基于酶反应放大的DNA生物传感分析及单分子分析
本文关键词:基于酶反应放大的DNA生物传感分析及单分子分析
更多相关文章: 电感耦合等离子体-质谱仪 滚环放大 全内反射荧光显微镜 单分子成像 光镊
【摘要】:本文采用了ICP-MS检测分析方法,制备了修饰有捕获探针的纳米金生物条码,建立了基于DNA分子机器与酶循环放大技术和基于DNA分子信标的特异性识别技术的方法,实现了对基因等肿瘤标志物的高灵敏,高选择性检测:采用了全内角反射荧光成像技术,利用滚环扩增将目标DNA放大增长,将单个目标DNA进行荧光成像,实现了对目标基因的检测。主要内容如下:1.构建了一种以ICP-MS检测技术为基础的三联放大系统,通过剪切链置换、滚环扩增和生物条码探针,来检测目标DNA。通过这个方法,乙肝炎病毒的检测限能达到3.2×10-17M。单错配碱基的序列也能很好的被分辨。此外,我们能证明该方法能很好的应用于复杂的生物样品检测,在生物医学领域有着广阔的前景。2.全内反射荧光显微镜(total internal reflection fluorescence microscope, TIRF)是一门比较复杂的光学技术,目前已被科学家们广泛应用,现如今已经发展成为探测细胞-基底接触区域内细胞生命活动最强有力的方法。将目标DNA滚环扩增,然后将其产物固定在玻璃板上,运用光镊将末端修饰有聚苯乙烯微球的稍作移动,这样做的目的是将PCR扩增的产物在拉力的作用下变为一条直线,再用与其DNA互补的荧光DNA进行杂交,最后运用TIRF来观察基底的情况。全内反射荧光显微技术作为单分子成像的一种新兴技术,必将更好的为我们对肿瘤标志物的检测带来帮助。
【关键词】:电感耦合等离子体-质谱仪 滚环放大 全内反射荧光显微镜 单分子成像 光镊
【学位授予单位】:青岛科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R730.4;O657.63
【目录】:
- 摘要3-4
- ABSTRACT4-10
- 第一章 前言10-41
- 1.1 DNA传感器10-14
- 1.1.1 DNA的结构特点10-11
- 1.1.2 生物传感器的工作原理11
- 1.1.3 DNA传感器的类型11-14
- 1.2 DNA病毒14-17
- 1.2.1 病毒简介14-15
- 1.2.2 DNA病毒15
- 1.2.3 乙型肝炎病毒15-16
- 1.2.4 乙肝病毒的传播途径16-17
- 1.2.5 基因检测方法17
- 1.3 电感耦合等离子体质谱17-21
- 1.3.1 电感耦合等离子体17
- 1.3.2 质谱17-18
- 1.3.3 电感耦合等离子体质谱18-19
- 1.3.4 ICP-MS的应用19-21
- 1.3.5 展望21
- 1.4 纳米金以及在生物传感器上的应用21-28
- 1.4.1 纳米材料21-24
- 1.4.2 纳米金24-25
- 1.4.3 纳米金的制备简介25
- 1.4.4 纳米金的应用25-28
- 1.5 DNA循环放大技术28-30
- 1.5.1 聚合酶链反应28
- 1.5.2 滚环扩增28
- 1.5.3 聚合酶链置换反应28-29
- 1.5.4 杂交链式反应29
- 1.5.5 链取代反应29-30
- 1.6 全内反射荧光成像技术30-32
- 1.6.1 全内反射现象31
- 1.6.2 全内反射荧光显微镜31-32
- 1.7 激光光镊微操作仪32-34
- 1.8 电泳技术34-35
- 1.8.1 聚丙烯酰胺凝胶电泳34
- 1.8.2 琼脂糖凝胶电泳34-35
- 1.9 本工作的意义和研究内容35-37
- 参考文献37-41
- 第二章 基于ICP-MS和酶循环放大的DNA生物传感器的研究41-66
- 2.1 引言41-42
- 2.2 实验部分42-44
- 2.2.1 器材42
- 2.2.2 试剂42-44
- 2.3 实验准备工作44-46
- 2.3.1 配制0.1M,pH=6.8的咪唑-盐酸缓冲体系44
- 2.3.2 配制0.01M,ph=5.6醋酸盐缓冲体系44-45
- 2.3.3 配制0.01M,ph为7.4磷酸盐缓冲体系45
- 2.3.4 DNA的预处理45-46
- 2.4 实验步骤46-51
- 2.4.1 DNA在磁珠上的固定46
- 2.4.2 纳米金胶的制备46-48
- 2.4.3 生物条码的制备48-49
- 2.4.4 探针的捕获和剪切聚合49
- 2.4.5 滚环扩增反应49-50
- 2.4.6 将信号引入分子机器50
- 2.4.7 ICP-MS检测50-51
- 2.5 结果与讨论51-61
- 2.5.1 基于ICP-MS和酶循环放大技术的DNA生物传感器的原理51-52
- 2.5.2 纳米金粒子的表征52-54
- 2.5.3 纳米金生物条码的紫外表征54
- 2.5.4 可行性实验54-56
- 2.5.5 实验条件的优化56-59
- 2.5.6 靶DNA的检测59
- 2.5.7 对照实验59-60
- 2.5.8 对目标DNA的选择性测试60-61
- 2.5.9 DNA分子机器ICP-MS检测生物样品61
- 2.6 小结61-63
- 参考文献63-66
- 第三章 基于全内反射荧光成像及光镊的单分子分析66-81
- 3.1 引言66-67
- 3.2 实验部分67-68
- 3.2.1 仪器67
- 3.2.2 试剂67-68
- 3.3 实验的准备工作68-69
