水分胁迫下小麦TaWSI18基因的电子克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-10-21 12:07

  本文关键词：水分胁迫下小麦TaWSI18基因的电子克隆及生物信息学分析

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【摘要】：利用电子克隆和RT-PCR技术,从干旱胁迫的小麦叶片中分离出4条新的具有高度同源性的WSI18基因,即TaWSI18-1、TaWSI18-2、TaWSI18-3和TaWSI18-4(Gene Bank登陆号分别为:KP226849、KP226850、KP226851和KP226852);其开放阅读框均为678 bp,编码225个氨基酸。生物信息学分析表明,该类蛋白具有亲水性,存在多个磷酸化位点,无信号肽结构域及剪切位点,定位于细胞质中,无跨膜结构域;二级结构分析表明,该蛋白α螺旋和无规则卷曲的比例达到90%以上;同源性比较及聚类分析表明,小麦TaWSI18蛋白同无芒雀麦(Bromus inermis,BAN15016)WSI18蛋白和二穗短柄草(Brachypodium distachyon,XP 003569641)LEA3蛋白具有高度的同源性,相似性分别为94%和70%。小麦TaWSI18基因编码蛋白的氨基酸序列的N端存在与LEA蛋白的N端区域高度保守的序列。表明小麦TaWSI18蛋白的性质与LEA3蛋白的相似,说明了小麦的TaWSI18蛋白可能与LEA3蛋白存在相同或相似的功能,为进一步研究其在小麦水分胁迫下的功能奠定基础。
【作者单位】： 西北农林科技大学生命科学学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室;
【关键词】： 小麦 水分胁迫 TaWSI基因 电子克隆 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31071349) 高等学校博士学科点专项基金(20120204110033)
【分类号】：S512.1
【正文快照】： 小麦是我国主要的粮食作物,非生物胁迫会导致细胞缺水,影响植物的生长发育,诱导多种基因表达[1],产生一系列重要的功能蛋白和调控蛋白,减轻水分胁迫对作物的损害。调控蛋白如转录因子、蛋白激酶等参与信号转导和基因表达调控,调节细胞的新陈代谢、转录并对各种刺激产生应答反，

本文编号：1073249