苹果组蛋白脱乙酰化酶基因HDA19的生物信息学分析与胁迫响应研究

发布时间：2017-10-14 09:11

  本文关键词：苹果组蛋白脱乙酰化酶基因HDA19的生物信息学分析与胁迫响应研究

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【摘要】：从‘嘎拉’苹果中克隆了MdHDA19(MDP0000132078)基因。它编码1个脱乙酰化酶,该基因ORF为1494bp,编码497个氨基酸,预测其蛋白质分子量为55.73kD,等电点为4.98。进化树分析表明,HDA19在不同物种间的氨基酸序列保守性较高,其中苹果MdHDA19与可可树TcHDA19亲缘关系最近(87.05%)。MdHDA19表达模式分析显示,其在苹果各个器官中均有表达,尤其在根和花中表达量较高。MdHDA19与苹果中MdSAT18互作,MdHDA19受到盐胁迫诱导,可能参与盐胁迫的调控。MdHDA19表达受低温(4℃)和高温(40℃)诱导,说明MdHDA19可能参与调控苹果对温度胁迫的响应。并用原核诱导的方法在体外表达了MdHDA19蛋白。
【作者单位】： 山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;
【关键词】： 苹果 脱乙酰化酶 MdHDA 盐胁迫 温度 原核表达
【基金】：国家重点基础研究发展计划(‘973’计划)项目(2013CB945103) 国家自然科学基金项目(31272142,31471854) 教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT15R42)
【分类号】：S661.1
【正文快照】： 组蛋白是真核生物染色体的基本结构蛋白,它可以稳定DNA双链,并且通过翻译后修饰调控基因的转录活性(Liu et al.,2014)。组蛋白乙酰化是组蛋白的一种翻译后修饰形式。组蛋白被乙酰基团修饰后可以打开染色质结构,使染色质从一个关闭的异染色质状态转变为常染色质状态,从而使RNA，

本文编号：1030198