- 3.3.1 配制25mM 的 Tris-OAc (50mM NaCl) PH=7.5 的缓冲体系68-69
- 3.3.2 配制0.05M, ph为7.5磷酸盐缓冲体系(PBS)69
- 3.3.3 DNA的预处理69
- 3.4 实验步骤69-72
- 3.4.1 氨基化玻璃片的制备69-70
- 3.4.2 氨基化玻璃片的醛基活化70
- 3.4.3 探针的固定70
- 3.4.4 滚环扩增70
- 3.4.5 末端转移反应70-71
- 3.4.6 激光光镊微操作71
- 3.4.7 全内反射荧光检测71-72
- 3.5 结果与讨论72-78
- 3.5.1 实验原理72-73
- 3.5.2 捕获探针浓度的选择73
- 3.5.3 滚环方式的选择73-75
- 3.5.4 滚环并光镊微操作75-76
- 3.5.5 聚合替换76
- 3.5.6 嵌插染料76-77
- 3.5.7 剪碎长链77-78
- 3.6. 小结78-79
- 参考文献79-81
- 结论81-82
- 致谢82-83
- 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录83-84
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 赵广超 ,朱俊杰 ,陈洪渊 ,王雪梅 ,陆祖宏;Spectroscopic and Spectroelectrochemical Studies of Interaction of Nile Blue with DNA[J];Chinese Journal of Chemistry;2002年01期
2 张鹏 ,孟继本 ,龙江 ,松浦辉男 ,王永梅;Synthesis of Benzo [α]phenoxazin-5-one Derivatives and Their Interactions with DNA[J];Chinese Journal of Chemistry;2002年05期
3 陈绘丽 ,杨频;A Novel Cobalt(III) Mixed-polypyridyl Complex: Synthesis, Characterization and DNA Binding[J];Chinese Journal of Chemistry;2002年12期
4 周莉,李树蕾,陈辉,黄可欣,聂毓秀;DNA Damage Effect of Mixed Rare Earth Changle Crossing Placenta Barrier on Rat Embryo[J];Journal of Rare Earths;2003年02期
5 陈婧,康敬万;Interaction between Eu(bpy)_3~(3+) Complex and DNA by Fluorophotometry[J];Journal of Rare Earths;2003年S1期
6 张强;企业DNA:核心竞争力[J];中国石化;2004年06期
7 ;Interaction between DNA with Complex of Eu~(3+)-Rutin by UV-Visible Spectroscopy and Electrochemistry[J];Journal of Rare Earths;2005年04期
8 周春琼,邓先和,杨频;Interaction of Complex of Europium and Hbbimp with DNA[J];Journal of Rare Earths;2005年05期
9 ;Synthesis of a New Cobalt (II) Complex and its Interaction with DNA[J];Chinese Chemical Letters;2005年04期
10 ;Spectroscopic and Electrochemical Studies of the Interaction Between Fuchsin Basic and DNA[J];Chemical Research in Chinese Universities;2006年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 Michael J.Siefkes;Cory O.Brant;Ronald B.Walter;;A novel real-time XL-PCR for DNA damage detection[A];渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
2 ;Hormonal Regulation and Tumorigenic Role of DNA Methyltransferase[A];2011中国妇产科学术会议暨浙江省计划生育与生殖医学学术年会暨生殖健康讲习班论文汇编[C];2011年
3 Dongmei Zhao;Fan Jin;Yuli Qian;Hefeng Huang;;Expression patterns of Dnmtl and Dnmt3b in preimplantational mouse embryos and effects of in-vitro cultures on their expression[A];中华医学会第十次全国妇产科学术会议妇科内分泌会场(妇科内分泌学组、绝经学组、计划生育学组)论文汇编[C];2012年
