济南军区急性呼吸道传染病病原监测研究

发布时间：2018-01-21 06:47

本文关键词： 急性呼吸道传染病病原监测病原谱流行特征　出处：《中国人民解放军军事医学科学院》2017年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：研究背景急性呼吸道传染病是通过空气飞沫传播的一类重要传染性疾病,其病原体主要由病毒、细菌、支原体等构成,其中病毒感染引起的呼吸道传染病对人类威胁最为严重。其致病因素复杂多样,既受病原体不断变异、人群免疫水平不同等生物因素影响,又与气候变化、空气污染等自然因素、工作与生活环境等社会因素息息相关。近年来,SARS、甲型H1N1亚型流感、H7N9亚型禽流感、中东呼吸综合征等新发呼吸道传染病对社会安定、经济建设和人民健康带来重大影响,如何能早期预警并及时控制新发突发传染病疫情,成为世界各国重点研究的主要公共卫生问题。多个国家建立了不同类型的呼吸道传染病监测系统以应对呼吸道重大传染病疫情,我国也于1981年加入全球流感监测网络,并陆续建立了流感和呼吸道症候群等监测系统。但人们更多关注的是H5N1、H7N9等新发病原体,更注重的是儿童、老年人、住院病人等群体的监测工作,青年人群、门诊病人的病毒感染率及主要病原体报道不多。相比于普通人群,军队人员以18-45岁中青年为主体,具有集中居住、共同训练、身心压力大、人员流动性强等特点,尤为利于急性呼吸道传染病的发生、传播和流行。2010年以来传染病数据分析表明:我军传染病暴发疫情中呼吸道传染病超过虫媒传染病和肠道传染病,跃居第一位,呼吸道传染病中尤以病毒性病原体感染最为突出,发生多起大规模暴发疫情,对部队官兵身心健康构成严重威胁,极大影响部队战斗力,同时也敲响了生物安全的警钟。呼吸道传染病的防控,除了继续做好增强群体免疫力及切断传播途径以外,更为重要的是早发现、早诊断和早预警,变被动处置为主动防控,将疫情控制在萌芽状态。而事实上,尽管多个地区开展了流感监测和呼吸道症候群监测工作,但因人群特点不同、关注点不一等原因对部队传染病防控工作缺乏针对性指导意义,个别部队虽然开展了相关监测工作,但监测时间短、范围小、不成规模,达不到预警的目的。为此,军队有必要开展全时、全域监测,通过日常监测工作,逐步提高全军急性呼吸道病原检测与监测能力,从而实现军队急性呼吸道传染病预测预警和疫情有效控制,同时通过加强新发传染病的发现与鉴定能力,全面加强我军生防能力建设。本研究依托我军于2013年初建立的“军队急性呼吸道传染病病原监测预警体系”,结合日常部队传染病病原监测工作,通过实验室检测及流行病学调查,选择济南军区部队开展呼吸道传染病病原谱及病原变异规律研究。研究目的本研究拟实现以下目的:一是了解流行季节济南军区部队急性呼吸道传染病病毒性病原体的病原谱构成,揭示主要致病病原体和重点发病人群,探明疫情流行趋势及其流行病学特征。二是对部队高发、多发且危害较大的腺病毒进行深入分析,探索其在济南军区流行和变异规律,为其防控和诊治提供病原学参考和流行病学理论支撑。三是研究分析部队病原监测系统运行中存在的问题,为进一步提升军队传染病病原监测能力提供参考依据,最终实现部队传染病疫情的早期预警与有效防控。研究方法1.2014年以来依托全军急性呼吸道传染病病原监测预警体系,建立济南军区部队呼吸道病原监测体系,共设置1个参比实验室、6个网络实验室和33个监测哨点。通过制定监测工作管理程序与规范、操作技术培训、现场督导检查以及实验室质控考评等方式进行监测质量控制。2.收集监测哨点及网络实验室所在医院门急诊及住院急性呼吸道感染病例的鼻/咽拭子样本和基本信息。运用RT-PCR方法对样本进行甲型流感病毒、乙型流感病毒、人腺病毒、人冠状病毒、人呼吸道合胞病毒和人副流感等6种病毒检测。采用描述性流行病学分析方法,对病例基本信息和病原体检测结果进行统计分析。3.收集腺病毒7型阳性样本进行A549细胞培养,分离鉴定毒株。对培养分离成功的21株人腺病毒Hexon基因进行全序列测定,与GenBank已知序列进行比对并进行变异进化分析。4.总结分析部队急性呼吸道传染病病原监测系统存在的问题,探讨未来该类工作策略与方法。研究结果1.基本情况2014年3月至2016年12月,共收到883例鼻/咽拭子样本,其中病毒阳性样本285例,阳性检出率为32.28%。检出2种及2种以上病毒混合感染样本7例,检出率为0.79%。2014-2016年各年样本数(病毒阳性检出率)分别为290例(24.83%)、301例(26.91%)和292例(45.21%)。流感病毒阳性检出率为20.87%,其中甲型流感病毒(未分型)、pH1N1、季节性H3N2、乙型流感病毒检出率分别为5.10%、5.21%、4.53%、5.89%。腺病毒7型、腺病毒55型、冠状病毒OC43型、冠状病毒NL63型、副流感病毒3型检出率分别为6.46%、3.40%、1.59%、0.11%、0.79%。与同期山东省流感监测数据相比,腺病毒和流感病毒检出率较高,其他病毒检出率低于地方报道。2.流行病学特点急性呼吸道感染发病高峰一般为12月至翌年2月,但青岛地区沿海部队发病流行时间可达4月底。从不同发病单位看,新兵训练单位和集训机构流感病毒检出率为22.89%(76/332),其他单位流感病毒检出率为19.42%(107/551),特别是腺病毒感染全部发生在新兵训练单位和集训机构。