胃癌相关circRNA的筛
发布时间:2023-03-19 05:22
第一部分:胃癌患者血浆中差异表达circRNA的筛选目的:构建胃癌血浆circRNA表达谱,筛选出差异表达的circRNA基因。方法:采用circRNA基因芯片技术,获取circRNA在胃癌患者和正常体检者血浆中的表达谱,筛选出表达上调或下调2倍以上的circRNA,并通过GO富集分析和KEGG信号通路富集分析,进一步筛选出胃癌标志物的候选circRNA。结果:通过分析胃癌相关circRNA表达谱,共发现566种circRNA在胃癌患者和正常体检者间存在显著性差异(P<0.05),其中68种circRNA表达水平差异超过2倍(28种高表达,40种低表达)。进一步行生物信息学分析,最终筛选得到20个候选circRNA基因(8种高表达,12种低表达)。结论:成功构建了胃癌相关血浆circRNA表达谱,并初步筛选出在胃癌血浆中存在表达差异的20个circRNA基因。第二部分:初筛circRNA在胃癌血浆中的表达目的:验证初筛circRNA在胃癌血浆中的表达情况,并探讨其与胃癌临床病理特征的相关性。方法:收集胃癌患者和健康体检者血浆各80例,利用qRT-PCR的方法对筛选结果进行验证,并...
【文章页数】:107 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 胃癌患者血浆中差异表达circRNA的筛选
第一章 引言
1.1 circRNA的结构特点
1.2 circRNA的合成
1.3 circRNA的生物学功能及其作用机制
1.4 circRNA的检测技术
1.5 circRNA与肿瘤发生、发展的关系
1.6 circRNA与胃癌的关系
1.7 总结与展望
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 芯片样品RNA的质检
3.2 芯片扫描结果
3.3 芯片数据的归一化分析
3.4 表达差异基因的筛选
第四章 讨论
第五章 小结
第二部分 初筛circRNA在胃癌血浆中的表达
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 临床资料基本特征
3.2 初筛circRNA在胃癌血浆中表达的验证
3.3 hsacirc0033634的表达与胃癌临床病理参数间的关系
3.4 hsacirc0033634表达的ROC曲线分析
第四章 讨论
第五章 小结
第三部分 hsacirc0033634对胃癌生物学行为的调控作用
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 hsacirc0033634在胃癌细胞中的表达
3.2 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞增殖的影响
3.3 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞凋亡的影响
3.4 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞体外迁移能力的影响
3.5 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞体外侵袭能力的影响
第四章 讨论
第五章 小结
第四部分 hsacirc0033634参与胃癌发生发展的机制研究
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 hsacirc0033634的可能靶基因
3.2 hsa-miR-331-3p在不同胃癌细胞系中的表达
3.3 hsacirc0033634调控hsa-miR-331-3p在胃癌中的作用
3.4 hsacirc0033634和hsa-miR-331-3p对RAS信号通路相关蛋白表达的影响
第四章 讨论
第五章 小结
全文结论
参考文献
附录 中英文缩略词表
在学期间的研究成果
致谢
本文编号:3764642
【文章页数】:107 页
【学位级别】:博士
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中文摘要
Abstract
前言
第一部分 胃癌患者血浆中差异表达circRNA的筛选
第一章 引言
1.1 circRNA的结构特点
1.2 circRNA的合成
1.3 circRNA的生物学功能及其作用机制
1.4 circRNA的检测技术
1.5 circRNA与肿瘤发生、发展的关系
1.6 circRNA与胃癌的关系
1.7 总结与展望
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 芯片样品RNA的质检
3.2 芯片扫描结果
3.3 芯片数据的归一化分析
3.4 表达差异基因的筛选
第四章 讨论
第五章 小结
第二部分 初筛circRNA在胃癌血浆中的表达
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 临床资料基本特征
3.2 初筛circRNA在胃癌血浆中表达的验证
3.3 hsacirc0033634的表达与胃癌临床病理参数间的关系
3.4 hsacirc0033634表达的ROC曲线分析
第四章 讨论
第五章 小结
第三部分 hsacirc0033634对胃癌生物学行为的调控作用
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 hsacirc0033634在胃癌细胞中的表达
3.2 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞增殖的影响
3.3 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞凋亡的影响
3.4 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞体外迁移能力的影响
3.5 hsacirc0033634转染后对胃癌细胞体外侵袭能力的影响
第四章 讨论
第五章 小结
第四部分 hsacirc0033634参与胃癌发生发展的机制研究
第一章 引言
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 统计学方法
第三章 结果
3.1 hsacirc0033634的可能靶基因
3.2 hsa-miR-331-3p在不同胃癌细胞系中的表达
3.3 hsacirc0033634调控hsa-miR-331-3p在胃癌中的作用
3.4 hsacirc0033634和hsa-miR-331-3p对RAS信号通路相关蛋白表达的影响
第四章 讨论
第五章 小结
全文结论
参考文献
附录 中英文缩略词表
在学期间的研究成果
致谢
本文编号:3764642
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