番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析

发布时间：2017-10-26 08:39

  本文关键词：番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析

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【摘要】：AT-hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄AT-hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析。结果表明,番茄AT-hook家族包含32个成员,分为3种类型,其中类型Ⅰ含有13个成员;遗传进化分析表明番茄AT-hook基因成员与拟南芥家族基因具有相似分类。利用实时荧光定量PCR对番茄32个基因开展组织表达分析,结果表明AT-hook基因具有表达差异,主要在根和花中表达较高。氧化胁迫分析结果表明,32个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,很可能参与了番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为番茄AT-hook家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析番茄AT-hook基因的功能奠定基础。
【作者单位】： 暨南大学生命科学技术学院;广东省农业科学院蔬菜研究所;广东省蔬菜新技术研究重点实验室;
【关键词】： 番茄 AT-HOOK基因家族 生物信息学 基因表达 氧化胁迫
【基金】：国家自然科学基金项目(31301776) 广东省省级科技计划项目(2014A020208044、2015A030302040、2015B090906012) 农业部现代产业体系项目(CARS-25-G-36) 广东省对外科技合作项目(2013B050800012) 广东省科技厅条件建设项目(粤财教[2013]112号)
【分类号】：S641.2
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1524.016.htmlAT-hook是一种新的DNA结合蛋白基序,普遍存在于细菌、真菌、哺乳动物和植物的DNA结合蛋白中,是以精氨酸-甘氨酸-精氨酸-脯氨酸(RGRP)4个残基为中心保守基序[1],这个短的保守氨基酸序列对AT-hook蛋白结合

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【相似文献】

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本文编号：1097917