南宁市朝阳溪污水中诺如病毒检测及其基因型分布

发布时间：2018-04-27 06:05

  本文选题：污水 + 诺如病毒　； 参考：《中国热带医学》2017年04期

【摘要】：目的了解南宁市朝阳溪污水中诺如病毒(Norovirus,NV)污染状况及其基因分布。方法应用实时荧光逆转录-聚合酶链(Realtime RT-PCR)方法对2011年采集的72份朝阳溪污水进行NV检测,阳性标本进行基因克隆和序列测定,并进行亲缘关系分析。结果 72份污水均能检出NV,基因Ⅰ组(GenogroupⅠ,GⅠ)NV、基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ)NV阳性率分别为70.83%和100.00%。经亲缘关系树分析发现,测序成功的239株阳性克隆,共包含有16种不同亚型的NV,GⅠ(GⅠ.1、GⅠ.3、GⅠ.4、GⅠ.6、GⅠ.9、GⅠ.10、GⅠ.13、GⅠ.14、)、GⅡ(GⅡ.1、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.5、GⅡ.6、GⅡ.12、GⅡ.14)各8种。污水中GⅠ和GⅡNV代表株与广西急性腹泻病例的各亚型代表株的亲缘关系密切。在污水中还检测到37株在广西腹泻病例中未检测到的基因亚型NV,占总NV检出株数的15.48%(37/239),其中GⅠ有6个亚型、GⅡ有2个亚型。NV各亚型中检出比例最高的是GⅡ.14,占31.80%(76/239)、GⅠ.4次之,占18.83%(45/239)。在污水中同时检出GⅡ.4 2006年变异株与2010年变异株。结论污水监测能从侧面反映有多个基因亚型NV在南宁市人群中流行,但一些基因亚型的NV可能以隐性感染为主。
[Abstract]:Objective to investigate the pollution of Norovirus NVV and its gene distribution in the sewage of Chaoyang River in Nanning City. Methods NV was detected by real-time fluorescence reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT PCR) in 72 samples of Chaoyang stream sewage collected in 2011. The positive samples were cloned and sequenced. Results NVN could be detected in 72 samples of sewage. The positive rates of NV in GenogGroup 鈪，

本文编号：1809500