ILs基因SNPs与胃癌易感性关联及生物信息学功能研究

发布时间：2023-03-04 17:47

　　胃癌是发病率及致死率极高的一种恶性肿瘤,影响全世界人群的健康。中国作为全球胃癌高发区之一,每年因胃癌所致的健康及经济负担极大。多数胃癌早期不易发现,严重影响胃癌病人的治疗及预后,给病人带来极大的生理及精神痛苦。因此,研究胃癌的易感性是十分必要的。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是一类重要的突变,很多基因的SNPs与胃癌易感性相关,可以作为胃癌易感性相关的生物标志物。炎症影响胃癌的发生、发展,而白细胞介素(白介素),是一类炎症相关的重要细胞因子。研究表明白介素(Interleukin,IL)基因的SNPs对胃癌的易感性也会产生影响。虽然已经发现多种ILs基因的SNPs与胃癌易感性相关,但现有的关于ILs基因SNPs与胃癌易感性的研究结果间仍存在争议。目的通过meta分析的方法找出与胃癌易感性有关的ILs基因单核苷酸多态性位点,并对筛选出的SNPs在河南省汉族人群样本中进行实验,验证其与胃癌易感性的关系,最后通过生物信息学等方法初步探索与胃癌易感性相关位点突变对生物学功能可能产生的影响。方法(1)基于meta分析的方法定量评价ILs基因...

【文章页数】：90 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略词表
1 前言
2 材料与方法
    2.1 ILs基因SNPs与胃癌易感性关联研究的meta分析
        2.1.1 文献检索与收集
        2.1.2 文献纳入
        2.1.3 文献资料分析、质量评价
        2.1.4 统计学分析
    2.2 生物学实验
        2.2.1 实验仪器
        2.2.2 实验试剂
        2.2.3 溶液的配制
        2.2.4 研究方法
        2.2.5 统计学分析
    2.3 基因分型实验验证后胃癌易感性相关SNPs的生物学功能初探
3 结果
    3.1 ILs基因SNPs与胃癌易感性关联的meta分析
        3.1.1 文献检索结果
        3.1.2 ILs基因SNPs及相应文献的基本信息
        3.1.3 Meta分析结果
        3.1.4 敏感性分析
        3.1.5 发表偏倚分析
    3.2 基因分型实验结果分析
        3.2.1 研究对象一般特征
        3.2.2 SNPs的分型结果
        3.2.3 Hardy-Weinberg平衡检验
        3.2.4 两个SNPs和胃癌遗传易感性的关系
        3.2.5 两个SNPs与胃癌遗传易感性的分层分析
        3.2.6 假阳性报告率分析及人群归因危险度百分比评估
        3.2.7 基因环境交互作用
    3.3 rs763780的生物学功能初探
        3.3.1 rs763780三维染色质环作用关系
        3.3.2 rs763780所致蛋白质功能影响预测
4 讨论
    4.1 本研究概述
    4.2 ILs基因单核苷酸多态性与胃癌的关系
    4.3 基因-环境交互作用对胃癌的影响
    4.4 基于生物信息学的rs763780生物学功能初探
    4.5 本研究优点及局限性
5 结论
参考文献
综述 白细胞介素:胃癌相关信号通路的重要调控因子
    1 白细胞介素简介
    2 白细胞介素与常见恶性肿瘤的关系
    3 常见胃癌相关信号通路
    4 白细胞介素参与影响胃癌发生、发展等过程的信号通路
    参考文献
个人简历及学术论文发表情况
致谢



本文编号：3754718