Allo-HSCT后早期TCR组库特征与动态演变规律的研究

发布时间：2024-10-02 22:44

　　目的:分析异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)后T细胞免疫组库的基本特征和动态演变,在TCR免疫组库水平理解移植后T细胞免疫重建的规律,分析其对移植后复发、Gv HD、病毒感染等主要并发症产生的影响,探索其对临床工作的指导作用和应用前景。方法:入组进行allo-HSCT的恶性血液病病人30例,分别对其移植物(d0)、移植后1个月(d28)和移植后2个月(d61)的外周血进行高通量测序,得到的TCRβ链CDR3免疫组库结合患者随访1年的临床数据进行分析。基于组库数据特征和研究目的,创造性地设计T细胞响应指数(TCRI),分析其特性后将其运用到数据的统计分析中。结果:1.allo-HSCT后TCR免疫组库的反Simpson多样性指数不断下降(仅d0和d61之间p=0.01),克隆性指数不断上升(p=0.001),非复发组d28克隆性指数显著高于复发组(p=0.018),急性Gv HD组和无急性Gv HD组、CMV激活组和无CMV激活组之间均无显著差异。2.半相合移植组的TCRI在第一个月(TCRI200ab)、第二个月(TCRI200bc)和前两个月(TCRI200ac)均显著高于非半...

【文章页数】：109 页

【学位级别】：博士

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缩略语表
摘要
Abstract
前言
第一章 研究背景
    1.1 造血干细胞移植
        1.1.1 造血干细胞移植的发展过程
        1.1.2 造血干细胞移植的分类
        1.1.3 造血干细胞移植的过程
        1.1.4 造血干细胞采集物的成分
        1.1.5 造血干细胞移植后的主要并发症
    1.2 移植后免疫重建
        1.2.1 allo-HSCT后免疫细胞数量和功能重建
        1.2.2 allo-HSCT后患者T细胞来源和重建
        1.2.3 allo-HSCT后抗原提呈与识别
    1.3 TCR免疫组库
        1.3.1 TCR
        1.3.2 T细胞免疫组库
        1.3.3 下一代测序技术
        1.3.4 相关研究进展
    1.4 本研究的主要目的和研究思路
第二章 实验与数据可靠性分析
    2.1 实验流程和伦理申报
        2.1.1 实验流程图
        2.1.2 伦理申报
        2.1.3 临床试验注册
    2.2 提取单个核细胞RNA
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 实验方法
        2.2.3 实验注意事项
    2.3 免疫组库高通量测序
        2.3.1 测序的流程
        2.3.2 TCR免疫组库高通量测序
    2.4 测序数据规律分析
        2.4.1 测序数据重复性
        2.4.2 测序数据代表性
        2.4.3 测序数据偏倚
第三章 新指数的设计与特点
    3.1 新指数的设计
        3.1.1 本研究的指导思想
        3.1.2 数据结构
        3.1.3 新指数的设计过程
    3.2 新指数的特点
        3.2.1 新指数的特征
        3.2.2 新指数的优缺点
        3.2.3 应用新指数的注意事项
    3.3 新指数与常用指数对比
        3.3.1 分析免疫组库的常用指数
        3.3.2 新指数与传统常用指数对比
第四章 结果分析与讨论
    4.1 移植后早期TCR组库特征
        4.1.1 统计分析方法
        4.1.2 患者的临床数据
        4.1.3 患者的测序数据
        4.1.4 移植后TCR免疫组库多样性和克隆性变化趋势
        4.1.5 讨论
    4.2 TCR组库动态变化与移植后主要并发症
        4.2.1 移植后TCR组库中的主要克隆
        4.2.2 移植后免疫组库不平行扩增与临床并发症的关系
        4.2.3 VDJ片段使用率及氨基酸组成与临床并发症
        4.2.4 讨论
    4.3 GvL相关克隆共性分析
        4.3.1 GvL相关克隆的共性分析
        4.3.2 患者间共享特异性的GvL相关克隆特征
        4.3.3 讨论
第五章 结论与展望
参考文献
作者在学期间取得的学术成果
主要简历
致谢



本文编号：4006445