长链非编码RNA在Kaposi肉瘤组织中的表达

发布时间：2022-11-06 09:31

　　目的:检测长链非编码RNA（lncRNA）在Kaposi肉瘤组织和瘤旁正常组织中的表达。方法:利用高通量lncRNA芯片技术检测5例Kaposi肉瘤组织及其瘤旁正常组织的lncRNA表达谱,筛选差异表达的lncRNA,并利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）方法进一步验证芯片结果,同时采用生物信息学分析差异lncRNA靶基因KEGG通路注释。结果:与正常组织相比,Kaposi肉瘤组织中共筛选出717个差异表达的lncRNA,其中上调表达408个,下调表达309个;与正常组织相比,lnc-PXDN-3:3和lnc-PERP-10:2在Kaposi肉瘤组织中均表达上调,与芯片结果一致。生物学过程注释集中在Wnt信号通路、泛素化代谢、TGF-beta信号通路、P53信号通路。结论:lncRNA可能与Kaposi肉瘤发病有关。 

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 一般资料
    1.2 实验材料
    1.3 实验方法
        1.3.1 组织总RNA的抽提和纯化
        1.3.2 芯片杂交、扫描及数据读取分析
        1.3.3 qRT-PCR
    1.4 统计学方法
2 结果
    2.1 样本总RNA抽提质检结果
    2.2 lncRNA在Kaposi肉瘤中差异表达谱分析
    2.3 lncRNA差异表达聚类图
    2.4 qRT-PCR验证
    2.5 差异表达的lncRNA的靶基因预测
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]Kaposi’s肉瘤中转化生长因子Ⅱ型受体基因的表达及意义[J]. 邹云敏,张德志,靳颖,郭芳,普雄明.  现代肿瘤医学. 2012(08)
[2]微小RNA-126对卡波西肉瘤细胞迁移和侵袭能力的影响[J]. 吴秀娟,丁媛,赵宗峰,王红娟,普雄明.  中华实用诊断与治疗杂志. 2017(01)
[3]长链非编码RNA在皮肤癌中的研究进展[J]. 甘泉,周晓伟,陈晓栋,刘毅.  中国麻风皮肤病杂志. 2017(04)
[4]kshv-mir-k12-1-5p相关基因在卡波西肉瘤中的表达[J]. 张静,吴秀娟,普雄明.  山西医科大学学报. 2017(10)
[5]Emerging role of long non-coding RNA in the development of gastric cancer[J]. Hang Yu,Long Rong.  World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2018(09)



本文编号：3703261