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PAHs-Cr(Ⅵ)修复潜力菌多样性调研及功能菌特性研究

发布时间:2022-02-11 19:13
  重金属和有机污染物复合污染是复合污染中最常见的类型之一,铬(此指Cr(Ⅵ))和多环芳烃(PAHs)均具有致畸、致癌、致突变作用,它们的复合污染对环境、动植物产生更严重的危害。细菌作为环境中最丰富的群体,在污染修复方面具有极大的优势,获得高效稳定的修复菌是微生物修复的关键。测序技术的革新为生物信息学的深入研究提供了技术支持,基因组和宏基因组数据库信息随之持续增长。本研究以功能基因rhd和chrA作为标记物,通过基因挖掘法分析PAHs-Cr(Ⅵ)修复潜力菌多样性和环境中此类功能基因分布,并以基因挖掘法为指引,通过相应功能验证,获得PAHs-Cr(Ⅵ)修复菌,进而表征菌株的修复能力并对其进行优化,最后,从转录水平出发,初步探究PAHs和Cr(Ⅵ)对相关基因表达的影响。本研究得到的主要结论如下:(1)通过基因挖掘,截至2017年,从IMG/M数据库中,共得到1196个基因组同时携带rhd和chrA基因,它们分布于13个菌门、20个菌纲、58个菌目、123个菌科、401个菌属和1164个菌种,其中以变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actino... 

【文章来源】:浙江大学浙江省211工程院校985工程院校教育部直属院校

【文章页数】:92 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

PAHs-Cr(Ⅵ)修复潜力菌多样性调研及功能菌特性研究


图1.5细菌Cr(VI)抵抗机制[46]??Fig?1.5?Bacterial?resistant?mechanisms?of?Cr(VI)1461??粒上都有存在,在同一操纵子中,通常有其他功能基因分布在c/;r/(两侧,如图??

操纵子,主要部分,情况


Cr04J-???S04J-??\J\J??图1.5细菌Cr(VI)抵抗机制[46]??Fig?1.5?Bacterial?resistant?mechanisms?of?Cr(VI)1461??粒上都有存在,在同一操纵子中,通常有其他功能基因分布在c/;r/(两侧,如图??1.6,侧翼基因的功能目前没有完全确定,例如,c/?M虽在Mr操纵子中很常见,??在不同的菌中作用不同,在(9c/?ra6ac?rww的Y/c/?5bv?11中,它调控Cr(?VI)敏感性,??并且只对有?Cr(VI)特异性,但在?C?/7r/av/i/wswe/o///c/HraAM■中可以被?Cr(III)、Cr(VI)??和硫酸盐激活;c/zH:和可能参与调控菌株的Cr(VI)耐受能力,在C.??/^/(^///(^?^^?AE126中,这两个基因的缺失使菌株耐受能力下降,但在(9.?^v7/c/??5bvll,它们与铬耐受能力并无相关性[1|1。??chrB2?chrA2?chrF2??C.?metallidurans?CH34???chrl?chrBI?chrAl?chrC?chrE?chrFl??C.?ntelalluhirans?pMOL28??tnpR?chrB?chrA?chrC?chrF?tnpA??O.?trilici?5bvl?I?-<^ ̄ ̄h ̄W^??图1.6c/^操纵子主要部分的基因组成情况f11]??Fig?1.6?Gene?arrangements?of?chr?operons1111??ChrA蛋白可按照长度分为长链和短链ChrA蛋白

热点,菌属,潜力,菌种


图2.1?PAHs-Cr(VI)修复潜力菌各个菌属r//d基因、c/zd基因和菌种数量热点图??(9t?Burkholderia,?Pseudomonas,?Acinetobacter)??Fig?2.1?Heat?map?of?rhd,?chrA,?and?species7?numbers?in?each?potential??duo-functional?genera??(Excluding?Burkholderia,?Pseudomonas,?Acinetobacter)??22??

【参考文献】:
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[4]我国土壤和大气中多环芳烃分布特征和大尺度数值模拟[D]. 马万里.哈尔滨工业大学 2010
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硕士论文
[1]中国多环芳烃排放清单[D]. 穆玺龙.中国石油大学(北京) 2016
[2]Massilia sp.WF1对菲的降解特性研究[D]. 罗小艳.浙江大学 2015



本文编号:3620809

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