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生物信息学分析AURKB和KIF18B的协同表达在肾透明细胞癌发展中的重要意义

发布时间:2022-10-09 17:56
  目的:泌尿系统肿瘤的发病现状一直是研究者们的关注重点,其最常见的肿瘤类型之一是肾细胞癌(Renal Cell Carcinoma,RCC),肾细胞癌的最常见亚型则为肾透明细胞癌亚型(clear cell Renal Cell Carcinoma,ccRCC),ccRCC的高转移率和高死亡率一直影响着该类癌症的治疗。肾透明细胞癌发生和发展的分子生物学机制尚未完全阐明,研究肾透明细胞癌的分子机制具有重要意义。如今,生物信息学方法已经在癌症生物学领域得到广泛应用,被用来协助寻找癌症生物标记物和治疗靶标。本研究我们利用开放的生物信息学数据库寻找与肿瘤发生进展相关的潜在治疗靶点,可能为ccRCC的临床治疗做出贡献。研究方法:我们首先从人类肿瘤基因组(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中获取肾透明细胞癌的表达谱,共包含539例ccRCC样本以及72例癌旁组织样本。然后,我们利用“edgeR”包获取在ccRCC患者与癌旁组织,III/IV期ccRCC患者与I/II期ccRCC患者中皆差异表达的基因,筛选出随着ccRCC病程进展上调的基因,最终选择分析上调基因AURKB、... 

【文章页数】:48 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
英文缩略语
1 前言
2 材料与方法
    2.1 收集患者数据
    2.2 筛选差异表达基因
    2.3 相关性分析
    2.4 GEO数据集验证
    2.5 临床病理参数分析
    2.6 生存分析
    2.7 通路富集分析
    2.8 统计学分析
3 结果
    3.1 AURKB和 KIF18B随ccRCC进展表达水平上调且具有密切的相关性
    3.2 GEO验证AURKB与KIF18B随ccRCC进展表达水平上调且具有相关性
    3.3 AURKB,KIF18B表达与ccRCC临床病理特征的关系
    3.4 AURKB与KIF18B协同高表达与ccRCC不良预后相关
    3.5 KEGG通路富集分析
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历


【参考文献】:
期刊论文
[1]Aurora激酶抑制剂MK-0457治疗多种恶性血液病的研究进展[J]. 梁艺琼,陈宝安,陈亚利.  中国实验血液学杂志. 2009(03)



本文编号:3689095

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