 亚太传统医药. 2012(09)
[6]脂肪酸合成酶抑制剂的研究进展[J]. 徐晓伟,王晓奎,李松. 国际药学研究杂志. 2009(02)
[7]脂肪酸合成酶与乳腺癌[J]. 王书云,花天放. 中国临床营养杂志. 2002(03)
本文编号:3565519
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3565519.html
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