2504例汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多态性研究
本文关键词:2504例汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多态性研究
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【摘要】:目的分析2 504例汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多态性及分布特征。方法采用基于Illumina Miseq二代测序技术,对岳阳地区2 504例汉族造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、C、DRB1和DQB1基因进行高分辨分型,采用Py Pop软件计算等位基因频率、单体型频率核对连锁不平衡参数。结果 HLA-Ⅰ类基因中,A、B和C基因座分别检出55、117和67个等位基因,其中频率0.05常见等位基因为A*11:01:01:01、A*24:02:01:01、A*02:07:01、A*02:01:01:01、A*33:03:01,B*40:01:02、B*58:01:01、B*15:02:01、B*13:01:01、B*46:01:01、C*03:03:01、C*03:02:02:01、C*08:01:01、C*03:04:01:02、C*07:02:01:01、C*01:02:01;HLA-Ⅱ类基因中,共检出50个DRB1和26个DQB1等位基因,频率0.05常见等位基因见于DRB1*11:01:01、DRB1*08:03:02、DRB1*12:02:01、DRB1*15:01、DRB1*09:01:02,DQB1*03:01:01、DQB1*03:02:01、DQB1*03:03:02、DQB1*05:02:01、DQB1*06:01:01。HLA-A、B、C、DRB1和DQB1位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。任意2个HLA基因间均具有强的连锁不平衡,其中频率≥0.01有统计学意义的单体型有196条。结论获得了岳阳地区汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因频率数据,为人类学、移植配型、疾病相关性等研究提供了参考数据。
【作者单位】: 岳阳市中心血站;
【关键词】: HLA抗原 HLA高分辨等位基因 基因频率 多态性
【分类号】:R394
【正文快照】: 人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因系统根据编码分子的分布与功能不同,分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3大类,HLA-A、B、C属于Ⅰ类基因,HLA-DRB1、DQB1属于Ⅱ类基因。HLA-A、B、DRB1基因是早期研究的与造血干细胞移植密切相关的3个功能基因,随着非血缘造血干细胞移植的增加,HLA
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本文编号:1100439
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