北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析

发布时间：2017-10-29 03:35

  本文关键词：北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析

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【摘要】：为了解肠病毒D68(EV-D68)在北京、上海地区严重急性呼吸道感染(SARI)儿童中的流行情况和分子特征。本研究采集2008~2010年北京儿童医院SARI儿童呼吸道样品259份,2013~2014年上海复旦大学附属儿科医院SARI儿童呼吸道样品441份,采用套式RT-PCR结合测序方法检测筛选EV-D68阳性样品,设计EV-D68全基因组通用引物,对EV-D68阳性样品进行全基因组扩增,收集NCBI核酸数据库中目前所有的EV-D68全基因组序列进行序列分析,比较EV-D68中国和美国流行株的差异。结果发现:北京地区检测EV-D68阳性样品1例,阳性率为0.4%,上海地区检测EV-D68阳性样品4例,阳性率为0.9%。结合目前中国已上传的所有EV-D68相关序列,分析表明:目前中国地区流行的EV-D68主要属于Clade A2或Clade B2亚型,不同于美国的Clade A1、Clade B1、Clade B4和Clade B5亚型,另外EV-D68部分基因进化分析时出现树形结构冲突现象;上述结果表明目前EVD68在北京、上海地区的SARI儿童群体中的感染率较低(5/700;1%);中国与美国流行的EV-D68毒株属于不同的分支,差异较大,部分序列分析表明EV-D68病毒可能存在组内重组现象。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所应急技术中心;温州医科大学医学病毒学研究所;复旦大学附属儿科医院;首都医科大学北京儿童医院;
【关键词】： 肠病毒D型 严重急性呼吸道感染 流行 基因组 测序
【基金】：十二五国家传染病重大专项(2013ZX1004101,2013ZX1004601,2014ZX1004001)
【分类号】：R725.6;R440
【正文快照】： 2.温州医科大学医学病毒学研究所,温州205035;3.复旦大学附属儿科医院,上海201102;4.首都医科大学北京儿童医院,北京100045)肠道病毒属于小RNA病毒科,肠病毒属,是一种无囊膜的单股正链RNA病毒,目前分为A、B、C、D四组,其中肠病毒D68型(EV-D68)与EV-D70、EV-D94、EV-D111共同属

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本文编号：1111264