miRNA对肺癌的调控和易感性研究
本文关键词:miRNA对肺癌的调控和易感性研究
【摘要】:肺癌是常见的恶性肿瘤之一,在我国其发病率和死亡率都居于首位,严重影响人类健康和社会经济发展。寻找有效的作用靶点和可靠的生物标志物,为肺癌的预防、早期诊断和针对性治疗提供依据,是亟待解决的重大公共卫生问题。mircoRNA是一类高度保守的短链非编码RNA,通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,调控基因表达,参与细胞生长、分化、周期、凋亡等多个生物学过程。既往研究表明miRNA与肿瘤关系密切,在肿瘤发生过程中起到类似于癌基因或抑癌基因的作用,但是目前尚有大量的miRNA生物学功能和调控机制不明确。miRNA SNP与肿瘤易感性的关系也逐渐引起人们的重视,当SNP发生在miRNA上时,可能影响miRNA的生物学功能,进而影响肿瘤的发病风险。本研究在生物信息学分析的基础上,探讨miR-202和miR-1908对肺癌细胞的生物学功能及靶基因调控作用,分析miR-202和miR-1908在肺癌发生发展过程中的作用以及分子机制。另外,我们采用病例-对照研究,探究miR-202rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因多态性与肺癌易感性的关系,并通过细胞实验分析miR-202 rs12355840、 miR-1908 rs174561对mir-202和mir-1908表达量的影响。研究结果为肺癌的预防、早期诊断及治疗提供生物标志物和作用靶点。一、miRNA对肺癌的调控研究目的探讨miR-202和miR-1908对肺癌细胞A549的生物学功能和靶基因调控。方法应用DIANA-TOOLs及KEGG数据库对miR-202和miR-1908进行生物信息学分析,探讨其可能参与的信号通路和潜在靶基因。通过慢病毒转染,上调和下调A549细胞中miR-202和miR-1908的表达,应用MTT和流式细胞技术分别检测miR-202和miR-1908对A549细胞增殖、细胞周期和凋亡的影响。应用RT-qPCR和Western blot技术分别检测miR-202和miR-1908对其预测靶基因PIK3CA和PP5的mRNA和蛋白表达水平的调控。结果生物信息学分析显示,miR-202参与的信号通路主要集中在Non-small cell lung cancer等肿瘤相关通路,并可能通过对PIK3CA的靶向调控发挥其作用。miR-1908主要参与MAPK signaling pathway等相关通路的调控,PP5为其重要潜在靶基因。生物学功能研究表明,与阴性对照组相比,上调miR-202的表达能够抑制A549细胞增殖,引起细胞周期G1/S期阻滞,对细胞凋亡无明显影响。上调的miR-1908的表达可引起细胞G2期阻滞,S期减少,对细胞增殖和凋亡无明显影响。靶基因研究结果显示,与阴性对照组相比,PIK3CA蛋白的表达量与miR-202呈负相关,但其mRNA的表达无显著性改变。与阴性对照组相比,PP5蛋白的表达量与miR-1908呈正相关,其:mRNA的表达也无显著性改变。结论miR-202可能通过对PIK3CA的负向调控影响A549细胞增殖和细胞周期,miR-1908可能通过对PP5的正向调控影响A549细胞周期。二、miRNA基因多态性与肺癌易感性研究目的探讨miR-202、miR-1908、miR-608、miR-548j基因多态性对肺癌易感性的影响。方法通过病例-对照研究,收集了223例肺癌病例和224例对照的流行病学资料和血样,采用LDR法对miR-202 rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因型分布进行检测,进一步按病理类型和吸烟情况进行分层分析,探讨miRNA SNP对肺癌易感性的影响。通过质粒转染,应用RT-qPCR技术分析miR-202和-miR-1908基因多态性对其miRNA表达的影响。结果人群研究结果显示,miR-202 rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因型在病例组和对照组的分布无显著性差异,按病理类型和吸烟分层后,也未发现四种miRNA SNP对肺癌发病风险存在影响。RT-qPCR结果表明,不同等位基因转染组之间miRNA表达无显著性差异。结论未发现miR-202、miR-1908、miR-608、miR-548j基因多态性与肺癌易感性存在关联,miR-202和miR-1908基因突变对miRNA表达无显著性影响。
【关键词】:肺癌 miRNA 调控 易感性
【学位授予单位】:东南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R734.2
【目录】:
- 中文摘要5-7
- ABSTRACT7-10
- 缩略词表10-11
- 前言11-14
- 技术路线14-15
- 第一章 miRNA对肺癌的调控研究15-45
- 第一节 miRNA KEGG信号通路分析和靶基因预测16-23
- 1 材料与方法16-17
- 2 结果17-21
- 3. 讨论21-22
- 4. 结论22-23
- 第二节 miR-202和miR-1908的生物学功能研究23-37
- 1 材料与方法23-31
- 2. 结果31-35
- 3. 讨论35-36
- 4. 结论36-37
- 第三节 miR-202和miR-1908的靶基因调控研究37-45
- 1. 材料与方法37-41
- 2. 结果41-43
- 3. 讨论43-44
- 4. 结论44-45
- 第二章 miRNA基因多态性与肺癌易感性研究45-66
- 第一节 miRNA基因多态性与肺癌易感性的病例对照研究46-60
- 1. 材料与方法46-50
- 2. 结果50-57
- 3. 讨论57-59
- 4. 结论59-60
- 第二节 miRNA等位基因对miRNA表达的影响60-66
- 1. 材料与方法60-62
- 2. 结果62-64
- 3. 讨论64-65
- 4. 结论65-66
- 总结66-67
- 参考文献67-75
- 综述75-81
- 参考文献79-81
- 作者简介81-82
- 攻读硕士期间发表文章情况82-83
- 致谢83-84
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本文编号:756604
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