人类乙醇脱氢酶1A的生物信息学分析及在肺癌中的功能分析

发布时间：2024-02-21 09:07

　　研究背景:目前全球癌症发病率和死亡率正在迅速增长,造成全球严重的健康负担。其中,肺癌是最常见的癌症和癌症相关死亡的主要原因。已有研究报道乙醇脱氢酶A(ADH)基因家族中的ADH1基因在包括肺癌在内的多种实体瘤中均发挥着重要作用。ADH1基因包括三个基因型ADH1A、ADH1B以及ADH1C,目前关于ADH1A在肿瘤中的研究甚少,所以本研究选取了 ADH1A作为ADH1的代表基因,探讨其在各种实体瘤,特别是肺癌中的作用,以进一步地了解肿瘤的发生发展过程,并为进一步研究提供理论基础。方法与材料:通过GTEx数据库、TCGA数据库在RNA水平上初步探索ADH1A在人类正常组织和多种实体瘤中的表达,随后收集38例肿瘤患者的肿瘤和正常组织,收集5只雄性BALB/c小鼠组织,进行免疫组化分析以探索ADH1A在蛋白质水平上的差异分布。利用基因差异共表达分析、主成分分析、功能富集分析、免疫浸润分析以及生存分析等方法探索ADH1A在肿瘤组织发挥的功能,并采用多个miRNA数据库及转录因子数据库预测并构建出ADH1A在肺腺癌中的上游调控网络及其下游互助蛋白网络。结果:在RNA水平上,ADH1A主要在肝脏中...

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－１?ＧＴＥｘ数据库中的ＡＤＨ１Ａ基因表达??Ｆｉｇｕｒｅ?１－１?ＡＤＨＩＡｇｅｎｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｆｒｏｍ?ＧＴＥｘ．??１０??

?第一章探讨ＡＤＨ１Ａ在人组织和ＢＡＬＢ／ｃ小鼠组织中的表达???ｌｏｇ１?０（ＴＰＭ－？－１?）??ｃｒ＞?ｏ?—？■?—＾?ｒｏ?ｃ〇??＇〇?ｃｎ?ｏ?ｃｎ?＜＝？?ｃｎ?＜＝＞??Ｉ?｜?｜?｜?｜?｜?ｉ?ｉ??＾????爲參：－??，、＞多：：２Ｓ＊??－??雜：＿?....

图１?－２通过免疫组织化学分析ＡＤＨ１Ａ蛋白在ＢＡＬＢ／ｃ小鼠组织中的分布??－

?项士学位论文???Ｇｕｔ?Ｔｒａｃｈｅａ?Ｈｅａｒｔ?Ｌｉｖｅｒ??＼?□?＾?Ｏ＇?，?口??＾?．?：：ｉｒ＾?—＿＿＿＿＿丄＇??Ｌｕｎｇ?Ｅｓｏｐｈａｇｕｓ?Ｔｈｙｍｕｓ?Ｓｔｏｍａｃｈ??Ｕｒｅｔｅｒ?Ｓｐｌｅｅｎ?Ｐａｎｃｒｅａｓ??ＶＴＩＩＷ７?－?ｎ，＿＿??．....

图２－１?（２）中聚集的实体肿瘤数据集中（ｎ?＝?２０），?１２，１６４个与ＡＤＨ１Ａ共表达的基因??

ｉｏｎ?ｉｓ?ｕｓｅｄ?ｔｏ?ｃａｌｃｕｌａｔｅ?ｐｒｉｎｃｉｐａｌ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ．?Ｘ??ａｎｄ?Ｙ?ａｘｉｓ?ｓｈｏｗ?ｐｒｉｎｃｉｐａｌ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?１?ａｎｄ?ｐｒｉｎｃｉｐａｌ??■?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?２?ｔｈａｔ?ｅｘｐｌａｉｎ?２１．１％?ａｎｄ?....

图２－４在肺腺癌中，趋化因子系统与ＡＤＨ１Ａ表达量之间相关性的热图

?第二章ＡＤＨ１Ａ在多种实体瘤中的共表达基因的差异分析???＾?Ｏ?Ｏ?？?Ｔ??Ｍ．?＿??Ｈｉ?！ｓ｜?＾?§８?８８ｆｓ?ｒ??§ｉ§?ｂｉ１１１＾１１１１ａ?ｓ?§?ｉｉｉ?ｉ?ｆ?ｆ?ｉ??—Ｈ：－?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｏｆ?ＡＤＨ１Ａ??１?■?Ｍ?１????Ｍｅｔ....

本文编号：3905263