lncRNA-TUSC7标签SNPs与胃癌易感性关联研究及初步功能验证
发布时间:2022-01-07 12:07
胃癌(Gastric Cancer,GC)在男性和女性的发病率分别位于全球恶性肿瘤发病顺位的第四位和第五位,虽然近几年其发病率和死亡率均有下降趋势,但在韩国、日本、中国,胃癌的发病率仍然很高,其发病率和死亡率仍位于中国消化道恶性肿瘤的首位。越来越多的研究表明,长链非编码RNA(lncRNAs)最近已被确认为在胃癌的发生和发展中发挥重要作用,有望成为胃癌早期诊断和预后的生物标志物,其中,肿瘤抑制候选基因-7(TUSC7)在癌症包括结直肠癌、急性髓系白血病、脑胶质瘤、胃癌等肿瘤的的发生发展中发挥着重要作用。然而TUSC7的单核苷酸多态性(SNPs)与胃癌易感性的关系及其TUSC7发挥功能的机制尚不清楚。目的本研究的目的是探索lncRNA-TUSC7的3个SNPs(rs12494960,rs1518338,rs2867837)与胃癌遗传易感性的相关性及lncRNA-TUSC7遗传变异的初步功能验证。方法(1)结合多种数据库,查阅国内外胃癌相关lncRNAs文献,利用NCBI dbSNP数据库,然后通过生物信息学方法筛选出胃癌相关的差异表达的lncRNAs并利用haploview筛选其标签SN...
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.1双荧光素酶报告基因质粒结构图
结果3.2 基因分型3.2.1 凝胶电泳结果TUSC7 rs12494960 位点的酶切电泳图(见图 1.2):泳道 M 为 泳道 1 为 AC 基因型,片段长度为 210bp、111bp 及 321bp 的三条带AA 纯合突变基因型,片段长度为 210bp、111b 两条条带;泳道 3 为片段长度为 321bp 的一条带。
图 1.3 TUSC7 rs1518338 位点的酶切电泳图谱DNA Ladder;1 道:rs1518338CC 基因型;2 道:rs1518338 GG 基因C 基因型867837 位点酶切电泳跑胶图(见图 1.4):泳道 M 为 DNA L合突变基因型,82bp、113bp 及 195bp 三条带;泳道 2 为 195bp 一条带;泳道 3 为 GG 纯合突变基因型,长为 82bp 及
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国胃癌流行病学现状[J]. 左婷婷,郑荣寿,曾红梅,张思维,陈万青. 中国肿瘤临床. 2017(01)
[2]Circulating micro RNAs and long non-coding RNAs in gastric cancer diagnosis:An update and review[J]. Ya-Kai Huang,Jian-Chun Yu. World Journal of Gastroenterology. 2015(34)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]Trend Analysis of Cancer Mortality in the Jinchang Cohort, China,2001-2010[J]. QU Hong Mei,BAI Ya Na,CHENG Ning,DAI Min,ZHENG Tong Zhang,WANG Dennis,LI Hai Yan,HU Xiao Bin,LI Juan Sheng,REN Xiao Wei,SHANG Hui. Biomedical and Environmental Sciences. 2015(05)
[5]Molecular diagnosis and therapy for occult peritoneal metastasis in gastric cancer patients[J]. Shunsuke Kagawa,Kunitoshi Shigeyasu,Michihiro Ishida,Megumi Watanabe,Hiroshi Tazawa,Takeshi Nagasaka,Yasuhiro Shirakawa,Toshiyoshi Fujiwara. World Journal of Gastroenterology. 2014(47)
[6]胃癌病因学的研究进展[J]. 万晶晶,马兴刚. 医学综述. 2014(14)
[7]Role of microRNAs in gastric cancer[J]. Hideyuki Ishiguro,Masahiro Kimura,Hiromitsu Takeyama. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[8]History of Helicobacter pylori,duodenal ulcer,gastric ulcer and gastric cancer[J]. David Y Graham. World Journal of Gastroenterology. 2014(18)
[9]Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. ZHU JuanJuan,FU HanJiang,WU YongGe,ZHENG XiaoFei. Science China(Life Sciences). 2013(10)
[10]重庆市某4所中小学学生心理健康状况MHT问卷调查分析[J]. 宁源,孔亚,温茂霖,王丽,张玲,张勇,曾缓,韩令力,赵勇. 重庆医学. 2013(22)
本文编号:3574515
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.1双荧光素酶报告基因质粒结构图
结果3.2 基因分型3.2.1 凝胶电泳结果TUSC7 rs12494960 位点的酶切电泳图(见图 1.2):泳道 M 为 泳道 1 为 AC 基因型,片段长度为 210bp、111bp 及 321bp 的三条带AA 纯合突变基因型,片段长度为 210bp、111b 两条条带;泳道 3 为片段长度为 321bp 的一条带。
图 1.3 TUSC7 rs1518338 位点的酶切电泳图谱DNA Ladder;1 道:rs1518338CC 基因型;2 道:rs1518338 GG 基因C 基因型867837 位点酶切电泳跑胶图(见图 1.4):泳道 M 为 DNA L合突变基因型,82bp、113bp 及 195bp 三条带;泳道 2 为 195bp 一条带;泳道 3 为 GG 纯合突变基因型,长为 82bp 及
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国胃癌流行病学现状[J]. 左婷婷,郑荣寿,曾红梅,张思维,陈万青. 中国肿瘤临床. 2017(01)
[2]Circulating micro RNAs and long non-coding RNAs in gastric cancer diagnosis:An update and review[J]. Ya-Kai Huang,Jian-Chun Yu. World Journal of Gastroenterology. 2015(34)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]Trend Analysis of Cancer Mortality in the Jinchang Cohort, China,2001-2010[J]. QU Hong Mei,BAI Ya Na,CHENG Ning,DAI Min,ZHENG Tong Zhang,WANG Dennis,LI Hai Yan,HU Xiao Bin,LI Juan Sheng,REN Xiao Wei,SHANG Hui. Biomedical and Environmental Sciences. 2015(05)
[5]Molecular diagnosis and therapy for occult peritoneal metastasis in gastric cancer patients[J]. Shunsuke Kagawa,Kunitoshi Shigeyasu,Michihiro Ishida,Megumi Watanabe,Hiroshi Tazawa,Takeshi Nagasaka,Yasuhiro Shirakawa,Toshiyoshi Fujiwara. World Journal of Gastroenterology. 2014(47)
[6]胃癌病因学的研究进展[J]. 万晶晶,马兴刚. 医学综述. 2014(14)
[7]Role of microRNAs in gastric cancer[J]. Hideyuki Ishiguro,Masahiro Kimura,Hiromitsu Takeyama. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[8]History of Helicobacter pylori,duodenal ulcer,gastric ulcer and gastric cancer[J]. David Y Graham. World Journal of Gastroenterology. 2014(18)
[9]Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. ZHU JuanJuan,FU HanJiang,WU YongGe,ZHENG XiaoFei. Science China(Life Sciences). 2013(10)
[10]重庆市某4所中小学学生心理健康状况MHT问卷调查分析[J]. 宁源,孔亚,温茂霖,王丽,张玲,张勇,曾缓,韩令力,赵勇. 重庆医学. 2013(22)
本文编号:3574515
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