莲瓣兰花朵转录组及MADS基因家族挖掘

发布时间：2017-10-26 20:42

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【摘要】：莲瓣兰是我国珍贵的兰花野生资源,具有很高的观赏价值,然而其相关的分子生物学研究尚属空白。为揭示莲瓣兰花朵形成的分子机制,应用高通量测序技术对莲瓣兰花朵进行转录组分析。原始数据经过生物信息学分析后,共获得57 011条Unigene;所获得的Unigene与Nr,Swiss-prot,COG和KEGG等数据库进行搜索比对后,发现Unigene的注释总量为24 049条,约32 962条Unigene没获得注释,这些没获得注释Unigene基因可被认为是莲瓣兰新的转录本和特异基因。36条CDS基因被注释为MADS-box基因,构建系统进化树后并对31条MADS-box基因进行了聚类,其中23条为与花型发育相关的ABCDE类基因,8条为与开花时间相关的MADS基因,同时发现PI、AP3和AGL6基因表达量较高,该试验为研究兰属的花发育以及开花机理的研究提供一定的理论依据。
【作者单位】： 云南农业大学;云南省建水县农业技术推广所;云南省会泽县种子管理站;
【关键词】： 莲瓣兰 花朵 转录组 生物信息
【基金】：国家自然科学基金项目(31460528)资助
【分类号】：S682.31
【正文快照】： *通讯作者,hefengmei918@126.comFloral Transcriptome Sequencing and Characteristic Analysis of CymbidiumtortisepalumXiao Jingyi1Zhu Yongping1Jiang Zhou1Jia Rong1Wu Linxian1Yu Kun2Xu Yufeng3ZhangYinghua1He Fengmei1*1 Yunnan Agricultural University,Kunming,6

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本文编号：1100391