沙冬青AmCIP基因结构及其内含子生物信息学分析

发布时间：2017-10-24 05:26

  本文关键词：沙冬青AmCIP基因结构及其内含子生物信息学分析

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【摘要】：旨在分析沙冬青Am CIP基因DNA序列结构特性及功能。以沙冬青Am CIP基因的c DNA序列设计引物,采用PCR扩增其DNA序列,并利用生物信息学方法分析基因的结构。序列分析表明,沙冬青Am CIP基因DNA序列长1 548 bp,包含2个外显子和1个内含子,Gen Bank登录号KU744005。在该基因的ORF内存在一个78 bp的内含子序列,同时内含子序列中含有参与厌氧诱导的类增强子元件(GC-motif)和光响应元件(TCCC-motif),3'-UTR区域含有多个参与光响应、胁迫响应和激素响应等相关的顺式作用元件,而5'-UTR区域只含有赤霉素响应元件(GARE-motif),这些元件可能对Am CIP基因转录表达起调控作用。此外,该基因具有较高的A+T碱基含量(64.7%),Am CIP的内含子不具有GT-AG规则的保守序列,即内含子5'碱基是GT,3'碱基是TG,推测Am CIP的m RNA具有独特的剪切机制。
【作者单位】： 北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室;
【关键词】： 沙冬青 脱水素基因AmCIP 外显子 内含子 生物信息学分析
【基金】：国家自然科学基金项目(31270737) 高等学校学科创新引智计划资助项目(B13007) 长江学者和创新团队发展计划资助项目(IRT13047) 北京市自然科学基金项目(6112016)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryonic abund-ant,简称LEA)与种子抵抗脱水有关,它伴随种子的成熟过程产生,大量积累于种子成熟后期特定阶段,在种子萌发后很快消失[1]。研究发现,LEA蛋白在种子干旱中积累,以及在干旱、低温、高温或盐胁迫等逆境导致的缺水情况下,在植物组织或生

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本文编号：1087252