西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

发布时间：2017-10-23 11:48

本文关键词：西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

【摘要】：利用生物信息学方法,在西瓜测序基因组97103中共鉴定出96个bHLH家族成员,其中有94个可以被定位到西瓜的11条染色体上。通过基因结构和结构域序列保守性的预测,发现这些基因的序列长度和内含子数量变化很大,但bHLH结构域序列比较保守。用拟南芥中39条已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96条bHLH蛋白序列构建系统发育树,结果显示西瓜的bHLH家族可以进一步被分为11个亚族。运用荧光定量实时PCR技术,分析了该家族中21个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平,结果表明,8个基因受低温胁迫诱导表达,13个基因受ABA胁迫诱导表达,14个基因受盐胁迫诱导表达。ClabHLH41在3种胁迫下表达量均显著增加,说明其在低温、ABA和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用。
【作者单位】：西北农林科技大学园艺学院;
【关键词】：西瓜 bHLH 全基因组鉴定 胁迫响应 基因表达
【基金】：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26-18)
【分类号】：S651
【正文快照】： b HLH(basic Helix-Loop-Helix,碱性螺旋环螺旋)转录因子家族普遍存在于真核生物中,因其含有螺旋环螺旋(Helix-Loop-Helix,HLH)结构而被命名。b HLH保守结构域约含有60个氨基酸,其N端为富含碱性氨基酸的DNA结合区,C端为α螺旋1 环 α螺旋(Ma et al.,1994)。第1个b H

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