模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达

发布时间：2017-10-21 23:22

  本文关键词：模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达

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【摘要】：【目的】研究炎性环境下强直性脊柱炎(AS)患者间充质干细胞(MSC)中的全基因组表达谱基因的表达情况。【方法】首先从AS患者骨髓腔中分离培养MSC并利用流式技术鉴定细胞特定表型;然后利用TNF-α(10 ng/m L)和IFN-γ(10 ng/m L)刺激模拟炎症环境;接着分别提取不同条件刺激下AS患者和正常人MSC中RNA并进行RNA质控;然后行全基因组基因芯片分析,并应用GO分析法和KEGGPathway分析法分析其中的差异表达基因和寻找相关信号通路;最后利用q RT-PCR方法验证上述基因芯片中筛选出的关键差异表达基因真实性。【结果】全基因组基因芯片分析结果显示炎性模拟环境培养下AS-MSC中差异表达基因数量明显增加,GO分析结果显示这些差异表达基因中,56.1%与生物学活动相关,28.99%与分子功能相关,14.91%与细胞构成相关。Kegg-Pathway分析结果显示这些差异表达基因主要与TLR信号通路和MAPK信号通路这两条通路密切相关,其中TLR信号通路包含8个差异表达基因,MAPK信号通路包含14个差异表达基因。q RT-PCR验证结果显示基因表达与基因芯片结果符合。【结论】炎性模拟环境下,AS-MSC中的差异表达基因数量明显增加,并且这些差异表达基因主要以TLR信号通路和MAPK信号通路为主。
【作者单位】： 中山大学孙逸仙纪念医院骨科;中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;
【关键词】： 强直性脊柱炎 间充质干细胞 全基因组表达谱芯片
【基金】：国家自然科学基金(81672128,81672097,81271951和8140185) 广东省高校强直性脊柱炎综合诊治工程技术中心项目(GCZX-A1301) 广东省科技计划项目(2015B020228001,2015B090903059)
【分类号】：R593.23
【正文快照】： 强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS),是一种常见的自身免疫性疾病,目前发病机制不明,以炎性后背痛和病理性成骨为特点,预后较差,在民间又有“不死的癌症”之称,至今无有效的方法可以延缓疾病的发生发展和改善临床最终预后[1-2]。间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC

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