4 姜东成;蒋稼欢;杨力;蔡绍皙;K.-L.Paul Sung;;在聚吡咯微点致动下的DNA杂交行为[A];2008年全国生物流变学与生物力学学术会议论文摘要集[C];2008年
5 白明慧;翁小成;周翔;;联邻苯二酚类小分子作为DNA交联剂的研究[A];第六届全国化学生物学学术会议论文摘要集[C];2009年
6 张晔;杜智;杨斌;高英堂;;检测外周血中游离DNA的应用前景(综述)[A];天津市生物医学工程学会第29届学术年会暨首届生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2009年
7 周红;郑江;王良喜;丁国富;鲁永玲;潘文东;罗平;肖光夏;;CpG DNA诱导全身炎症反应综合征的作用及其机制研究[A];全国烧伤创面处理、感染专题研讨会论文汇编[C];2004年
8 ;EFFECTS OF Ku70-DEFICIENT ON ARSENITE-INDUCED DNA DOUBLE STRAND BREAKS, CHROMOSOMAL ALTERATIONS AND CELL CYCLE ARREST[A];海峡两岸第三届毒理学研讨会论文摘要[C];2005年
9 李经建;冀中华;蔡生民;;小沟结合方式中的DNA媒介电荷转移[A];第十三次全国电化学会议论文摘要集(下集)[C];2005年
10 ;The interaction between Levofloxacine Hydrochloride and DNA mediated by Cu~(2+)[A];湖北省化学化工学会2006年年会暨循环经济专家论坛论文集[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 袁满;平安:把“领先”作为DNA[N];经济观察报;2006年
2 舒放;编织一个DNA纳米桶[N];医药经济报;2006年
3 闫洁;英两无罪公民起诉要求销毁DNA记录[N];新华每日电讯;2008年
4 何德功;日本制成诊断鱼病的“DNA书”[N];农民日报;2004年
5 本报记者 张巍巍;DNA样本也能作假[N];科技日报;2009年
6 周斌伟 邹巍;苏州警方应用DNA技术一年侦破案件1887起[N];人民公安报;2011年
7 本报记者 杨天笑;揭秘“神探”DNA[N];苏州日报;2011年
8 第四军医大学基础医学部生物化学与分子生物学教研室教授 李福洋;破除法老DNA的咒语[N];东方早报;2011年
9 常丽君;DNA电路可检测导致疾病的基因损伤[N];科技日报;2012年
10 常丽君;效率和质量:“DNA制造业”两大障碍被攻克[N];科技日报;2012年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 唐阳;基于质谱技术的基因组DNA甲基化及其氧化衍生物分析[D];武汉大学;2014年
2 池晴佳;DNA动力学与弹性性质研究[D];重庆大学;2015年
3 胡璐璐;哺乳动物DNA去甲基化过程关键酶TET2的三维结构与P暬蒲芯縖D];复旦大学;2014年
4 马寅洲;基于滚环扩增的DNA自组装技术的研究[D];南京大学;2014年
5 黄学锋;精子DNA碎片的临床意义:临床和实验研究[D];复旦大学;2013年
6 隋江东;APE1促进DNA-PKcs介导hnRNPA1磷酸化及其在有丝分裂期端粒保护中的作用[D];第三军医大学;2015年
7 刘松柏;结构特异性核酸酶FEN1在DNA复制及细胞周期过程中的功能性研究[D];浙江大学;2015年
8 王璐;哺乳动物中亲本DNA甲基化的重编程与继承[D];中国科学院北京基因组研究所;2015年
9 齐文靖;染色质改构蛋白BRG1在DNA双链断裂修复中的作用及机制研究[D];东北师范大学;2015年
10 龙湍;水稻T-DNA插入突变群体侧翼序列的分离分析和OsaTRZ2的克隆与功能鉴定[D];华中农业大学;2014年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 董洪奎;面向可视化纳米操作的DNA运动学建模及误差实时校正方法[D];沈阳理工大学;2014年
2 闻金燕;水溶性羧基和吡啶基咔咯大环与DNA和人血清蛋白的相互作用[D];华南理工大学;2015年
3 江怿雨;水溶性羧酸卟啉及其配合物与DNA和人血清蛋白的相互作用[D];华南理工大学;2015年
4 高志森;比较外周游离循环肿瘤DNA与癌胚抗原监测非小细胞肺癌根治术前后肿瘤负荷变化的初步研究[D];福建医科大学;2015年
5 丁浩;血浆循环DNA完整性及多基因甲基化对肺癌诊断价值的研究[D];河北大学;2015年
6 王鹏;基于碳点@氧化石墨烯复合材料DNA生物传感器的构建及用于PML/RARα基因检测[D];福建医科大学;2015年
7 李海青;转碱篷和盐角草总DNA的耐盐紫花苜蓿的选育[D];内蒙古大学;2015年
8 李婷婷;小鼠DNA模式识别重要受体的分子结构特征及其功能研究[D];中国农业科学院;2015年
9 刘瑞斯;抗癌药物奥沙利铂与DNA相互作用的原子力显微镜观察研究[D];东北林业大学;2015年
10 熊忠;芳香二肽与一价金属离子间相互作用及DNA切割活性的研究[D];郑州大学;2015年
,本文编号:549514
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/549514.html