氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中D-山梨醇脱氢酶关键基因的表达分析

发布时间：2017-10-20 16:12

  本文关键词：氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中D-山梨醇脱氢酶关键基因的表达分析

  更多相关文章： 转录组测序 维生素C L-山梨糖 sldh基因簇

【摘要】：G.oxydans WSH-003能够高效地将D-山梨醇氧化为L-山梨糖,是工业VC生产的重要菌株。全基因组测序显示,该菌中存在3种不同的D-山梨醇脱氢酶基因簇(sldh),但这3种基因簇在菌株氧化D-山梨醇过程中的表达情况还未确定。WYLY HX,首先利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)软件在线比对,确定了3种酶,分别为一种FAD(flavin adenine dinucleotide)辅酶依赖的山梨醇脱氢酶(FAD-SLDH)和两种不同的PQQ(pyrroloquinoline quinone)依赖的山梨醇脱氢酶(PQQ-SLDH)。然后,利用新一代高通量转录组测序技术,对发酵过程5个时期(4、8、12、20 h和40 h)的菌体分别进行转录组测序(RNA-Seq)。结果表明,基因座位为O1G_RS0104395/O1G_RS0104400的sld AB2基因在5个时期的转录水平FPKM(Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)值均很低,而基因座位为O1G_RS0105425/O1G_RS0105430的sld AB1和基因座位为O1G_RS0106820/O1G_RS0106825/O1G_RS0106830的sld SLC基因的FPKM值较高,且都随着D-山梨醇的快速氧化而逐渐增大。研究结果表明,sld AB1和sld SLC基因为氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中主要表达的D-山梨醇脱氢酶基因。本研究成果为菌株中D-山梨醇脱氢酶的后续研发提供了方向。
【作者单位】： 江南大学工业生物技术教育部重点实验室;江南大学生物工程学院;
【关键词】： 转录组测序 维生素C L-山梨糖 sldh基因簇
【基金】：国家863计划项目(2012AA022103)
【分类号】：Q78;Q936
【正文快照】： 214122)氧化葡萄糖酸杆菌(Gluconobacter oxydans)是一种严格需氧的革兰氏阴性菌,属于醋酸杆菌科,该类细菌主要栖息于高糖环境,如花卉与水果中[1]。G.oxydans的细胞膜上含有大量的脱氢酶,可以快速不完全地氧化糖、糖酸和糖醇[2]。因此,G.oxydans被广泛用于工业生产食品相关的

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前9条

1 王端好;赵彭花;薛小波;蒋德富;张小里;;甘油诱导氧化葡萄糖酸杆菌山梨醇脱氢酶[J];精细化工;2009年01期

2 任秋萍;周淑梅;王秀玲;;苹果山梨醇脱氢酶的基因表达、组织分布和活性调控[J];中国细胞生物学学报;2010年04期

3 陈微微;袁红杰;熊向华;汪建华;马秀灵;张惟材;;山梨醇脱氢酶的克隆、表达及活性检测[J];生物技术通讯;2011年02期

4 王艇;;山梨醇脱氢酶作用机制及其与滞育的关系[J];安徽农学通报(上半月刊);2012年15期

5 丁寅寅;左芳雷;卢晓明;赵建云;王欧;陈尚武;;副干酪乳杆菌6-磷酸山梨醇脱氢酶(gutF)基因的克隆和超表达[J];中国奶牛;2010年08期

6 赵楠;熊向华;葛欣;汪建华;夏焕章;张惟材;;酮古龙酸菌山梨醇脱氢酶的原核表达及活性检测[J];生物技术通讯;2013年06期

7 陈启伟,刘广发,邱凤英;6-磷酸山梨醇脱氢酶(gutD)基因克隆、测序和表达[J];台湾海峡;2004年03期

8 ;酶和发酵工程[J];生物技术通报;1989年06期

9 ;[J];;年期

，

本文编号：1068105