基于TCGA数据库的三种癌症基因表达谱数据的综合分析

发布时间：2023-06-01 22:46

　　癌症基因组图谱(TCGA)是一个具有里程碑意义的癌症基因组计划,它从分子上表征了32000多个原发癌症样本,分别归属于39种癌型及其亚型,且具有对应病人的正常细胞样本。本文主要从基因表达谱分析流程出发,针对Broad GDAC Firehose数据库中来自TCGA数据库的1098套乳腺癌、631套结直肠腺癌、551套肺腺癌基因表达谱数据,挖掘原发肿瘤和转移瘤的特征表达谱及其对应的生物学功能。

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【文章目录】：
一、研究背景及意义
二、TCGA肿瘤数据来源及分析流程
    1.Broad GDAC Firehose数据库
    2.数据分类及病人信息拟合
    3.差异表达分析及下游富集分析流程
    4. TCGA肿瘤数据分析结果
        (1)三种癌症样本的表达谱及聚类全图
        (2)差异表达分析及结果汇总
        (3)生物学功能性富集分析及汇总结果
        (4)三种癌症中转移瘤富集分析结果汇总
        (5)差异表达基因及不同癌症的特征基因选择
        (6)特征基因表达量与病人总体生存率的相关性分析
三、总结



本文编号：3827173