龙骨马尾杉PcHDR1基因克隆及序列分析

发布时间：2017-10-20 17:02

  本文关键词：龙骨马尾杉PcHDR1基因克隆及序列分析

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【摘要】：该研究采用RT-PCR方法对龙骨马尾杉Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching 1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-焦磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase,HDR]基因Pc HDR1的编码区进行克隆并利用生物信息学方法进行序列分析。根据实验室已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码HDR的转录本,采用RT-PCR方法获得该基因的全长c DNA序列,所克隆的Pc HDR1基因编码区长为1 437 bp,编码478个氨基酸残基,Gen Bank登录号为JQ957845。Pc HDR1与银杏Ginkgo biloba的HDR序列同源性最高,达78%。生物信息学预测Pc HDR1蛋白没有跨膜区,具有Lyt B保守结构域,不含信号肽。该研究克隆并获得了龙骨马尾杉Pc HDR1基因的编码区序列,并对其编码的蛋白进行了序列分析及结构域预测,为进一步研究HDR的功能奠定基础。
【作者单位】： 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室;长江大学园艺园林学院;
【关键词】： -羟基--甲基--(E)-丁烯基--焦磷酸还原酶 龙骨马尾杉 萜类生物合成
【基金】：国家自然科学基金项目(30900113) 教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT1150)
【分类号】：S567.239
【正文快照】： 2.长江大学园艺园林学院,湖北荆州434025)龙骨马尾杉Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching是石杉科马尾杉属的代表物种[1]。龙骨马尾杉中含有石松生物碱(lycopodium alkaloids)、萜类(triterpenes)、有机酸(phenolic acids)和黄酮(fla-vones)等多种成分[2-3],全草入药,具有重要

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1 张鑫;罗红梅;殷秀梅;宋经元;;龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析[A];中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会论文集[C];2012年

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本文编号：1068300