在不同人群中,义务兵是主要发病群体,占全部病例的63.39%,但对病例按不同职别统计分析显示,干部和战士比较、男军人和女军人比较,病毒检出率均无统计学差异。急性呼吸道感染病例出现的症状中,发热和咳嗽分别占100%、80.94%。流感病毒感染病例中出现头痛、乏力的全身症状分别为63.35%、76.44%;腺病毒感染病例中93.46%出现39.5℃以上高热,57.47%病例存在咽喉痛,且腹痛腹泻较为突出。3.病原谱构成2014-2016年济南军区急性呼吸道传染病病原监测显示:主要病原体分布与全国流感监测通报数据大体一致,但各年度间病原谱变化较大。2014年仅有甲型流感病毒、腺病毒55型和腺病毒7型检出,分别占全部检出病原体的38.64%、30.09%和27.27%,7型腺病毒首次在青岛地区检出。2015年检出以流感病毒为主的5种病毒7个亚型,甲型流感病毒构成比达到了63.89%,其中季节性H3N2、pH1N1、甲型流感(未分型)分别占30.56%、25.00%、8.33%,而乙型流感病毒占5.56%。冠状病毒OC43型和NL63型分别占19.44%、1.38%,冠状病毒OC43型合并副流感病毒3型感染占9.72%。2016年济南军区流感病毒仍为检出率最高的病原体,占全部检出病原体的75.91%,而乙型流感病毒成为优势流行株,占总检出病原体的35.04%,占全部流感病毒46.15%。季节性H3N2和pH1N1分别占16.79%、20.44%,二者在不同时间内交替优势检出。腺病毒7型和甲流未分型分别占24.09%、3.65%。综合三年监测结果,流感病毒和腺病毒二者占全部病原体的94.74%,为济南军区主要呼吸道病原体。流感病毒流行集中在1月-2月,以散发为主。腺病毒感染好发于入冬和冬春交际(12月、3月),聚集性发病特征明显,且均发生在新兵训练单位和集训机构。4.人腺病毒7型分离株Hexon基因序列分析本研究中共成功分离人腺病毒21株,均为B1亚组7型,Hexon基因由2805bp核苷酸组成,序列分析表明:21株分离株序列同源性为99.9%~100%,与0901HZ_ShX_CHN_2009山西分离株、CHN_DG01_2011_7P7H7F7东莞分离株及CQ1198分离株等国内分离株同源性也超过99.9%。792C-T、1818C-T和2739C-T三个位点突变均为沉默突变,其中792C-T和1818C-T为2000年以后腺病毒7型分离株均存在的变异,2739C-T为此次青岛分离株所特有的变异。研究结论1.初步明确了济南军区急性呼吸道传染病病原谱及流行病学特征2014-2016年济南军区急性呼吸道感染病例病毒阳性检出率为32.28%,病原谱主要由甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、冠状病毒、副流感病毒等5种病毒9个亚型构成,其中流感病毒和腺病毒是两种最主要的病原体。急性呼吸道感染发病高峰为12月至翌年2月,新兵训练单位及集训机构暴发疫情风险高于其他单位,新兵及义务兵是高发人群。急性呼吸道感染临床表现以发热、咳嗽为主,流感病毒感染多伴有头痛、乏力等全身症状;腺病毒感染多伴有咽喉痛、腹痛腹泻等症状。2.初步揭示了济南军区部队腺病毒7型疫情的流行病学及病毒变异特征2014-2016年,该部发生聚集性腺病毒疫情2起,其中1起腺病毒55型感染,1起腺病毒7型感染,是山东地区部队首次腺病毒7型暴发疫情。分离获得腺病毒7型毒株21株,与其他报道毒株同源性高达99.9%。虽然其变异水平较低,但仍需要持续加强监测,分析其变异进化规律,为疫苗和药物研究提供数据支持。3.军队病原监测网络在传染病疫情早期预警和快速应对等方面发挥了重要作用。下一步通过健全相关法规与制度、日益完善相关监督机制、加强行政管理将进一步提升我军传染病疫情早发现和早处置的能力以及生物安全防御的水平。
[Abstract]:In recent years , SARS , influenza A ( H1N1 ) subtype influenza , influenza A ( H1N1 ) subtype avian influenza , Middle East respiratory syndrome ( SARS ) and other natural factors , such as influenza , Middle East respiratory syndrome ( SARS ) , have become the main public health problems . In order to provide reference for the prevention and treatment of infectious diseases caused by acute respiratory tract infectious diseases in Jinan Military Region , we study the epidemic trend and epidemic situation of acute respiratory tract infectious diseases in Jinan Military Area .

【学位授予单位】：中国人民解放军军事医学科学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R824

【参考文献】