机器学习方法在基因功能注释中的应用

发布时间：2017-10-29 15:17

  本文关键词：机器学习方法在基因功能注释中的应用

  更多相关文章： 功能注释 机器学习法 功能预测 基因

【摘要】：目前,基于计算机数学方法对基因的功能注释已成为热点及挑战,其中以机器学习方法应用最为广泛。生物信息学家不断提出有效、快速、准确的机器学习方法用于基因功能的注释,极大促进了生物医学的发展。本文就关于机器学习方法在基因功能注释的应用与进展作一综述。主要介绍几种常用的方法,包括支持向量机、k近邻算法、决策树、随机森林、神经网络、马尔科夫随机场、logistic回归、聚类算法和贝叶斯分类器,并对目前机器学习方法应用于基因功能注释时如何选择数据源、如何改进算法以及如何提高预测性能上进行讨论。
【作者单位】： 宁波大学医学院;
【关键词】： 功能注释 机器学习法 功能预测 基因
【基金】：浙江省自然科学基金项目(No.LQ13C060002) 国家自然科学基金项目(No.81172771;No.31301084) 宁波大学学科项目(No.XKL14D2097和No.XYL14023);宁波大学王宽诚教育基金项目~~
【分类号】：Q811.4
【正文快照】： 浙江省自然科学基金项目(No.LQ13C060002),国家自然科学基金项目(No.81172771,No.31301084),宁波大学学科项目(No.XKL14D2097和No.XYL14023)和宁波大学王宽诚教育基金项目*联系人Tel:0574-87609602;E-mail:liaoqi@nbu.edu.cn;Tel:0574-87600921;E-mail:shenqijun@nbu.edu.cnRe

【相似文献】

中国重要会议论文全文数据库 前2条

1 周国鑫;王霞;娄永根;程家安;;水稻诱导抗虫反应的分子基础[A];中国生态学会2006学术年会论文荟萃[C];2006年

2 葛秀秀;刘克锋;陈洪伟;;一串红的转录组测序与分析[A];2013全国植物生物学大会论文集[C];2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前5条

1 方婷;家蚕特有基因的鉴定、表达模式分析及功能初探[D];西南大学;2010年

2 许三岗;疟原虫分子功能注释二级数据库的构建[D];北京协和医学院;2013年

3 吴浩宇;基于Hadoop的同源性搜索GO功能注释平台的研究[D];南京农业大学;2013年

4 叶非;基于集群环境的三种蛋白质GO功能注释方法的实现[D];华中科技大学;2008年

5 梁远学;椰肉发育过程中差异表达基因的分离和功能注释[D];海南大学;2014年

，

本文编号：1113526